红掌转录组测序及花青素生物合成途径差异表达基因的分析

红掌转录组测序及花青素生物合成途径差异表达基因的分析

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1、''--'V:-:(.A./-;;'、';;.-'.-.卢:皆,V.:^A■'"''"’.-''-'V,i沾巧;;、v齡M'.??.'A.HS;\:.—;乂7一\户〇."<''’.、V,..:戈->芒:,,安''如...,-,乂:..-‘S663.单位代码:W743分类号.:;边’'''.:1—如:20672密级公巧学号12130:公开,?'-.*?S一.、';..3I:八、宁夏大举心■'>:;.?.’护如硕工学位论文澤V;V/''心‘-:

2、心;,红掌转聚细测序及花青素生物合成途径差t^了W异表达基因的分析一‘^?TranscrtomeAnalsisandAiithocaninBiosnthesisipyyyGeneticExressionintheSatheof泣巧</庐6?化《^?pp-么.■'.'‘^…,>矜二:’‘心’择>.巧.学位.,申请人:彭伟佳■'片和,?'';平吉成教授指导教师.K苗V.--.指导教师;M张黎教Tr搜jr.■?'.t-.T■,,—,-T,,-'‘

3、申请学位口类级别;农学硕±I..-今、万:果柄学作,专化名称....._—’-'V':岡林植物与观當园艺V.;研巧方向...一‘V ̄<.、乂、:一.、:.'戶/P元:心.f在学农学院、..*■■.一,-一‘':,:,;、'^.--:论文完成曰期2015年5月.._’纖:麵麵冥’—化心山<-丑■,.公。:心.;一心T-独创性声明本人声明所呈交的论文是我个人在导师指导下进行的研巧工作及取得的研究成果。尽我所知>1,除了文中特别加^标注和致谢的地方外,论文中不包含其他人已|经发表

4、或撰写过的研巧成果,也不包含为获得宁夏大学或其它教育机构的学位或证一书而使用过的材料。与我同工作的同志对本研充所做的任何贡献均已在论文中作了明确的说明并表示了谢意。研究生签名:时间:年月聲日关于论文使用授权的说明本人完全了解宁夏大学有关保留、使用学位论文的规定,即;学校有权保留送交论文的复印件和磁盘,,允许论文被查I匆和借阅可W采用影印、缩印或扫描等复制手段保存、汇编学位论文。同意宁夏大学可W用不同方式在不同媒体上发表、传播学位论文的全部或部分内容。研究生签名:Mi时间:年r月^曰皆-导师签名;时间:年\月。日3摘要’红掌C4nA

5、w7Mma?<ire£?jMm)作为具有重要经济价值的盆花、切花种类。!^佛焰甚为主要观赏部位,其颜色是决定商品价值的最重要因素。传统的杂交育种方式耗时长、后代变异大,,选种困难利用诱变育种,获得变异植株概率小很难得到变异后代!分子育种是培育;,新晶种的新方法,但因目前对红掌分子研巧背景缺乏分子方面研巧相对滞后。为提高红掌选育效率,有必要建立红掌性状控制的分子遗传学基础,因此建立红掌基因组数据库意义重一大UuminaH设e/MiSe8个连(S^S8)。本研巧采用新代髙通量lqq测序方法对红掌续生长期做转录姐测序,并对S5(盛花期:红色)和S8(衰老期:绿色

6、)时期分别做数字基因表达谱(DGE)测序,丰富了红掌转录组数据库信息,获得控制紅掌佛焰巷花青素生物合成途径中颜色变化的关键基因。为后续功能基因克隆、分子标记筛选W及基因改良育种等提供了背景参考:。具体研充结果如下(l)1、对红掌佛焰荀整个生长周期进斤转录姐测序得到有效基因序列ceanreads56445573-i,条,数提量达5.64Gi并得到长度分布在2002000bp的单基因簇(ungene)64576条丰富了红掌转录姐数据信息。2、对S5(盛花期:红色)和S8(衰老期:绿色)时期进行数字基因表达谱测序,分别得到:2和185的390条(

7、1.86G)可分析序列(cleanreads),其中彼12766374条(l.8G)成功注释有差异表达的基因序列2316条。3、转录组结合数字基因表达谱测序,得到了在S5和S8两个时期差异表达的10条与花青素生物代谢途经有关的基因序列,通过NCBI比对,10条序列确定为8种基因,分别为’--3-(巧经化酶査耳丽合成酶览)、查耳丽异构酶(CWn、黄烧丽P咨化酶jy)、类黄丽3’(巧好)、二氧黄丽醇还原酶(0巧?)、花色巧合酶(^5)、无色

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