吉林省猪流感病毒的分离鉴定及分离株ha、na基因序列分析

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1、分类号：Q93单位代码：10193密级：公开学号：2012085硕士学位论文吉林省猪流感病毒的分离鉴定及分离株HA、NA基因序列分析IsolationandidentificationofswinefluvirusinJilinProvinceandIsolatesHA,NAgenesequenceanalysis作者姓名：李雪娇学位类别：理学硕士专业名称：微生物研究方向：病原微生物指导教师：张文慧副教授所在学院：生命科学院2015年5月独创性声明本人郑重声明：所呈交的学位论文是本人在导师指导下，独立进行研究所取得的成果。尽我所知，除文中特别加以标注和致谢所列内容外，论文中不包含其

2、他个人或集体已经发表或撰写过的研究成果，也不包含为获得吉林农业大学或其它教育机构的学位或证书而使用过的材料。与我一同工作的同志对本研究所做的任何贡献均已在论文中作了明确的说明并表示了谢意。本学位论文所有内容若有不实之处，本人愿意承担一切相关法律责任和后果。学位论文作者签名：签字日期：年月日关于学位论文使用授权的声明1、本人完全了解吉林农业大学有关保留和使用学位论文的规定，即：研究生在校攻读学位期间所完成的论文及相关成果的知识产权属吉林农业大学所有，并同意将本论文的版权授权给吉林农业大学，学校有权保留送交论文的复印件和磁盘，允许论文被查阅和借阅，可以采用影印、缩印或扫描等复制手段保存

3、、汇编学位论文。2、本人（同意/不同意，务必打印后填写）吉林农业大学将本论文版权授权给不同媒体进行电子出版、多媒体出版、网络出版以及其他形式出版（涉密学位论文解密后应遵守此协议）。3、本人声明毕业后若发表在攻读研究生学位期间完成的论文及相关的学术成果，必须以吉林农业大学作为第一署名单位。学位论文作者签名：签字日期：年月日指导教师签名：签字日期：年月日吉林农业大学硕士学位论文摘要摘要本研究对吉林地区采集到的猪血清样本7909份、鼻拭子及疑似发病死亡猪只的肺脏、支气管等病料5154份，总计13063份样本进行了病毒分离，并且对分离到的毒株进行亚型鉴定。结果显示分离到的三株猪流感病毒均为

4、H1N1亚型猪流感病毒，根据流感病毒命名标准体系分别命名为A/swine/Jilin/1-1/2011、A/swine/Jilin/1-2/2011和A/swine/Jilin/1-3/2011。对分离株HA、NA基因进行克隆和遗传进化分析。基因测序结果表明，SIV分离株A/swine/Jilin/1-1/2011(H1N1)的HA基因序列全长为1638个核苷酸，编码区为40-1636bp，编码532个氨基酸。NA基因序列全长为1420个核苷酸，编码区为4-1413bp，编码470个氨基酸；分离株A/swine/Jilin/1-2/2011(H1N1)的HA基因序列全长为1703个

5、核苷酸，编码区为26-1556bp，编码510个氨基酸。NA基因序列全长为1404个核苷酸，编码区为30-1397bp，编码456个氨基酸；分离株A/swine/Jilin/1-3/2011(H1N1)的HA基因序列全长为1745个核苷酸，编码区为17-1722bp，编码568个氨基酸。NA基因序列全长为1458个核苷酸，编码区为21-1430bp，编码470个氨基酸。裂解位点显示三株均为低致病性毒株，糖基化位点均未发生变异相对保守，受体结合位点显示分离株具有感染禽源的潜力，NA基因耐药性位点显示这三株猪流感病毒对目前使用的神经氨酸酶抑制剂类药物均有效。遗传进化分析结果显示A/sw

6、ine/Jilin/1-1/2011和A/swine/Jilin/1-2/2011的HA和NA基因来源于野禽，与禽流感病毒的亲缘关系较近。其中，A/swine/Jilin/1-1/2011和A/swine/Jilin/1-2/2011的HA基因分别与韩国2004年分离到的A/wildduck/Korean/SH60/2004的H1N1亚型流感病毒和2005年中国河北分离到的A/duck/Hebei/843/2005的H1N2亚型流感病毒亲缘关系最近。同时，这两个病毒株的NA基因都与2003年中国东部的分离到的A/duck/EasternChina/103/2003和A/duck/E

7、asternChina/152/2003的H1N1亚型流感病毒亲缘关系最近。与以上两个病毒株明显不同的是，A/swine/Jilin/1-3/2011的HA和NA基因则主要来自于人流感病毒和猪流感病毒，其中HA基因与中国山东、上海、广东、广西等地发现的H1N1病毒亚型亲缘关系最近，NA基因与中国山东、上海、广东等地发现的H1N1病毒亚型有明显的亲缘关系。关键词：猪流感病毒H1N1亚型分离鉴定遗传进化III吉林农业大学硕士学位论文AbstractAbstractInth