河南省樱桃谷鸭乙型肝炎病毒全基因组克隆与序列分析_沈永恕

《河南省樱桃谷鸭乙型肝炎病毒全基因组克隆与序列分析_沈永恕》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在教育资源-天天文库。

1、１３９４中国兽医学报２０１３年９月第３３卷第９期ＣｈｉｎＪＶｅｔＳｃｉＳｅｐ．２０１３Ｖｏｌ．３３Ｎｏ．９河南省樱桃谷鸭乙型肝炎病毒全基因组克隆与序列分析沈永恕１，刘扬科２，陈陆２＊，霍金耀２（１．河南牧业经济学院，河南郑州４５００４６；２．河南农业大学，河南郑州４５００４６）摘要：对河南省樱桃谷鸭主产区信阳、新郑、焦作三地６２８份樱桃谷鸭血清样本应用ＰＣＲ技术进行鸭乙型肝炎病毒（ＤＨＢＶ）检测，并将三地ＤＨＢＶ阳性样本各挑选１份进行ＤＨＢＶ全基因的扩增、克隆、测序及序列分析。结果显示，信阳、新郑、焦作三

2、地樱桃谷鸭ＤＨＢＶ自然携带率分别为１０．５％、８．９％、１７．６％；３株ＤＨＢＶ基因组全长分别为３０２１、３０２７、３０２４ｂｐ，均含有编码Ｐ、Ｓ和Ｃ蛋白的３个开放阅读框，各开放阅读框氨基酸同源性比较显示差异显著的区域位于Ｐ蛋白。序列分析显示，３株ＤＨＢＶ河南株核苷酸同源性为８９．８％～９３．９％，与参考株为８９．４％～９９．５％。遗传进化分析及Ｐ蛋白关键位点分析结果表明，信阳分离株为西方基因型，其余２株为中国基因型。本试验掌握了河南省樱桃谷鸭主产区ＤＨＢＶ自然感染情况，并成功克隆了３株樱桃谷鸭ＤＨＢＶ全

3、基因序列，为该病毒的进一步研究提供了有益信息。关键词：樱桃谷鸭；鸭乙型肝炎病毒；全基因序列；克隆中图分类号：Ｓ８５２．６５文献标志码：Ａ文章编号：１００５－４５４５（２０１３）０９－１３９４－０５ＣｌｏｎｉｎｇａｎｄｓｅｑｕｅｎｃｅａｎａｌｙｓｉｓｏｆｄｕｃｋｈｅｐａｔｉｔｉｓＢｖｉｒｕｓｇｅｎｏｍｅｆｒｏｍｃｈｅｒｒｙｖａｌｌｅｙｄｕｃｋｉｎＨｅｎａｎｐｒｏｖｉｅｎｃｅ１，ＬＩＵＹａｎｇ－ｋｅ２，ＣＨＥＮＬｕ２＊，ＨＵＯＪｉｎ－ｙａｏ２ＳＨＥＮＹｏｎｇ－ｓｈｕ（１．ＨｅｎａｎＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙｏｆＡｎ

4、ｉｍａｌＨｕｓｂａｎｄｒｙａｎｄＥｃｏｎｏｍｙ，Ｚｈｅｎｇｚｈｏｕ４５００４６，Ｃｈｉｎａ；２．ＨｅｎａｎＡｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，Ｚｈｅｎｇ－ｚｈｏｕ４５００４６，Ｃｈｉｎａ）Ａｂｓｔｒａｃｔ：Ｆｏｕｒｈｕｎｄｒｅｄａｎｄｎｉｎｅｔｙ－ｔｈｒｅｅｓｅｒｕｍｓａｍｐｌｅｓｗｅｒｅｃｏｌｌｅｃｔｅｄｆｒｏｍｃｈｅｒｒｙｖａｌｌｅｙｄｕｃｋｉｎＨｅｎａｎｉｎｏｒｄｅｒｔｏｃｌａｒｉｆｙｔｈｅｎａｔｕｒａｌｉｎｆｅｃｔｉｏｎｏｆｄｕｃｋｈｅｐａｔｉｔｉｓＢｖｉｒｕｓ（ＤＨＢＶ）ａｎｄｃｈａｒ

