玉米重要农艺性状和抗病性状的全基因组关联分析

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1、玉米重要农艺性状和抗病性状的全基因组关联分析ＧＥＮＯＭＥ－ＷＩＤＥＡＳＳＯＣＩＡＴＩＯＮＡＮＡＬＹＳＩＳＯＦＭＡＩＮＡＧ民ＯＮＯＭＩＣＡＮＤＲＥＳＫＴＡＮＣＥＴＲＡ打ＳＩＮＭＡＩＺＥＩＮＢＲＥＤＬＩＮＥＳ博±后姓名；林衡合作导师：王国英流动站一（级学科）名称：生物学专业（二级学科）名称：生物化学与分子生物学研究工作起始时间２０１３年６月２３日研究工作期满时间２０１５年１１月２０日中国农业科学院（北京）２０１５年１１月玉米重要农艺性状和抗

2、病性状的全基因组关联分析－ＷＧＥＮＯＭＥＩＤＥＡＳＳＯＣＩＡＴＩＯＮＡＮＡＬＹＳＩＳＯＦＭＡＩＮＡＧＲＯＮＯＭＩＣＡＮＤＲＥＳＩＳＴＡＮＣＥＴＲＡＩＴＳＩＮＭＡＩＺＥＩＮＢ艮ＥＤＬＩＮＥＳ博±后姓名；林衡合作导师：王国英一流动站（级学科）名称：生物学二）专业（级学科名称；生物化学与分子生物学研究工作起始时间２０１３年６月２３日研究工作期满时间２０１５年１１月２０日中国农业科学院（北京）２０１５年１１月独创性声明本人声明所呈交的论文是

3、我个人在导师指导下进行的研究工作及取得的研巧成果。尽我所知，除了文中特别加标注和致谢的地方外，论文中不包含其他人己经发表或撰写过的研究成果，也不包含为获得中国农业科学院或其它教育机构的学位或证书而使用过的材料一。与我同工作的同志对本研究所做的任何贡献均已在论文中作了明确的说明并表示了谢意。博±后签名；时间年巧方日胃关于论文使用授权的声明，目本人完全了解中国农业科学院有关保留、使用学位论文的规定Ｐ；中国农业科学，、院有权保留送交论文的复印件和磁盘允许论文被查阅和借阅，可

4、Ｗ采用影印缩印或レ扫描等复制手段保存。、汇编学位论文同意中国农业科学院可ッ用不同方式在不同媒体上发表、传播学位论文的全部或部分内容。博±后签名：时间；＾７／／年＂月＾日合作导师签名：时间：又辟＾月，〇日摘要玉米作为重要的粮食、饲料和工业原料，在我国国民经济中占有举足轻重的地位。研究玉米自交系遗传多样性，、杂种优势类群划分及杂种优势模式应用于自交系改良、，可提高组配杂交种的效率，创新及优异种质资源挖掘、利用、缩短育种年限是玉米育种工作的重要基础性研究。本研巧Ｗ玉

5、米自交系为研究对象，基于遗传距离划分优良玉米种质杂种优势群，探讨杂种优势模式３７１１８１１９０）玉米自交系构成的。利用份（东华北民份＆黄淮海区份１自然群体为供试材料，对考察的１５个主要性状进行表型多样巧分析，选取６７７个ＳＮＰ标ｉｌｌ进巧遗传多样性、群体结构分析，并运用基于全基因组扫描的关联分析策略挖掘与，表型性状显著关联标记，进而开展单倍型分析筛选优良种质资源为自交系改良和新品系培育奠定坚实理论基础：。主要研究结论如下１，．玉米自交系表型性状统计分析可知两种生态区内除吐丝期、

6、散粉期和桿粒含水量外的性状变异系数均大于，１０％瘤黑粉病性状在两种生态区下的变异系数分别为１９７．６５％、１９３．０７％；性状正态性检验显示１５个性状均为正态或偏正态分布，充分说明供试关联分析群体存在丰富的表型变异。２．利用６７７１个多态性ＳＮＰ标记分析３７１份玉米自交系的遗传相似系数，其变幅为－０．２７０，５５。ＬＨ２０５７．９９平均为０．与改Ｍ０１遗传相似性最小为０．２７。各品种平均相－５８３似系数变幅为０化，其变异系数较大为３．７７％，表明供试玉米自交系遗传多．３８４

7、样性较为丰富。３，．群体结构分析，根据不同玉米自交系的遗传组成Ｑ含０．５００的自交系划分到相应亚群中，将２８３份材料划分到四个亚群中，各个类群归入材料数目依次为类ＡＡ０１群５８４－７３份、类郑群１份、类ＢＢ０１群１１０份、类昌７２群５９份，并与基于遗传相似一致系数聚类结果基本。４．筛选与性状思著关联的ＳＮＰ位点。东华北区检出２４个强关联位点，其中１０号染色６个，关联性状依次为吐丝期位体检出位点最多为、散粉期、瘤黑粉病、百粒重；－于１号染色体的ＰＺＥ１０１０６３１１３和株高及

8、穗位高关験，位于ＳＹＮ２６２９０１０号染色体的和吐丝期及散粉期关联。黄淮海区检出２２个强关联位点，３号染色体检出位点最多５个，、行粒数为关联性状依次为株高；位于３号染色体的、吐丝期、散粉期ＰＺＥ－１０３０３５７２０和吐丝期及散粉期关联。５．基于与各个性状少数最强关联标记进斤单倍型分析，筛选高产、抗病和早熟自交系。－－－－－－５０％的材料有１１５份，占供试材料的３，４东华北区选择指数含１％其中Ｄ３７６２１１１１和ＬＭ３３ＦＭ选择指数