油菜荚果转录组测序分析及油分相关候选基因的鉴别

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1、分类。单位代叭：密级学号：硕士学位论文中文论文题目：油菜荚果转录组测序分析及油分相关候选基因的鉴别英文论文题目：申请人姓名：孔祥东指导教师：徐海明学科专业：作物学（专业学位）研究方向：生物信息学所在学院：农业与生物技术学院提交日期年月分类号：单位代码：密级：学号：硕士学位论文中文论文题目：袖菜荚果转录组测序分析及油分相关候选基因的鉴别英文论文题目：申请人姓名：孔祥东指导教师：徐诲明学科专业：作物学（专业学位研究方向：生物信息学所在学院：农业与生物技术学院提交日期年月油菜荚果转录组测序分析及袖分相关候选基因的鉴别论文评阅人评阅人评阅人：评阅人评阅人答辩委员会主席：委员资委员係；委员“；二

2、委员委员答辩日期：°TranscriptomeanalysisofBrassicananuspodusingRNA-Seqandidentificationoflipid-relatedcandidategenesThesisreviewer1：：：：：：：：：：斗—浙江大学研究生学位论文独创性声明本人声明所呈交的学位论文是本人在导师指导下进行的研究工作及取得的研究成果。除了文中特别加以标注和致谢的地方外，论文中不包含其他人巳经发表或撰写过的研究成果，也不包含为获得浙江大学或其他教育机构的学位或证书而使用过的材料。与我一同工作的同志对本研究所做的任何贡献均已在论文中作了明确的说明并表示

3、谢意。学位论文作者签名：签字曰期：純年肀月曰学位论文版权使用授权书本学位论文作者完全了解浙江大学有权保留并向国家有关部门或机构送交本论文的复印件和磁盘，允许论文被查阅和借阅。本人授权浙江大学可以将学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索和传播，可以采用影印、缩印或扫描等复制手段保存、汇编学位论文。保密的学位论文在解密后适用本授权书）学位论文作者签名：凡详毛导师签名：签字日期《年对月日签字日期：了年月浙江大学硕士学位论文致谢致谢研究生的三年生涯转眼将过，在求是园经历过艰辛，承担过压力，享受过精彩，获得过成长。即将离开之时，需要感谢的人太多大多。十分感激我的导师徐海明老师，本研究是在

4、徐老师的悉心指导下完成。导师在科研上的谆谆教导使我进步，不仅教我方法，还培养我科学的思维，使我受用终身。导师在工作上更是以身作则，其刻苦专研、孜孜不倦的作风给我留下了深刻的印象，使我能够时刻以老师的精神鞭策自己。生活上也得到了导师的关心和帮助，在此谨向徐老师致以我的爱戴与感激。在这里还要感谢朱军教授，平时有机会聆听到朱老师的教诲，朱老师在学术上的造诣令我敬佩，极大地开拓了我的眼界。也要感谢樊龙江教授，经常能够听取樊老师对生物信息分析的一些建议与讲解，使我收获许多。感谢金谷雷师兄对我的指导，带我入门，教会了我很多知识；感谢童晓然、徐飞师兄在计算机方面的帮助；感谢祁婷、周莉嫒、梁媚媚、李丽

5、萍、余世洲、王继变等师兄师姐在科研上的帮助和生活上的关心；感怀与同窗段忠取、孙喜伟、张海强、林张翔、蒋蓓蓓在各方各面的互相关心和帮助；感谢曹玉杰、潘兵、丁艺、侯挺挺、刘守业、蒋珏等师弟师妹们对我的支持与帮助；同时也要感谢另外一位舍友陈骧，宿舍的生活因为有了你们繁忙之余增添了难得的调节与放松，怀念与你们一起的时光。浓浓父母情哺育我成长至今，他们的关心与支持让我一直无忧无虑。感谢我的父母亲及我的姐姐，即将毕业的我将怀着对他们的挂念，承担起自己的责任，走向未来的路。孔祥东年月日于紫金港浙江大学硕士学位论文目录目录摘要本文缩写词表油菜及油分含量研究油菓概况油分相关代谢途径的生物学研究油菜相关的

6、数量遗传学研究高通量测序技术测序技术概述植物转录组的研究及高通量技术在其中的应用本研究目的和意义第二章材料与方法植物材料与提取建库和测序测序数据质量控制表达分析注释基因功能注释基因的注释与脂质代谢相关基因的比较基因的注释及富集分析区域内基因的分析第三章结果基因表达分析分类分析注释分析区域基因分析油份相关基因分析第四章讨论浙江大学硕士学位论文摘要摘要甘蓝型油菜由白菜、与甘蓝在约年前杂交形成，经过染色体加倍，形成了异源多倍体。在中国乃至世界，油菜是第二大油料作物，中国人的营养供给中占据着很重要的地位。随着测序技术的发展，转录组测序已广泛应用于生命科学的各研究领域。目前油菜全基因组序列已经发

7、表，为转录组水平研究油分含量的遗传发育机制奠定了良好基础。本研究在开花后的三个不同时期，利用二代测序平台对中国品种高油和德国品种的英果进行转录组测序，分析基因差异表迖，并对表达基因进行基因本体和通路分析。随后与拟南芥脂质代谢数据库中的相关基因、油菜油分含量相关等信息等进行整合分析，挖掘和分析候选功能基因。主要结果如下：、相同时期品种问和相同品种不同时期间分别检测到和个显著差异表达基因；、鉴别出八个品种间差异表达基因与拟南芥脂质代谢通路相关基因同