橡胶草种质资源ssr分子标记遗传多样性分析

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1、橡胶草种质资源SSR分子标记遗传多样性分析摘要橡胶草为多年生草本植物，菊科蒲公英属，在我国的新疆、东北、华北及西北等地区都有分布。橡胶草根部含有天然橡胶，是重要的产胶作物，美国和欧盟已将其作为生产天然橡胶的战略作物。橡胶草遗传多样性研究是遗传改良的基础，对橡胶草种质资源的保存和利用具有重要意义。本研究利用基于网上公布的644个橡胶草EST序列，筛选到的33个具有多态性的SSR标记，对来自山西、海南、新疆、甘肃、美国、俄罗斯等共8个不同生态环境的48份材料进行遗传多样性分析。结果如下：（1）SSR标记多态性分析结果显示，标记WJ-5、JJ-27、JJ-28和JJ-3

2、5J的多态性较好，其中JJ-27表现最为突出。（2）48份橡胶草群体间的遗传相似系数（GS），平均值为0.7279，范围在0.2989-1之间，其中A3与A7的遗传相似系数为1，相似度高，可能为姐妹系；B2与B3的遗传相似系数为0.9547，遗传关系较相近；A2与301的遗传相似系数最小（0.2989），说明二者的遗传距离比较远；美国材料间遗传相似系数平均为0.851，且与其它材料遗传差异较大，为单独类群；来自俄罗斯的两个材料（301和302）间遗传相似系数为0.6826，差异较大，其中302与美国材料间遗传关系较近；对照蒲公英（P）和白色蒲公英分属不同类群，遗传

3、关系较远，遗传相似系数为0.6808；美国橡胶草材料和俄罗斯的302材料与做为对照的蒲公英（P）和白色蒲公英（BP）间遗传距离远；俄罗斯的301材料和国内山西、海南、新疆、甘肃、U-2和做为对照的白色（BP）间亲缘关系较近。（3）遗传变异分析和AMOVA分析发现，橡胶草材料地区间，材料间和材料内均对橡胶草的遗传变异产生重要影响，其中材料间对其的影响最大，占40%；其次为材料内变异，占32%；最后为橡胶草材料地区间，占28%。（4）综合橡胶草种质的表型特征和本研究SSR标记分析结果：来源于美国的材料（共21份）和自来俄罗斯的302可能是优良的橡胶草种质。关键词：橡胶

4、草；种质资源；SSR标记；遗传多样性i万方数据华中农业大学2015届专业学位硕士研究生学位论文AbstractTaraxacumKok-saghyzRodin(TKS),Russiandandelion,isakindofasteraceaeperennialherbplants,widelydistributedinthenortheast,northornorthwestofxinjiangregionsofChina.TherootofTaraxacumKok-saghyzRodincontainsnaturalrubber.Asanimportantrub

5、berproducingstrategiccrops,ithasbeengivenwidelyattentionintheUnitedStatedandEurpopeanUnion.TaraxacumKok-saghyzRodindiversityresearchisthebasisofgeneticimprovement,andisofsignificanceforTKSgermplasmresourcesconservationandinnovation.Inthisresearch,combinedwithmorphologicalcharacteristi

6、csresults,thegeneticdiversityofthe48TaraxacumKok-saghyzRodinvarietiesfrom8differentlocationswasanalyzed,using33effectiveSSRmarkerswhichdesignedbasedonthe644ESTsequencesavailableonthenet.Themainresultsthatachievedinthisresearchareshownasfollows:(1)4ofthe33SSRmarkers,WJ-5,JJ-27,JJ-28and

7、JJ-35,areofbetteramplifiedpolymorphismaccordingtotheanalysisresultofSSRamplifiedpolymorphismmarkers,especiallyJJ-27standoutinthe4ofthem.(2)Theaveragevalueofthegeneticsimilaritycoefficientamongthe48TaraxacumKok-saghyzvarietiesis0.7279,thegeneticsimilaritycoefficientbetweenA3andA7is1whi

8、chimp