鲚属鱼类和江鳕的线粒体基因组全序列研究

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1、＾个躬各义々（ＫＡＮＵＮＮＡＦＩＶＥＲＳＩＴＹＯＦＣＨＩ硕±学位论文ＭＡＳＴＥＲＤＩＳＳＥＲＴＡＴＩＯＮ论文趣目：巧巧鱼类和江健的线粒体基因组全序列研究ＳｔｕｄｉｅｓｏｎＣｏｍｐｌｅｔｅＭｉｔｏｃｈｏｎｄｒｉａｌＧｅｎｏｍｅｓ：ｏｆｅｎｕＣｏｉｌｉａａｎｄｏｔａｏｔａ巧文跑目ＧｓＬｌ作者：指导教师：？天翔教巧学位类别：全日制学术学位专业名称：渔业资源研究方向：渔业生物学ｉ＾ＳＰＫＩＭ＾Ｓ谨心又此论文献给我的母校张楠

2、骄属鱼类和江轄的线粒体基因组全序列研究学位论文答辩日期＜：指导教巧签字：答辩委员会巧员签字；乂斗Ｉ窥締ｙ＃ｆ独创汚明本人声明所呈交的学位论文是本人在导师指导下进行的研巧工作及取得的研巧成果。据我所知，除了文中特别加Ｗ标注和致谢的地方外，论文中不包含其他人已经发表或撰写过的研巧成果，也不包含未获得（注；如没有其他需要特别声明的，本栏可巧）或巧他教育机构的学位或证书使用过的材料一。与我同工作的同志对本研巧所做的任何贡献均己在论文中作了明确的说明并表示谢意。学位论文作者签名：签宇日期

3、：１月曰珠１０任年６＾巧＾１什学位论文版权使用授权书、本学位论文作者完全了解学校有关保留使用学位论文的规定，并同意Ｗ下事项：１、学校有权保留并向国家有关部口或机构送交论文的复印件和磁盘，允许论文被査阅和借阅。２、学校可将学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索，可Ｗ＂采用影印、缩印或扫描等复制手段保存、汇编学位论文。同时授权清华大学中＂国学术期刊（光盘版）电子杂志枉用于出版和编入ＣＮＫＩ《中国知识资源总库》，授权中国科学技术信息研巧所将本学位论文收录到《中国学位论文全文数据库》。（保密

4、的学位论文在解密后适用本授权书）：学位论文作者签名：＾导师签字《秦餐签字日期一ｏＫ年《月４日签字日期年＾月＾日＾少（骄属鱼类和江質的线粒体基因组全序列研究摘要骄属（。／从７）鱼类是广泛分布于太平洋西北部和印度洋中小型鱼类，主要栖息于沿岸海域一，多进行短距离溯河生殖徊游。我国挤属鱼类的分类直存在争０议一。江錯ａ〇＾Ｗｏｗ）是蜂科中唯的淡水鱼类，主要分布在北绛４〇＾北的欧洲、亚洲和北美洲，是北极淡水区冷水性肉食鱼类。本研巧对刀巧、凤轿和韦丝轿的线粒体基因组结构和组成进行了分析与比较，并在线粒体

5、基因组全序列水平探讨了轿属鱼类的系统发育关系Ｗ及刀轿、凤轿的种内遗传分化程度。同时，比较分析了江蜂Ｈ个区域内个体的线粒体基因组的结构和组成，并讨论了江擅在分布范围内的遗传分化。主要结果如下：１．刀巧、凤巧和屯丝巧线粒体基因组特征分析本研究扩増得到刀巧Ｈ个单倍型类群的线粒体基因组全序列，全长分别为１６８％ｂｐ、１６９００ｂｐ和１６８９６ｂｐ；凤巧南北世系的线粒体基因组全序列，全长分别为１６９６４ｂｐ和１７０７５ｂｐ；韦丝轿线粒体基因组全序列全长为１６８５１ｂｐ。Ｈ种巧属鱼类长度差异主要由于三者控制区内均

6、存在库联重复巧列。Ｈ者线粒体基因组包括１３个蛋白质编码基因、２２个ｔＲＮＡ基因、２个ｒＲＮＡ基因和２个非编码区一（控制区和〇Ｌ）。，其排列顺序与大多数脊椎动物相致在巧基组成上，ＧＣ含量在两条链中均具明显偏倚，但ＡＴ含量相差不大，Ｈ与Ｌ链蛋白质编码基因巧码子第Ｈ位点分别呈现明显的反Ｇ和反Ｃ偏倚，并反映在Ｗ相同巧基结尾的密码子使用偏好上。王者蛋白质编码基因的起始密码子和终止密码子完全相同，除ＣＯＩＷＧＴＧ为起始密码子外，其余均ＷＡＴＧ为起始密码子；终止密码子包括＾ａｇｙ）ＴＡＡ－－、ＴＡ和Ｔ王种类型。除

7、了ＩＲＮＡ外，其余化ＮＡ均能形成稳定的茎环结构，刀巧各单倍型类群间及凤巧南北世系间在ｔＲＮＡ上的碱基替换大多发生在环区。除了存在串联重复序列而导致线粒徒基因组全序列长度差异外，巧属鱼－类控制区结构较为保守。在控制区识别了终止序列区、中央保守区（ＣＳＢＦ？Ｄ）－？３和保守序列区（ＣＳＢ１）。刀巧Ｈ个单倍型类群线粒体基因组全序列间妓义度较小（＜０．００４），但凤巧南北世系线粒体基因组全序列间呈现较大的歧义度。２．基于线粒体基因组全序列的巧属鱼类《统发育关系联合线粒体基因组中各进化速率不同的片段，利用贝叶斯联

8、合模型和ＭＬ分析方法重建了轿属鱼类的系统进化关系，结果显示，所研究的巧属鱼类分为两个一大分支。第个分支中包含刀轿、韦丝斷和林氏轿。其中，刀轿和走丝骄亲缘关系最近，然后再与，形成姐妹种林氏轿聚类。本研巧中刀轿的Ｈ个单倍型类群