粗粒度下流感病毒基因网络信息的建模与应用

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1、分类号密级硕±学位论文题目；粗粒度下流感病毒基因网络信息的建模与应用英文并歹（；Ｍｏｄｅｌｉｎｏｆｅｎｅｎｅｔｗｏｒｋｉｎｆｏｒｍａ１题目ｇｇｔｉｏｎｏｆｉｎｆｌｕｅｎｚａｖｉｒｕｓｅｓａｎｄｉｔｓａｌｉｃａｔｉｏｎｉｎｃｏａｒｓｅａｉｎｓａｃｅｐｐ巧ｐ研究生；李巍巍专业：应用数学研究方向；生物信息学导师；唐旭清指导小组成员；－０－学位授予日期；２０１６１０４答辩委员会主席；潘正华江南大学地址：无

2、锡市露湖大道１８００号二〇—五年十二月魏勸牲黄明本人芦明所呈交的学俭论文是本人杏导插籍导下幾巧始研究工作及取得的巧巧成果。尽我巧知，除了文中特别棚巧标注巧致磯的地方外，论文中不包含其他人己经发表或銭写鼓的硏宛咸果，也不包含本人为获得江南大学或其皂教窗拆构的攀位或证书而使用过的材稱。与我一同工作的罔志烁本研巧巧傲的任何贡献均己巧论文中作了明？确的谈明并表示谢念。签名：去４航曰期：年／＜？月曰关于论文使用援较巧说巧本学位论文作者完全了解江南大学有关保留、嫂用

3、学位论文的规定：化南大学有较保留并向国家有关都口或轨构送交论文的复印俾和後盘，化许论文被査词巧借滅，可巧将学位论文的全部或部分巧容滅入有关数据库进行检索，可Ｗ巧用影窗、缩印或扫插等复剝手段探存、一致汇编学位论文，并且本人电子文档的巧容和纸质论文的巧容相。保密的学位论文在解密盾也遵守此规定。签名！卖槪裝导师签名：日期：句巧作月；＾摘要本文在粒度计算的理论基础上，构造基于模糊邻近关系的优化结构聚类，结１合氨基酸的理化性质流感病毒的生物网络结构，对Ｈ１Ｎ１

4、流感病毒的，建立Ｈ１ＮＨ１Ｎ１：特性进巧分析，丰富了流感病毒研究结果。具体工作如下一章中在第，简要介绍了生物信息学及生物网络、粒度计算理论与优化聚类指标、甲型Ｈ１Ｎ１流感病毒蛋白序列、Ｗ及本文的主要工作与创新点。在第二章中，在传统表征蛋白质序列的４０维特征向量的基础上，依据氨基酸的种类与理化性质，将蛋白质序列４０维向量分解为２０维、４维和１６维等３。种子特征向量描述利用系统聚类与相关性分析方法，在不影响表征流感病毒结构聚类的前提下，用表征蛋白质序列的１６维特征向量替换已有的

5、４０维特征向量。，在第二章的基础上在第Ｈ章中，结合ＨＡ与ＮＡ蛋白特性，构造新的流感病９０２－９９条Ｈ毒表示方法，并应用其研究发生在１２０巧年间的％１Ｎ１流感病毒蛋，８白序列。利用分层聚类，获得Ｈｉｍ流感病毒的最优聚类结果。结合选取代表元及构造进化树的方法，分析了ＨＡ与ＮＡ蛋白结构与化Ｎ１流感病毒的爆发与扩散之间的关系。在第四章中，基于模糊粒度空间理论，研巧并证明类间偏差与类内偏差的性一。。质在此基础上，提出种新的优化指标及相应的优化聚类算法结合第Ｈ章中０２－２０化Ｎ１提

6、出的流感病毒蛋白序列的表示方法，建立发生于１９１３年间的流感病毒的最优两层网络结构。结果表明新方法的合理性和有效性Ｗ及流感病毒分层结构模型的有效性。在第五章中一，对全文工作进行总结，并分析下步可能的研究方向与思路。１Ｎ１流感病毒ＨＡＮＡ关键词：粒度计算；Ｈ；持征向量；与蛋白；聚类优化指标ＩＡｂｓ＾ａｃｔＡｂｓｔｒａｃｔＩｎｔｈｉｓａｅｒｂａｓｅｄｏｎｔｈｅｔｈｅｏｒｙｏｆｒａｎｕｌａｒｃｏｍｕｔｉｎｔｈｅｓｔｒｕｃｔｕｒａｌｃｌｕｓｔｅｒｉｎｐｐ，

7、，ｇｐｇｇｏｆｆｉ－ｉｚｚｙｐｒｏｘｉｍｉｔｙｒｅｌａｔｉｏｎｉｓｃｏｎｓｔｒｕｃｔｅｄ．ＣｏｍｂｉｎｅｄｗｉｔｈｔｈｅｐｈｙｓｉｃａｌｃｈｅｍｉｃａｌｒｏｅｒｔｅｓｏｆａｍｉｎｏａｃｉｄｓｅｓｔｒｕｃｔｕｒｅｏｆＨｌＮｌｉｎｆｌｕｅｎｚａｖｉｒｕｓｉｓｅｓｔａｂｌｉｓｈｅｄａｎｄｔｈｅｐｐｉ，ｔｈｃｈａｒａｃｔｅｒｉｓｔｉｃｓｏｆＨｌＮｌｉｎｆｌｕｅｎｚａｖｉｒｕｓａｒｅａｎａｌｙｚｅｄ．Ｔｈｅｒｅｓｅａｒｃｈｒｅｓｕｌｔｓ

8、ｏｆＨｌＮｌｉｎｆｌｕｅｎｚａｖｉｒｕｓａｒｅｅｎｒｉｃｈｅｄ．Ｔｈｅｓｐｅｃｉｆｉｃｗｏｒｋｓａｒｅａｓｆｏｌｌｏｗｓ：Ｉｎｃｈａｔｅｒｏｎｅｔｈｅｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓａｎｄｂｉｏｌｏｉｃａｌｎｅｔｗｏｒｋｒａｎｕｌａｒｃｏｍｕｔｉｎｇｐ，ｇ，ｇｐｔｈｅｏｒａｎｄｏｔｉｍｉｚａｔｉｏｎｃｌｕｓｔｅｒｉｎｉｎｄｅｘｓｅｕｅｎｃｅａｎｄｓａｔｉａｌｓｔｒｕｃｔｕｒｅｏｆ