基于转录组的泥东风螺est-ssr标记开发及遗传多样性分析

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1、ｎｎｎｉｉ＾ｎｎｍ＾’＂旨古学位论文基于转录组的泥东风螺ＥＳＴ－ＳＳ民标记开发及遗传多样性分析研究化姓名熊钢指导教师下晓淸教授巧山南研究另－学利－心化水化尘物学’／Ｉ｛川）Ｌ／向遗化食利－－！〇五年一Ｊ１Ｉ１分类号密级ＵＤＣ单位代码１０５３７湖斋农皮乂緣媒女緣您俗Ａ基于转录组的泥东风螺ＥＳＴ－ＳＳ民标记开发及遗传多样性分析ＥＳＴ－ＳＳ民ＭａｒｋｅｒＤｅｖｅｍｅｎｔａｎｄｌｏｐＧｅｎｅｔｉｃＤｉｖｅｒｓｉｔＡｎａ

2、ｌｓｉｓｙｙＢａｓｅｄｏｎＴｒａｎｓｃｒｉｐ１；ｏｍｅｏｆ公口卸／ｏｎ／口口研究生姓名熊钢指导教师王晓清教授曾志南研究其学科专业水生生物学研究方向遗传育种论文答辩日期２０１５．１２．２１觀矮员会主席刘少军论文评阅人张建社、李琪、王昭萍、黄凯、李文红二０—五年十二月独创性声明本人声明所呈交的论文是我个人在指导教师指导下进行的研究工作及取得的研巧成果，除Ｔ文中特别加Ｗ标注和致谢的地方外，论文中不包含。尽我所知其他人己经发表或撰写过的研巧成果，也不包含为获得湖

3、南农业大学或其它教育一机构的学位或证书而使用过的材料。与我同工作的同志对本研究所做的任何贡献均己在论文中作了明确的说明并表示了谢意。研究生签名：时间；－ＺＯＬＴ年ａ月＊＾１日关于论文使用授权的说明，目Ｐ本人完全了解湖南农业大学有关保留、使用学位论文的规定：学校有权保留送交论文的复印件和磁盘，允许论文被查阅和借阅，可Ｗ采用影印、缩印或扫描等复制手段保存、汇编学位论文。同意湖南农业大学可Ｗ用不同方式在不同媒体上发表、传播学位论文的全部或部分内容，并同意将由此产生的收益捐赠给学校教育基金会用于

4、发展研究生教育。（保密的学位论文在解密后应遵守此协议）；又ｏｉｒ研究生签名：时间年Ｕ月日廢、指导教师签名；日；时间皮年蝴＾搞要泥东风螺（公口、妙俗称黄螺，在中国主要分布于海南广西、广东和福建等地，为广盐性、广温性贝类。因其肉质鲜美，营养丰富，近几年已成为国内十分畅销的优质海产巧类，并Ｗ其生长快、价格高等优点，已开发成海水养殖新种类。但因环境变化及过度捕探使野生泥东风螺资源锐减，我国农业部设立公益性科研专项项目Ｗ期恢复和保护泥东风螺资源一。本研究利用新代高通量测序技术获得泥东风螺的

5、－－转录组数据，从中发掘ＥＳＴＳＳ民标记及含有ＥＳＴＳＳＲ序列的生长相关基因，并测定了泥东风螺线粒体全基因组序列然后利用开发的ＥＳＴ－ＳＳ民标记和线粒；体标记基因测序对野生群体进行遗传结构与遗传多样性分析，Ｗ开发的标记对人工养殖Ｆｉ代群体进行生长性状与ＥＳＴ－ＳＳ民标记的关联分析，寻找生长相关的分子标记，期为泥东风螺种质资源保护、人工增殖效果评估和分子标记辅助选育提供参考。主要研究结果如下研究结果如下：１、基于高通量测序的泥东风螺转录姐分析利用高通量测序技术从泥东风螺腹足和巧膜腺混合ＲＮＡ样

6、本中获得１１９１１３，条高质量Ｕｎｅｎｅｓ－１Ｕｎｉｉｇ，筛选得到＆９６２个ＥＳＴＳＳＲ，共有０９，３５９个ｇｅｎｅｓ获得了ＧＯ信息，分析到８，２７２个ｉｓｏｔｉｇ注释上了ＥＣ，参与了Ｚ３２个通路，为泥东风螺基因研究和ＥＳＴ－ＳＳ民标记开发提供了重要资源。２－、含ＥＳＴＳＳ民序列的生长相关基因发掘及克隆从获得的泥东风螺转录组数据中发掘到７个含ＥＳＴ－ＳＳ民序列的生长相关基因，采＇用ＲＡＣＥ技术扩增到其中的ＴＢＣ－－Ａ１基因，但在３非编码区并未发现该重复序列，推断可能存在该家簇蛋白中的另一同

7、型异构体。３、人工养殖Ｆ１代泥东风螺生长性状相关性分析对人工养殖Ｆ１代泥东风螺生长性状分析发现除体螺层高与螺旋部高之外，其它性状之间均存在正相关，对螺重影响由强到弱依次为壳宽、壳曰宽、体螺层高和螺旋部高，这可作为泥东风螺生长性状选育参考指标。－４、泥东风螺ＥＳＴＳＳＲ标记开发从野生泥东风螺个体中开发了具多态性的位点５３个，位点的等位基因数量在２至７之间，平均观测杂合度（斯）为０．４８１３，平均期望杂合度为（／／句为０．４８３２，平均多态信息含量（戶把）为化４６８２，这表明野生个体之间遗传多样

8、性偏低。Ｉ－本研究得到海洋公益性行业科研专项基金（编号：２０１２０日０２１１）资助湖南农业大学博±学位论文５、泥东风螺野生群体遗传多样性分析－ＳＳ民标记引物对广西北海利用开发的ＥＳＴ、福建连江和福建长乐３个野生群体研．１，连江究发现：北海与连江和北海与长乐野生群体遗传距离