不同地理株疟原虫裂殖子顶端膜抗原1(ama-1)基因多态性分析

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1、分类号：R183.5学校代码：10392学科专业代码：100401学号：2100305618福建医科大学硕士研究生毕业论文不同地理株疟原虫裂殖子顶端膜抗原1（AMA-1）基因多态性分析StudyongeneticdiversityofplasmodiumAMA-1amongdifferentstrain学位类型：医学硕士所在学院：公共卫生学院研究生：周银发学科、专业：流行病与卫生统计学导师：张山鹰教授研究起止日期：2011年9月至2013年3月答辩日期2013年5月25日二○一三年五月1目录中文摘要.............

2、..............................................1ABSTRACT...........................................................3英文缩略词表.......................................................5前言...............................................................7第一部分不同地理株恶性疟原虫顶端膜抗原1（A

3、MA-1）基因多态性分析.....91材料与方法.....................................................102实验结果.......................................................143讨论...........................................................25第二部分不同地理株间日疟原虫顶端膜抗原1（AMA-1）基因多态性分析....281材料与方法..............

4、.......................................292实验结果.......................................................333讨论...........................................................43结论..............................................................46参考文献............................

5、..............................47附表..............................................................51致谢..............................................................54综述..............................................................552不同地理株疟原虫裂殖子顶端膜抗原1（AMA-1）基因多态性分析中文摘

6、要【目的】研究不同疟疾流行区疟原虫裂殖子顶端膜抗原1（apicalmembraneantigen-1,AMA-1）基因序列特征，了解不同地理株疟原虫AMA-1基因多态性程度及其分布情况，初步探讨产生多态性的原因与机制，为进一步了解疟疾流行特征，制定疟疾防制措施以及疟疾疫苗的研制提供分子基础。【方法】经显微镜检查疟原虫确诊的疟疾病人，征得患者同意后末梢采集滤纸血3滴，干燥后密闭于塑料袋并保存于﹣20℃冰箱中备用，同时详细进行病案记录。采用Na2HPO4提取滤纸血中DNA，巢式PCR扩增含PvAMA-1Ⅱ区（793bp）和PfA

7、MA-1Ⅰ区（505bp）的DNA片段，电泳鉴定扩增产物，并将扩增产物进行纯化和测序，利用生物软件进行序列比对分析。【结果】23例恶性疟原虫（pf）样本中有18种单倍型(H=18)，8种单倍型是基因库中所没有的，有32个多态位点（s=32），核苷酸多样度（π）为0.02501±0.00099，非同义突变率与同义突变率差值（dN-dS）为0.031±0.006，中性检验2结果均无统计学意义，重组事件的最低数量（Rm）为10。连锁不平衡指数R随核苷酸遗传距离增加处于明显下降趋势。17例间日疟原虫（pv）样本有产生9种单倍型，只有

8、1种（V3）是新发现，在基因库中无100%吻合的序列，9个多态位点（s=9）单倍型，核苷酸多样度（π）为0.00859±0.00093，非同义突变率与同义突变率差值（dN-dS）为-0.00230±0.00539,但Z检验结果不显著（P=0.648)。中性检验的结果均无统计学意义，2重组事