俄克拉荷马州囊性纤维化携带者筛查及基因测序分析

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1、俄克拉荷马州囊性纤维化携带者筛查及基因测序分析CysticfibrosiscarrierscreeningandgenesequencinganalysisofOklahoma作者姓名：张建琴专业名称：儿科学指导教师：乔红梅副教授学位类别：医学硕士答辩日期：2015年6月3日中文摘要俄克拉荷马州囊性纤维化携带者筛查及基因测序分析目的：囊性纤维化(cysticfibrosis)是白人中最常见的常染色体隐性遗传病，是由编码囊性纤维化跨膜转录调节因子(cysticfibrosistransmembraneconductanceregu

2、lator,CFTR)蛋白的第7号常染色体上的基因突变引起的。目前认为它在新生儿中的发病率为1/2500-1/3500，由于地域的差异，各个地区本病发病率差异很大，囊性纤维化研究机构估计美国目前有30000名囊性纤维化患者，每29个美国人中就有1个是囊性纤维化携带者。本研究收集俄克拉荷马大学健康科学中心遗传学实验室近11年来的囊性纤维化携带者筛查及基因测序数据，并将观察到的携带者频率同美国大学妇产学院和美国大学医学遗传学和基因组学学院提议的包含23个突变的筛查板检测到的普通人群携带者频率相比较,旨在发现新的突变基因。方法：搜集患

3、者的外周血、羊水细胞、口腔黏膜细胞为标本，应用快速全血提取DNA试剂盒及苯酚氯仿抽提法从中提取DNA。通过CF-IVD试剂盒及ABI3130X1遗传分析仪进行携带者筛查，此筛查板包含32个常见的囊性纤维化基因突变。需要进行基因测序的DNA样本应用BigDyeTerminatorv3.1CycleSequencing试剂盒及ABI3130X1遗传分析仪进行检测，测序结果应用基因突变观察软件进行分析。我们查阅了从2003年到2014年俄克拉荷马大学健康科学中心遗传学实验室的数据库，总共包含2693例测试，携带者筛查占2641例，其中

4、有2495例为产前筛查，基因测序为52例。结果：应用32个突变的筛查板进行产前筛查观察到的携带者频率为1/25,较之前公布的应用23个突变的筛查版检测普通人群的囊性纤维化携带者频率（1：29）偏高。所有检测到的基因突变中最常见的突变基因为∆F508，约占所有突变的73.77%,第二个最常见的突变基因为R117H，约占所有突变的9.02%,同时在基I因测序中发现了一种新的基因突变，为c.3062C＞T。结论:1.依据我们的检测结果，产前筛查检测到的携带者频率较高，分析其原因可能与俄克拉荷马州以白人为主有关，建议所有的孕妇都需要进行

5、产前筛查，降低生育囊性纤维化患儿的风险。2.囊性纤维化所有的突变基因中，最常见的基因突变为∆F508，其次为R117H。3.自1989年发现第一个囊性纤维化突变基因，迄今为止已发现接近2000种基因突变，在我们的研究中又发现了1种新的基因突变，为c.3062C＞T，丰富了囊性纤维化基因突变谱。关键词：囊性纤维化，囊性纤维化跨膜转录调节因子，携带者筛查，基因测序IIAbstractCysticfibrosiscarrierscreeningandgenesequencinganalysisofOklahomaObjectives:

6、Cysticfibrosisisthemostcommonautosomalrecessivegeneticdiseaseinwhitepeople.Thediseaseiscausedbyamutationinthecysticfibrosistransmembraneconductanceregulator(CFTR)geneonChromosome7,whichcodesfortheproteinthatregulateschlorideiontransportbyepithelialcells.Itsneonatalpr

7、evalenceis1in2500-3500,duetotheregionaldifferencesinvariousregions,theincidenceofthisdiseaseisverydifferent.TheCFFoundationestimatesthatthereare30,000individualsaffectedwithCFintheUnitedStatesandthat1:29AmericansareCFcarriers.Thisstudyreviewsdatafromthegeneticslabora

8、toryoftheUniversityofOklahomaHealthSciencesCenter,itincludesthecysticfibrosiscarrierscreeningandgeneticsequencingdata.Evaluatingthe