角膜营养不良家系及先天性白内障家系致病基因的定位与克隆

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1、上海交通大学博士后学位论文角膜营养不良家系及先天性白内障家系致病基因的定位与克隆姓名:高凌寒申请学位级别:博士后专业:生物学指导教师:贺林20071001中文摘要角膜营养不良是一系列与家族遗传有关的原发性、进行性角膜病变总称,具有特定病理组织学特征。先天性白内障是出生时或出生后第一年内发生的晶状体混浊,具有很高的遗传异质性。这两种疾病在临床眼科极为常见,对视力的影响很大,是致盲率很高的遗传病。本课题以一个类斑状角膜营养不良家系和一个先天性缝合状白内障家系为研究对象,从分子遗传学角度入手,采取基因扫描、连锁分析及单体型分析对致病基因进行染色体定位。选取定位区域内的候选基因进行

2、筛查并直接测序,以寻找与疾病发生相关的基因突变。‘通过裂隙灯和共聚焦显微镜检查,发现该角膜营养不良家系中角膜病变类型较为特殊,暂命名为“类斑状”角膜营养不良。全基因组扫描和连锁分析在D13S1270处获得最大LOD值zm越=2.62(如觚=O.O),多点连锁分析在D13S263和D13S1270之间获得最大值5.99,单体型分析将致病基因所在染色体区域定于D13S1248和D13S1312之间,即13q14.11.q14.13长约6.5cM计5.2Mb的范围内。这是一个新的角膜营养不良候选基因所在区域,该区域内目前已报道的基因有49个,选取其中部分基因进行测序,但未发现与疾

3、病发生相关的基因突变。对先天性缝合状白内障家系进行基因扫描和连锁分析,在D3S1279处获得最大LOD值(z一=2.32,舅嗽=O.O),单体型分析将该家系致病基因定位于3q21.1.3q26.2的区域内,对该区域内候选基因念珠状纤维蛋白BSFP2基因进行直接测序,结果显示696.698位核苷酸存在3bp(,SGAA)的缺失,最终导致多肽链233位丢失一个谷氨酸(E233del)。关键词:角膜营养不良,先天性白内障,遗传异质性,连锁分析,单体型分析,突变AbstractCornealdystrophiesarediseasesofthecorneaandrefertoinh

4、erited,progressivecornealopacitieswithcertainhistopathologiecharacters.Cataractsrefertothelossoftransparencyinthelensoftheeyesinchildhoodwithawidevarietyofgenotypicheterogeneity.Cornealdystrophiesandcongenitalcataractsarecommonmajorabnormalitiesoftheeyes,whichcanresultinsignificantvisualim

5、pairmentOrblindness.Inthisstudy,werecruitedapedigreeexhibitedmacular—likecornealdystrophyandapedigreeexhibitedsuturalcongenitalcataract.Geneticanalysiswasperformedtoidentifythegeneticbasisofthedisorders.GenomicDNAwasextractedfromtheperipheralbloodsamplesofmembersofthepedigrees.Agenome—wide

6、scanwasperformedusingmicrosatellitemarkers.LinkageanalysiswascardedoutusingaLinkagesoftwarepackage.HaplotypedatawereprocessedusingCyrillicsoftwaretodefinetheregionofthediseasegene.Mutationssegregatewithdiseaseswerecarriedoutbysequencingcandidategenes.Comealopacityinthepedigreewascharacteri

7、zedmorphologicallybyslit.1ampandinvivoconfocalmicroscopyexaminationandtemporarilyreferredtoasmacular—likecornealdystrophy.Followingagenome—widescanforlinkageanalysis,significantevidencewasobtainedatD13S1270(zm瓤=2.62,曰k=O.O),amaximumLODscore5.99wasobtainedbetwe

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