ChemOffice软件的操作与使用

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1、第二章化学编辑排版和分子模拟计算第二章化学编辑排版和分子模拟计算第二部分ChemOffice软件的使用目录2.1简介2.2ChemDraw的使用2.3Chem3D的使用2.4ChemFinder的使用分子式和结构式是化学家的语言化学办公软件主要内容第一部分:化学结构绘制软件ChemWin1.ChemWin简介2.键、环、箭头箭头工具3.编辑工具、原子标记、轨道、组合工具、菜单命令等第二部分:集成化学软件桌面系统ChemOffice1.ChemDraw2.Chem3D3.ChemFinder第三部

2、分:数学公式及长篇文章排版1.Mathtype2.长篇文章排版2.1简介美国剑桥(CambridgeSoft)公司(http://www.cambridgesoft.com)其最新版本ChemOfficeUltra2010是目前世界上最优秀、最重要和最权威的桌面化学办公应用软件,集强大的应用功能于一身,为化学工作者提供了优秀的化学辅助系统。它既可以轻松的绘出分子结构图和化学反应方程式、实验室仪器装置和化学工艺流程图等,并应用到字处理软件中;而且可以将化合物名称直接转为结构图,省却绘图的麻烦;也可

3、以对已知结构的化合物命名,给出正确的化合物名称。包含三大模块1.ChemDraw模块——化学结构绘图是世界上最受欢迎的化学结构绘图软件,是国际上论文期刊指定的格式。2.Chem3D模块——分子构型与仿真分析具有完整的界面及功能,提供工作站级的3D分子轮廓图及分子轨道特性分析,并和数种量子化学软件结合在一起。3.ChemFinder模块——化学信息搜寻整合系统智能型的快速化学搜索引擎。可以建立化学数据库、储存及搜索,也可以使用现成的化学数据库。2.2ChemDraw的使用2.2.1概述2.2.2化

4、学结构绘图2.2.3ChemNMR-核磁谱的计算2.2.4ChemProp-分子物理化学性质计算和标准命名2.2.5原子轨道和分子轨道图的制作ChemDraw可在Win9X/Win2000/WinXP下运行。双击,程序打开后,窗口主界面与一般Windows软件相似,依次为菜单栏、工具栏和文档区以及状态栏,工具栏提供了很多常用的化学分子及化学键。使用时只用鼠标点一下工具栏中所需工具,移动鼠标到编辑区后,鼠标指针变为“+”,再在文档区的合适位置点击鼠标,则分子结构式就会出现,使用十分方便支持Wind

5、ows剪贴板,所有结构式可以方便地剪贴到Word文档中,而当要修改时,只需在Word文档中双击结构式,即可打开ChemDraw进行修改。2.2.1概述ChemDraw奉行的理念是:化学家能懂的,ChemDraw也应该能懂ChemDraw是ChemOffice中使用最为频繁的组件结构工具栏主工具栏格式栏绘图区模板工具栏菜单栏状态栏主界面14套索实键双键虚键切割键切割楔键黑体键黑体楔键空心楔键波浪键表格长链环丙烷环环戊烷环环庚烷环环己烷椅式环戊二烯环蓬罩橡皮文本笔箭头轨道绘图元素基元化学符号弧形原子

6、反应模板环丁烷环环己烷环环辛烷环环己烷椅式苯环模板箭头、轨道、绘图元素、括弧、化学符号、询问工具模板氨基酸模板芳香族、双环、生物艺术模板玻璃仪器模板构象异构体模板环戊二烯、环烷模板DNA、RNA模板官能团模板己糖模板苯环模板多面体模板立构中心模板超分子模板垂直工具栏上的【模板】按钮包含了常用的和重要的模板如多种较复杂的分子种类和玻璃仪器模板绘图实例绘制阿司匹林结构式利用模板按左图绘制出简式;单击选取框按钮,选中画好的阿司匹林结构式;执行【Structure】/【CleanUpStructure】

7、菜单命令,整理图形到最佳状态。图形存盘ChemDraw文件的扩展名为“cdx”,执行【File】/【SaveAs】菜单命令,即可保存。图形的旋转与缩放检查结构错误和整理结构式根据化合物名称得到结构式根据结构得出化合物命名预测核磁共振化学位移分子结构估计性质元素周期表符号、字体和颜色快捷菜单和快捷键绘制化学反应式绘制实验装置执行【Structure】/CheckStructure】功能自动执行执行【Structure】/【ConvertNametoStructure】菜单命令如aspirin、ED

8、TA、morphine、2-acetoxybenzoicacid等2.2.2结构绘制功能1.简单的无机反应式和有机分子式ChemDraw中可以一次性输入反应式文本,在应用“Formula”进行优化,其Formula格式化的智能程度较其他软件有所增强。2.Fischer(费舍尔)投影式3.Haworth(霍沃思)投影式4.Newman(纽曼)投影式5.立体化学1.Fischer(费舍尔)投影式文本工具单键工具下图为葡萄糖分子的Fischer投影式首先使用单键绘制工具建立主碳链接,重点是要确保下一个

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