马鹿（cervus elaphus）鹿茸角顶端茸皮与软骨组织转录组研究

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1、学校代码：１０２２５学号；Ｂ１５０８２学化冷文马鹿（Ｃｅｒｖｗｅ／巧？鹿葺角顶端葺皮与软骨组织转录纪硏究杨晚光■■指导教师姓名：郑冬教授东北林业大学申诸学位级别：博ｉ学科专业：野生动植物保护与利用论文提交日期：２０１５年３月论女答辩日期：２０１５年６月１６日授予学位单位：东北林业大学授予学位曰期：答辩委员会主席：马建章院±／教授论文评阔人：啤．．．节京沁表欠争＇？－Ａ．．卓；．，１—成？．＇－？、学校代码；１０２２５学号；Ｂ１５０

2、８２学化４＾文马鹿（Ｃｅｒｍｙｅ崎鹿茸角顶端葺皮与软骨纽织转录纽研究杨晓光指导教师姓名：郑冬教授东北林业大学申请学位级别：博壬学科专业：野生动植物保护与利用论文提交日期：２０１５年３月论文答辩日期：２０１５年６月１６日授予学位单位：：东北林业大学授予学位日期答辩委员会主席：马建章院±／教授论文评阅人：糸抑４欠争ＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙＣｏｄｅ：１０２２５ＲｅｉｓｔｅｒＣｏｄｅ；Ｂ１５０８２ｇＤｉｓｓｅｒｔａｔｉｏｎｆｏｒｔｈｅＤｅｒｅｅｏｆＤｏｃｔ

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4、ｌｉｔｙ化ＤａｔｅｏｆＯｒａｌＥｘａｍｉｎａｔｉｏｎ：Ｊｕｎｅ１６２０１５，ｔｓｉｔＵｎｉｖｅｒｓｉｙ：ＮｏｒｔｈｅａｓｔＦｏｒｅｓｔｒｙＵｎｉｖｅｒｙ摘要摘要一鹿茸角是唯每年周期性表形态再生的哺乳动物附件器官，即远端附件去除后还会完整地再生出来一。因此鹿茸为研究再生的分子机理提供了个独有的动物模型。鹿茸角一，巧化期，个再生周期包括四个阶段：快速生长期，茸皮（也称为鹿茸）脱落期ｙｘ及硬角脱落期，，。在快速生长期，鹿角由软骨和骨组成渗透Ｗ血管和种经网络外覆茸皮。ＡＰ快速纵

5、向生长始于每个鹿茸角顶端增生区，）。在此增生区内在鹿茸软骨膜（内的祖细胞进行增殖和分化，向外形成包于外部的巧皮，向内形成排列于垂直小梁上的软骨前体细胞和软骨细胞。鹿茸角具独有的茸性上皮，上分布有稀疏的绒毛，被称为鹿茸（茸皮）。研巧表明，茸皮并不是包裹于角柄外典型头皮在鹿茸角部分上简单的延伸。茸皮再生始于包裹角柄创面皮肤的伤口愈合过程。但是其特殊性在于，当创伤愈合上皮迁移穿过角柄骨膜（ＰＰ）远端点后，皮肤从头皮类型开始转换成茸皮类型。相较于角柄皮肤（典型的头皮），茸皮缺乏皮下疏松结缔组织层，，并能形

6、成新的毛囊但有更厚的表皮层。这些新形成的毛囊缺乏立毛肌和汗腺，但具有较大皮脂腺，虽然鹿茸软骨基质生物化。在增生区向内侧学性质上类似于其他透明软骨，其独特么处在于具有血管网络。上述组织学特性使茸皮一和软骨组织与其他组织湿著不同，其中通过系列的增殖、成型、分化事件，基因表达程序发生大规模的变化来形成新的结构，。然而我们对其转录组信息知之甚少。本论文对快速生长期马鹿（Ｃｅｒｖｗｅ／ｏｐ＆ｗ）茸皮和软骨进行了研究，通过自体转录，并对构成５５０９５７３０ｅａｄｓ（８６１５７００组组装，条干净短ｒ测序序列）

7、的总计长度为４兴，，，核昔酸的序列进行了ＲＮＡ－Ｓ巧分析Ｉ。自体组装序列利用ＢＬＡＳＴＸ与ＮＣＢｎｒ、ＧＯ、ＣＯＧ、ＫＥＧＧ数据库进行比对和标注。结果表明：１－－．Ｔｒｉｎ组装共获得６３５５０利用ｉｔ条ＡＵＵｎｉｅｎｅｓ。ｙ软件自体，ｇ其中，两种组织共有的Ｍ２９５－ｉｍ，，ｉｅｎｅｓ为３３条茸皮组织特有的Ａｌｌｕｎｉｅｎｅｓ为２０１巧条软骨组织特有的ｇ，ｇ，Ａ－ｌｌｕｎｉｇｅｎｅｓ为１０１１６条。，２３４７１－－．ｒ注释，Ｕｎｉｅｎｅｓ，通过ｎ有３，条Ａｌｌｇ可Ｗ直接比对到Ｎｒ数据库占Ｍｕｎ

8、－ｉｅｎｅｓ总数比例为５２．６７２条Ａｌ比对到ｏｒｔｇ％；３２Ｊ６ｌＵｎｉｇｅｎｅｓＳｗｉｓｓｐ数据库－－（５１．５５％）２５５７７ｌｌＵｎｉｅｎｅｓ比对到ＫＥＧＧ；１１４２８ＡｌｌＵｎｉｅｎｅｓ；条Ａ数据库，条，ｇｇ比对到ＣＯＧ数据库７２５２－ｓ（