基于转录组测序尖孢镰刀菌西瓜专化型fucp基因初步分析

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1、、？分类号Ｑ７１ｘ＾纖学号２。。歷＇浊—巧裘素六聲全日制硕±学位论文基于转录组测序尖抱镶刀菌西瓜专化型Ｆｗ：戶基因初步分析姓名：王宇君指导教师：王金胜教授学科专业：生物他学与分子生物学培养单位：生命科学学院中国？山西？太合二〇—五年六月ＳｈａｎｘｉＡｒｉｃｕｌｔｕｒａｌＵｎｉｖｅｒｓｉｔｇｙ＊－ＦｕｌｌｔｉｍｅＭａｓｔ：ｅｒＤｅｇｒｅｅＤｉｓｓｅｉｔａ村ｏｎＡｎａｌｙｓｉｓｏｆＦｕｃＰｇｅｎｅｏｆＦｕｓａｒｉｕｍｏｘｙｓｐｏｒｕｍｆ．ｓｐ．ｎｉｖｅｕｍｂａｓｅｄ

2、ｏｎｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｍｅｄａｔａｂａｓｅＮａｍｅ：ＹｕｕｎＷａｎｊｇＴｕｔ：ｏｒ：Ｐｒｏｆ．ＪｉｎｓｈｅｎｇＷａｎｇＭａｊｏｒ：ＢｉｏｃｈｅｍｉｓｔｙａｎｄｍｏｌｅｃｕｌａｒｂｉｏｌｏｇｙＴｒａｉｎｉｎｇｕｎｉｔ：ＣｏｌｌｅｇｅｏｆＬｉｆｅＳｃｉｅｎｃｅＴａｉｇｕＳｈａｎｘｉＣｈｉｎａｔＪｕｎｅ，２０１５学位论文原创性声明：本人郑重声明所提交的学位论文，是在导师指导下，独立进行研究王作所取得的成果。除文中已注明引用的内容外，本论文不包含任何其他个人或集体已经发表或撰写过

3、的作品成果。对本文研究做出过重要贡献的个人和集体，均已在文中ｋ乂明确方式标明。本人完全意识到本声明的法律后果由本人承担。作者签為（亲著主皆裹加（Ｔ年＾月曰学位论文版权使用授权书本学位论文作者完全了解学校有关保留、使用学位论文的规定。即学位论文的知识产权属山西农业大学；同意学校保留并向国家有关部口或机构送交论文的原件、复印件和电子版；允许论文被查阅和借阅人授权山西农业大学可ｋ乂入；本将学位论文的全部或部分内容编有关数据库进行检索、汇，可从采用影印、缩印或担描等复制手段保存编学位论文。作者签為（亲笔ｈ曾秦拆辟月／

4、曰／日导师签名（亲笔）：辦ｒ年月目录搞要１１前胃２１１．尖抱鎌刀茵及其致病机理２１．２万寿菊抑菌素３１．３生物信息学分析应用４１．３．１转录组学４１．３．２转录组测序技术４１．３．３髙通量测序技术的研究现况６１．３．４真菌转录组学的研究意义６１４细胞７．膜转运蛋白１．４．１膜蛋白７１．４．２ＭＦＳ家族转运蛋白７４１．．４岩藻糖质子同向转运蛋白家族１１１．５本课题研究目的及意义１１２材料与方法１２２．１材料、仪器与数据库１２２丄１材料１２２丄

5、２常用生物信息网１２２丄３主要仪器１２２丄４试剂１３２．２施１３２．２．１尖抱镶刀菌培养基的配置１３２．２．２尖抱镶刀菌及突变菌株的制备１３２．２．３尖抱嫌刀菌及其突变菌株ＲＮＡ提取及测序１３２．２．４１４么２．５尖抱嫌刀菌及其突变菌株的转录组测序数据分析比较１４２．２．５．１原始数据整理与过滤１４２２２Ｕｎｉｅｎｅ．．５．ｇ表达量及表达差异分析１４２．２．６ｃＤＮＡ靠リ备１５２．２．７ＦＵＣＰ基因克隆１５２．２．８克隆产物测序１６２．２．９测序结果与生物信息学分析

6、１７２．２．９．１ＯＲＦ预测与验证１７２．２．９．２蛋白质二级结构预测１７２．２．９．３蛋白质王级结构预测１７２．２．９１７．４蛋白质理化性质的预测２．２．１０条件限制培养基制备及菌株培养１７３结果与分析１８３．１尖抱練刀菌野生型和突变型转录组差异分析１８３丄１ＲＮＡ质量检测１８３丄２转录组测序结果与分析１９３丄２１９．１拼接数据统计分析３．１．２．２转录组ｅＮＯＧ分析１９ｇｇ３．１．２．３表达差异２１３丄２．４ＧＯ表达分析２２３丄２．５ＫＯ分析２２３

7、２３．２差异基因Ｌ〇ｃｕｓ１８０２５与Ｌ〇ＣＵＳ３３２４的确认＿＿３．２．１Ｌｏｃｕｓ１８０２５与Ｌｏｃｕｓ３３２４的差异表达２３＿＿３．２．２Ｂｉａｓ化比对结果２４２７３．３ＦｕｃＰｌ与ＦＵＣＰ２基因蛋白编码区的克隆及序列研究３１ｌ．３．ＦｕｃＰ与ＦｕｃＰ２基因蛋白编码区的克隆２７３．３．２野生型与突变型ＦｕｃＰｌ、ＦｕｃＰ２基因蛋白编码区序列差异分析２８３．３．２．１ＦｕｃＰ１蛋白编码区序列测序结果与分析２８５．３．２ＦＵＣＰ２３１．２蛋白编码区序列测序结果与分析３．４Ｆｕｃ

8、Ｐｌ与ＦＵＣＰ２蛋白结构预测３５一３．４．１ＦｕｃＰ蛋白基