5、ａｃｔｅｒｉｚｅｔｈｅｇｅｎｏｍｅｓｔｒｕｃｔｕｒｅｏｆＤＨＢＶ．ＴｈｅｃｏｍｐｌｅｔｅｇｅｎｏｍｅｏｆｔｈｒｅｅＨｅｎａｎＤＨＢＶｓｔｒａｉｎｓ（ＤＨＢＶ－ＸＹ，ＤＨＢＶ－ＪＺ，ａｎｄＤＨＢＶ－ＸＺ）ｗａｓａｍｐｌｉｆｉｅｄ，ｃｌｏｎｅｄ，ａｎｄｓｅｑｕｅｎｃｅｄ．ＴｈｅｒｅｓｕｌｔｓｓｈｏｗｅｄｔｈａｔｔｈｅｎａｔｕｒａｌｉｎｆｅｃｔｉｏｎｒａｔｅｏｆＤＨＢＶｗａｓ１０．５％，８．９％，１７．６％ｉｎＸｉｎｙａｎｇ，Ｘｉｎｚｈｅｎｇ，Ｊｉａｏｚｕｏｒｅｓｐｅｃ－ｔｉｖｅｌｙ．ＴｈｒｅｅＤＨＢＶｓｔｒａ

6、ｉｎｓｈａｄ３０２１，３０２７，３０２４ｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅｓｗｉｔｈｔｈｒｅｅｏｖｅｒｌａｐｐｉｎｇｏｐｅｎｒｅａｄ－ｉｎｇｆｒａｍｅｓ（ＯＲＦｓ）ｅｎｃｏｄｉｎｇｓｕｒｆａｃｅ（Ｓ），ｃｏｒｅ（Ｃ）ａｎｄｐｏｌｙｍｅｒａｓｅ（Ｐ）ｐｒｏｔｅｉｎｓ，ｒｅｓｐｅｃｔｉｖｅｌｙ．ＴｈｅＯＲＦｈｏｍｏｌｏｇｏｕｓｃｏｍｐａｒｉｓｏｎｓｈｏｗｓｓｉｇｎｉｆｉｃａｎｔｄｉｆｆｅｒｅｎｃｅｓｉｎＰｐｒｏｔｅｉｎ．Ｓｅｑｕｅｎｃｅａｎａｌｙｓｉｓｒｅ－ｖｅａｌｅｄｔｈａｔｔｈｒｅｅＨｅｎａｎＤＨＢＶｓｔｒａｉｎｓｈａ

7、ｖｅ８９．８％－９３．９％ｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅｓｅｑｕｅｎｃｅｉｄｅｎｔｉｔｙｗｉｔｈｅａｃｈｏｔｈｅｒ，ａｎｄ８９．４％－９９．５％ｗｉｔｈｒｅｆｅｒｅｎｃｅｓｔｒａｉｎ．ＰｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃａｎａｌｙｓｉｓｓｈｏｗｅｄｔｈａｔＤＨＢＶｗａｓｃｌａｓｓｉｆｉｅｄｉｎｔｏｔｗｏｇｅｎｏｔｙｐｅｓ（ＣｈｉｎｅｓｅｇｅｎｏｔｙｐｅａｎｄＷｅｓｔｅｒｎｇｅｎｏｔｙｐｅ）．ＤＨＢＶ－ＸＺａｎｄＤＨＢＶ－ＪＺｗｅｒｅｃｌａｓｓｉｆｉｅｄｔｏＣｈｉｎｅｓｅｇｅｎｏｔｙｐｅａｎｄＤＨＢＶ－ＸＹｗａｓｃｌａｓｓｉｆｉ

8、ｅｄｔｏＷｅｓｔｅｒｎｇｅｎｏｔｙｐｅ．ＴｈｅｒｅｓｕｌｔｓｐｒｏｖｉｄｅｈｅｌｐｆｕｌｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎｆｏｒＤＨＢＶｆｕｒｔｈｅｒｓｔｕｄｉｅｓ．Ｋｅｙｗｏｒｄｓ：ｃｈｅｒｒｙｖａｌｌｅｙｄｕｃｋ；ｄｕｃｋｈｅｐａｔｉｔｉｓＢｖｉｒｕｓ；ｃｏｍｐｌｅｔｅｇｅｎｏｍｅｓｅｑｕｅｎｃｅ；ｃｌｏｎｅ＊Ｃｏｒｒｅｓｐｏｎｄｉｎｇａｕｔｈｏｒ，Ｅ－ｍａｉｌ：ｃｈｅｎｌｕｈａｕ＠１２６．ｃｏｍ［１］乙型肝炎是一个全球性的公共卫生问