玉米12个农艺性状的全基因组关联分析及玉米氮响应相关基因的鉴定

《玉米12个农艺性状的全基因组关联分析及玉米氮响应相关基因的鉴定》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在学术论文-天天文库。

1、分类号：１００１９：单位代码密级１１２０１０３０：公开学号；Ｂｆ曲少ｔ乂夺博±学位论文玉米１２个农艺性状的全基因组关联分析及玉米氮晌应相关基因的鉴定－ｗｉｉｉＧｅｎｏｍｅｉｄｅａｓｓｏｃｉａｔｉｏｎｓｔｕｄｉｅｓｆｏｒ１２ａｇｒｃｕｌｔｕｒｅｔｒａｔｓｎｍａｉｚｅａｎｄｔｈｅｉｄｅｎｔｉｆｉｃａｔｉｏｎｏｆｍａｉｚｅｎｉｔｒｏｇｅｎｒｅｓｐｏｎｓｅｅｎｅｓｇ研究生：刘志鹏指导教师：赖锦盛教授申请学位类别－：农学博上＼／专业领域名称：作物遗传育种研究方向：

2、作物基因组学’所在学院；农学与生物巧术学院２０１５年１１月独创性声明本人声明所呈交的论文是我个人在导师指导下进行的研究工作及取得的研究成果。尽我所知，除了文中特别加Ｗ巧注和致谢的地方外，论文中不包含其他人已经发表或撰写过的研究成果，也不包含为获得中国农业大学或其它教育机构的学位或证书而使用过的材料一。与我同工作的同志对本研究所做的任何贡献均已在论文中作了明确的说明并表示了谢意。’、研究生签名：矣去Ｉ據时间：ｗ妊，巧一关于论文使用授权的说明、本人完全了解中国农业大学有关保留使用学位论文的规定，即：学校有权

3、保留送交论文的复印件和磁盘，允许论文被查阅和借阅，可Ｗ采用影印、缩印或扫描等复制手段保存、汇编学位论文。同意中国农业大学可Ｗ用不同方式在不同媒体上发表、传播学位论文的全部或部分内容。（保密的学位论文在解密后应递守此协议）！｜＞研究生签名：时间：ｗｊｒ年月巧｜导师签名：时间：Ｊ＾／！月Ｔ少年Ｉ摘要一玉米作为粮食、饲料和经济兼用作物，是全球种植范围最广的作物之，在保障世界粮食安一全方面发挥着举足轻重的作用。玉米的些主要农艺性状直接或者间接的影响着玉米的产量，因此对玉米一些主要农芝性状的研究对于玉米高产稳产具有很重要的现实意义

4、。本研究Ｗ主要来自一中国和美国的７００份优良玉米自交系为研究材料，采用新代测序技术获得覆盖玉米全基因组的高密度ＳＮＰｓ标记，对玉米基因组的核巧酸多态性（ＪＩ），亚群间群体分化（Ｆｓｔ）等参数进行升算，２－并对玉米１个农艺性状展开全基因组关联分析。此外，对郑５８和昌７２在不同氮水平下的穗上叶进行转录组测序，分析不同材料在不同氮水平下的差异表达基因。主要研究结果如下：一？１Ｐ．采用新代测序技术对关联群体重测序，共获得了６６００万的原始ＳＮＰｓ。将原始ＳＮｓ－中缺失率大于０．８，０．１Ｗ及６个深度测序自交系（郑郎，５００３８１１２１７８，７２

5、杂合率大于，，昌？和Ｍｏｌ７）中的杂合位点删除，共得到了２０００万的高质量ＳＮＰｓ。用这些ＳＮＰｓ计算该群体的況－０Ｈ－值为．００６２。按自交系来源可将群体划分为个亚群，即中国自交系ＳＰｕｂｌｉｃ自交系和ＥｘＰＶＰ、Ｕ－－－－自交系ｓｔ值依次０．０２４（ＵＳＰｕｂｌｉｃｋ）０．０化冲国系ＥｘＰＶＰ。Ｓ个亚淸两两么间的Ｆ为中国系，）－－１３（Ｐｕｂ－和０．０ＵＳｌｉｃｋＥｘＰＶＰ）。２．对玉米１２个农艺性状进行两年两点的表型测量，其中包括两个质量性状（穗轴颜色和花丝颜色）和１０个数量性状。对中国自交系和美国自交系系１０个数量性状

6、的表型比较发现有９个性状在两个亚群间存在极显著差异。？ＭＡＦ３．通过基因型缺失位点的推测和最小等位基因频率（ＭＡＦ）的筛选，共得到了９００万＞０．０５的标记用于后续的全基因组关联分析。在评估了群体亲缘关系和群体结构后，使用皮缩的混合线性模型对玉米１２个农艺性状展开全基因组关联分析。对两个质量性状的全基因组关联分析成功的定位到了控制玉米轴色和花丝颜色的／和Ｗ基因；对１０个数量性状的分析共得到了２８／个独立的位点，其中在两个位点中发现了控制开花期的ＺＣＡ８和基因。基于加？性模型这些位点平均可Ｗ解释１６．２％的表型变异率。４Ｘ环．在不同

7、的基因型和氮素水平条件下，９６境互作差异表达基因共鉴定到了个基因型。通过对这％个基因的功能分化发现这９６个基因存在明显的转录因子富集的现象在这些转，而＇＾一录因子中乂口２屈７？￡丑户家族转录因子和肌化１家族转录因子又存在定程度的富集。据此推测，转录因子可能对不同基因型不同氮水平下的氮响应发挥重要的作用。，关巧词：玉米，数量性状，重测序全基因组关联分化氮响应ＩＡｂｓｔｒａｃｔＡｓａｆｏｏｄｆｅｅｄａｎｄｉｎｄｕｓｒｉａｌｃｒｏｍａｉｚｅｉｓｏｎｅｆｈｅｍｏｓｗｉｄｅｌｌａｒｅｄｃｒｏｓｎｅｗｏｒｌｄａｎｄｔｏ

8、ｔｔＵ