秦川牛psmc3基因的snp检测及与体尺、胴体性状的关联性分析

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1、分类号:S823.9+2学校代码：10712UDC：636.23研究生学号：2013050552密级:公开级品灶衣林奇教大学2015届全日制硕士专业学位研究生学位论文秦川牛基因的SNP检测及与体尺、胴体性状的关联性分析类型农业推广硕士领域方向养殖研究生李娜指导教师刘小林教授完成时间2015年5月中国陕西杨凌研究生学位论文的独创性声明本人声明：所呈交的全日制硕士专业学位论文是我个人在导师指导下独立进行的研究工作及取得的研究结果；论文中的研究数据及结果的获得完全符合学校《关于规范西北农林科技大学研究生学术道德的暂行规定》，如果违反此规定，一切后果

2、与法律责任均由本人承担。尽我所知，除了文中特别加以标注和致谢的地方外，论文中不包含其他人已经发表或撰写过的研究结果，也不包含其他人和自己本人已获得西北农林科技大学或其它教育机构的学位或证书而使用过的材料。与我一同工作的同事对本研究所做的任何贡献均已在论文的致谢中作了明确的说明并表示了谢意。研究生签名:时间：2WS年彡月/日导师指导研究生学位论文的承诺本人承诺：我的全日制硕士专业学位研究生所呈交的硕士学位论文是在我指导下独立开展研究工作及取得的研究结果，属于我现岗职务工作的结果，并严格按照学校《关于规范西北农林科技大学研究生学术道德的暂行规定》

3、而获得的研究结果。如果违反学校《关于规范西北农林科技大学研究生学术道德的暂行规定》，我愿接受按学校有关规定的处罚处理并承担相应导师连带责任。导师签名:时间:如J年〈月夕曰关于研究生学位论文使用授权的说明本学位论文的知识产权归属西北农林科技大学。本人同意西北农林科技大学保存或向国家有关部门或机构送交论文的纸质版和电子版，允许论文被查阅和借阅；同意西北农林科技大学将本学位论文的全部或部分内容授权汇编录入《中国优秀硕士学位论文全文数据库》进行出版，并享受相关权益。本人保证，在毕业离开（或者工作调离）西北农林科技大学后t，发表或者使用本学位论文及其相

4、关的工作成果时，将以西北农林科技大学为第一署名单位，否则，愿意按《中华人民共和国著作权法〉〉等有关规定接受处理并承担法律责任。任何收存和保管本论文各种版本的其他单位和个人(包括研究生本人)未经本论文作者的导师同意，不得有对本论文进行复制、修改、发行、出租、改编等侵犯著作权的行为，否则，按违背《中华人民共和国著作权法》等有关规定处理并追究法律责任。(保密的学位论文在保密期限内，不得以任何方式发表、借阅、复印、缩印或扫描复制手段保存、汇编论文）研究生签名：时间：1丨5年/月I日导师签名:^4时间：年6月彡曰Classificationcode:S

5、823.9+2Universitycode:10712UDC:636.23Postgraduatenumber:2013050552Confidentialitylevel:PublicThesisforMaster’sDegreeNorthwestA＆FUniversityin2015SNPSDETECTIONOFPSMC3GENEANDTHERELATIONSHIPWITHBODYMEASUREMENTANDCARCASSTRAITSINQINCHUANCATTLEType:AgriculturalExtensionResearchfie

6、ld:FeedingNameofPostgraduate:LiNaAdviser:Prof.LiuXiaoLinDateofsubmission:May,2015YanglingShanxiChina秦川牛PSMC3基因SNP检测及与体尺、胴体性状的关联性分析摘要PSMC3基因（ATP酶亚基3）定位于牛9号染色体上，全长约8059bp，共有12个外显子。目前对PSMC3基因的研究主要集中在人类以及小鼠上，而在秦川牛上则未见相关报道，以PSMC3基因作为影响秦川牛体尺及胴体性状的候选基因，探索其与秦川牛体尺及胴体性状的相关性，具有重要的研究价值

7、。本文以秦川牛PSMC3基因为候选基因，首先利用软件DNAman、ProtScale、Netphos、TMHMM、Predictprotein对牛PSMC3基因进行生物信息学分析。然后选取167头在同等条件下饲养的24月龄健康秦川牛为研究对象，通过混合DNA池、测序、PCR-RFLP等技术，检测了PSMC3基因的SNPs位点，并将检测到的位点与秦川牛的体尺性状进行关联分析。研究结果如下：1.PSMC3基因生物信息学分析牛PSMC3基因CDS区共8059bp；亲水性氨基酸占多数为亲水性蛋白；潜在磷酸化位点丝氨酸11个、苏氨酸5个、络氨酸4个；蛋

8、白没有跨膜结构区域；蛋白质二级结构有α-螺旋占44.77%，β-折叠占12.05%，无规则卷曲占43.18%。2.PSMC3基因的遗传变异检测利用测序及PCR-RF