seldi蛋白质芯片技术在肿瘤蛋白质组学研究中的应用new

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1、东南大学学报(医学版)2334,"’5;2(67):648!673!"#$%&’()%*+,-(.’/"0,1/,)·648·!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!"1;<=蛋白质芯片技术在肿瘤蛋白质组学研究中的应用伍健,黄培林(东南大学基础医学院病理学与病理生理学系,江苏南京29333:)[摘要]"1;<=蛋白质芯片技术是结合色谱学>层析原理和"1;<=!?@A!."技术制成的新一代生物芯片,是目前肿瘤蛋白质组学研究的重要工具之

2、一。它的优点是能洞察肿瘤细胞、组织和生物体蛋白质含量的细微变化,且能精确分析某一特定蛋白质的理化性质。作者就"1;<=蛋白质芯片联合二维电泳、激光捕获显微切割等技术在肿瘤蛋白质组学研究中所应采取的策略,"1;<=蛋白质芯片在肿瘤蛋白质组学研究中的临床应用如筛选肿瘤标志蛋白、预测肿瘤转移和预后等作一综述。[关键词]表面加强激光解析电离化飞行时间质谱;蛋白质组学;肿瘤;标志蛋白;综述[中图分类号]B863C47;B69DC7[文献标识码]E[文章编号]9F89!F2F(42334)37!3648!34蛋白质作为生命存在的物质基

3、础,人类对其的研9"1;<=蛋白质芯片技术的组成究并不是一个新课题,但以研究不同种类的蛋白质和其他物质是如何在细胞中协同作用为目的的蛋白质化"1;<=技术组成由"1;<=蛋白质芯片、芯片阅读学却是一个相对较新的研究领域。9::4年,G,HH,(I)器和分析软件三部分组成。等首先提出了“蛋白质组(5J#%’#I)”的名词[9]。人类基9C9"1;<=蛋白质芯片因组计划(KLM)全基因组测序的完成,标志着后基因蛋白质芯片主要是根据液相层析原理来分离所需时代的到来,人们对蛋白质研究的兴趣越来越浓,蛋白检测的蛋白质。其原理是将所需

4、分析的蛋白质和固相质组学研究也因此而有了飞快的发展。随着基因组测载体支持物特异性地结合后,其它的蛋白质和杂质随序的完成,人们自然地对基因的表达产物蛋白质进行液相流走,然后洗脱与固相载体支持物特异性结合的了研究。表面加强激光解析电离化飞行时间质谱蛋白质即可。"1;<=蛋白质芯片和基因芯片一样,同()$JN(0’O’+&(+0’/H()’J/’)#J5%,#+>,#+,P(%,#+,"1;<=)蛋白属于生物芯片(S,#0&,5)的范畴,其由特殊材料制成的质芯片技术是结合色谱学>层析原理和"1;<=!?@A!."固相载体呈薄片型

5、,在载体表面有以特定方式固定的技术制成的新一代蛋白质生物芯片,为蛋白质组学的不同化学成分,这些化学成分包括结合某些阳离子或研究提供了行之有效的方法。"1;<=质谱分析弥补了阴离子的化学基团、特定蛋白质的抗体或受体,吸水或二维电泳对低丰度、低溶解度、极端等电点值、极大(相疏水物质、酶、免疫复合物等,用化学固定技术固定在对分子质量Q233333)和极小(相对分子质量R93333)载体表面上,形成一个个点状芯池。蛋白质无法鉴定的不足,进一步提高了蛋白质分离和根据芯片表面的不同化学成分,"1;<=蛋白质芯鉴定的速度,在蛋白质组学的

6、分析研究中起着十分重片可分为两种。要的作用。近年来人们逐渐认识到质谱分析作为蛋白9C9C9化学表面芯片芯片又可分为疏水、亲水、阳质组学研究中的关键部分,不仅仅依赖仪器本身,而且离子、阴离子和金属离子螯合芯片,用于检测未知蛋依赖分析策略和对样品自始至终的操作技巧[2]。现综白。T()%#J(等[6]对老年性痴呆者线粒体蛋白质用述"1;<=蛋白质芯片技术联合二维电泳、激光捕获显"1;<=进行研究时发现,用不同的"1;<=芯片包括强微切割等技术在肿瘤蛋白质组学研究中所采取的策略阳离子、弱阴离子、疏水和金属离子的芯片对样品进行及其

7、在肿瘤蛋白质组学研究中的应用如筛选肿瘤标志分析时,肽段的表达是不同的。它的优点是:"使用时蛋白、预测肿瘤转移和预后等。可直接用粗生物样品如尿液、血清、精液进行分析,[作者简万方数据介]伍健(9:89!),男,湖南新化人,病理学专业在读硕士研究生。·C6L·东南大学学报(医学版)-&&6年9月,-(C()!"#$%可以直接用体液、血清和精液对病情进行评估;(#+,)等蛋白质组学其它支撑技术。可大体分为以下!量少,一般样品量(&’()("*)或激光捕获显微切割C个步骤。技术(#+,)样品约-&&&个细胞即可;#并可发现低丰-’

8、.样品制备度、小相对分子质量蛋白质,灵敏度高。肿瘤细胞系、肿瘤组织和肿瘤患者体液均可用于.’.’-生物表面芯片主要是根据亲和层析原理,生肿瘤蛋白质组学的研究。由于肿瘤细胞系不等于体内物大分子和接在固相支持物上的配体特异性结合而被真实环境,故肿瘤组织活体标本的研究更有实际临床吸附于支持物上,杂质蛋白随液相

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