基于issr指纹标记的亚洲栽培稻与野生稻遗传多样性分析

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1、第31卷第1期V0131NO。1井冈山大学学报(自然科学版)2010年1月Jan.2010JournalofJinggangshanUniversity(NaturalScience)118文章编号:1674.8085(2010)01—0118—07基于ISSR指纹标记的亚洲栽培稻与野生稻遗传多样性分析段世华,郑卓,胡乃凤,胡有生。(1.井冈山大学生命科学学院,江西,古安343009;2.永新县农业技术推广服务,西,永新343413;3f:冈Jh大学医学院,江西,古安343000)摘要:为评价野生稻与亚洲栽培稻的遗传多样性及其变异火系,21对SSR引

2、物被用十研究广泛地理分布的17份野生稻(其中11份0.rufipogon和6份0.nivara)和22份亚洲栽培稻(13份indica和9份japonica)样本。271条多态性片段被扩增出,占总扩增片段的96.10%。野生稻多态性片段的百分比(平均达64.3O%)及Nei’s遗传多样性值(GD)明显高于亚洲栽培稻,表明野生稻比亚洲栽培稻具更丰富的遗传多样性。UPGMA聚类分析显示野生稻的两个类群(D.rufipogon和0.nivara)关系密切,但在遗传上存在明显的分化,支持其作为两个独立物种的分类观点。野生稻中籼粳分化不很明显,亚洲栽培稻的籼粳

3、亚种分化明显。亚洲栽培稻与多年生普通野生稻.rufipogon)关系更为密切,符合异源起源的遗传分化模式。关键词:ISSR;亚洲栽培稻:野生稻:遗传多样性中图分类号:Q346+.3文献标识码:ADOI:10.3969/j.issn.1674—8085.2010.01.027GENETICDIVERSITYoFCoMMoNWILD.RICEANDASIANCUIrIVEDRICEREVEALEDBYISSRFINGERPRINTSDUANShi.hua,ZHENGZhuo,HUNai—feng,HUYou.shengf1,SchoolofLifeSci

4、ences,JinggangshanUniversity,Ji’an,Jiangxi343009,China;2Agro—TechExtensionandServiceCenterofY~mgxJnCounlv

5、Yong~in,Jiangxi343413,China3.SchoolofMedicine,JinggangshanUniversity,Ji’an,Jiangxi343000,China)Abstract:ToexplorethegeneticdiversityandvariationofcommonwildriceandAsiancult

6、ivatedrice.17accessionsofcomlilonwildrice(110.rufipogonand60.nivara)and22cultivarsofAsiancultivatedrice(13indicaand9japonica)collectedworldwidewereanalyzedby21ISSRprimers.Thepolymorphicfragmentspercentagewas96.10%and271polymorphicfragmentsweredetected.Acomparisonofthepolymorphi

7、cfragmentspercentageandNei’Sgeneticdiversity(GD)indicatedthatthegeneticdiversityofconlmonwildricewasobviouslyhigherthanthatofAsiancultivatedrice.TheUPGMAclusteranalysisrevealedthattherewasacloserelationshipbetweenO.rufipogonand0.nivara,butdistinctgeneticdiferentiationwasdetecte

8、dbetweenthem,whichsupportedthepointthattheyweretwoindependentspecies.Theresultsindicatedthattheindica-japonicadiferentiationwasnotveryapparentinmanywildricewhereasitwasobviousinAsiancultivatedrice.Accordingtotheclusteranalysis,therewasacloserconsanguineousrelationshipbetweenAsi

9、ancultivatedriceandO.rufipogon,whichsupportedthediphyl

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