新手上路westernblot问题集合

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时间:2018-12-27

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1、新手上路Westernblot问题集合对于一个新手,试验中会遇到很多问题,我总结了一下常见问题,希望对您有所帮助。  Q1:PVDF膜和硝酸膜结合蛋白的原理是什么?A1:一般而言,硝酸纤维素膜是通过疏水作用来和蛋白质相联,若反复洗几次后,蛋白容易掉下来,效果较差。尼龙膜主要通过它膜上的正电荷和蛋白接合(注:常用的PVDF膜即带正电荷的尼龙膜),同时也有疏水作用,但相对较弱。这样的话,PVDF膜和蛋白接合较牢,不易脱落,效果较好。  Q2:做组织样品的westernblot的时候,处理样品有什么诀窍?A2:必须进行研磨、匀浆、超声处理,蛋白质溶解度会更好,离心要充分,膜蛋白需用更剧烈

2、的方法抽提,低丰度膜蛋白可能还要分步抽提(超速离心)。还有一点就是组织中的蛋白酶活性更强,需要注意抑制蛋白酶的活性(加入PMSF和蛋白酶抑制剂),封闭剂一般5%脱脂奶粉。如果一抗为多克隆抗体,使用BSA也是不错的选择  Q3:免疫组化和Westernblot可以用同一种抗体吗?A3:免疫组化时抗体识别的是未经变性处理的抗原决定簇(又称表位),有些表位是线性的,而有的属于构象型;线性表位不受蛋白变性的影响,天然蛋白和煮后的蛋白都含有;构象型表位由于受蛋白空间结构限制,煮后变性会消失。如果你所用的抗体识别的是蛋白上连续的几个氨基酸,也就是线性表位,那么这种抗体可同时用于免疫组化和Wes

3、ternblotting,而如果抗体识别构象形表位,则只能用于免疫组化。一般抗体说明书上都有注明此种抗体识别的氨基酸区间。(限于单抗)  Q4:不能很好地将大分子量蛋白转移到膜上,转移效率低怎么样解决?A4:可以考虑:转移缓冲液中加入20%甲醇(是指终浓度)(优化的转移缓冲液,可以参考《蛋白质技术手册》),因为甲醇可降低蛋白质洗脱效率,但可增加蛋白质和NC膜的结合能力,甲醇可以防止凝胶变形,甲醇对高分子量蛋白质可延长转移时间;转移缓冲液加入终浓度0.1%SDS,也是为了增加转移效率;用优质的转移膜,或使用小孔径的NC膜(0.2微米);使用戊二醛交联;低浓度胶,如低至6%。太大时还可

4、以考虑用琼脂糖胶;提高转移电压/电流;增加转移时间。    Q5:Westernblot哪种染色好?A5:(1)阴离子染料是最常用的,特别是氨基黑,脱色快,背景低检测极限可达到1.5μg,考马斯亮蓝虽然与氨基黑有相同的灵敏度,但脱色慢,背景高。丽春红S和快绿在检测后容易从蛋白质中除去,以便进行随后的氨基酸分析。缺点是:溶剂系统的甲醇会引起硝化纤维素膜的皱缩或破坏,不能用于带正电荷的膜。灵敏度低。(2)胶体金,灵敏度高,检测范围可到pg级,但染色比较稳定。(3)生物素化灵敏度位于1、2之间,可用于任何一种膜。  Q6:用Western检测基因转染后细胞培养上清中表达的目的蛋白(定性)

5、,分子量为20KD,浓度约为几百ng/ml。蛋白样品是否需浓缩、纯化?如何浓缩、纯化上清液中的目的蛋白?对小分子蛋白Westernblot时需特别注意哪些条件?A6:按照提供的浓度,如果做Westernblot,是不用浓缩样品的.对于20kd的小分子的蛋白,WesternBlot中要注意的是:  1、转移时的时间,  2、转移时的电流或电压.  3、transferbuffer中加20%的甲醇.  4、可以用13-15%的分离胶.  Q7:半干法转移与胶的面积和蛋白分子两大小有一定关系,那么湿法转移是不是所有的转移条件都一样呢?一般的条件是怎样的?A7:半干转的电流大小是按照面积来

6、算的,时间是根据蛋白分子大小定的;而湿转的话电流是恒定的,时间也是根据分子量而定。  Q8:采用生物素标记的二抗-SABC-DAB检测系统做western,非特异性的条带和背景很高,总蛋白考染的时候发现接近积层胶的条带比较清楚,条带也很窄,可是越靠下面的条带越来越宽,有的跑得都连在一起,这是什么原因,如何解决?SDS—PAGE的时候恒压和恒流哪个好?A8:非特异性的条带和背景高:可能性很多,如一抗,二抗,封闭的原因都可能。总蛋白考染的时候发现接近积层胶的条带比较清楚,条带也很窄,可是越靠下面的条带越来越宽,有的跑得都连在一起,这种现象是正常的。另外,也可能积层胶有问题。SDS—PA

7、GE的时候,恒压和恒流都可以用。  Q9:血清样品进行Westernblot分析,目的蛋白21kD,结果显色出来后,目的条带很淡,而白蛋白和IgG条带很浓,为什么?A9:可能是因为白蛋白为67kD和目的蛋白相差较大,且其浓度较低,可以底物二氨基联苯胺和0.01%过氧化氢溶液显色的时间延长为30分钟,再用去离子水漂洗以终止反应;也可能是抗体的特异性不好。把封闭的时间延长,同时提高封闭液的浓度,可以减少以下背景噪音。同时洗的时候要彻底,而目的条带弱,说明浓度不足,如果不考

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