《植物DNA分子标记》PPT课件

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1、植物DNA分子标记分子标记的概念广义的分子标记（molecularmarker）：可遗传的并可检测的DNA序列或蛋白。包括蛋白质标记和DNA标记（狭义的分子标记）。蛋白质标记包括动植物蛋白、同工酶及等位酶理想的分子标记：1.高多态性2.共显性遗传*3.能明确辨别等位基因4.遍布整个基因组5.无基因多效性**6.检测手段简单快速7.成本低廉8.重复性好*杂合子的一对等位基因各自都具有自己的表型效应，称为共显性（codominance）**基因多效性（genepleiotropism）：一个基因产生多种表型效应的现象。DNA分子标记（DNAmolecularm

2、arker）直接在DNA分子水平上检测生物间的差异，是DNA水平上遗传变异的直接反应。随着分子生物学技术的发展，现在DNA分子标记技术已有数十种，广泛应用于遗传育种、基因组作图、基因定位、物种亲缘关系鉴别、基因库构建、基因克隆等方面。DNA分子标记大多以电泳谱带的形式表现，分为非PCR依赖的分子标记(基于Southern杂交技术的分子标记)和PCR依赖的分子标记。非PCR依赖的分子标记(基于Southern杂交技术的分子标记)包括：限制性片段长度多态性标记（restrictionfragmentlengthpolymorphism,RFLP）原位杂交（in

3、situhybridization）PCR依赖的分子标记：随机扩增多态性DNA标记（randomamplificationpolymorphismDNA,RAPD）DNA扩增指纹印记（DNAamplificationfingerprinting,DAF）简单序列重复标记（simplesequencerepeat,SSR）随机引物聚合酶链式反应（arbitrarilyprimedPCR,AP-PCR）扩增片段长度多态性标记（amplifiedfragmentlengthpolymorphism,AFLP）基于分子杂交技术的分子标记技术此类标记技术是利用限制性

4、内切酶解及凝胶电泳分离不同的生物DNA分子，然后用经标记的特异DNA探针与之进行杂交，通过放射自显影或非同位素显色技术来揭示DNA的多态性。分子杂交：由具有互补碱基顺序的任何两条单链核酸分子片断形成双链的过程。染色体原位杂交是指DNA探针与染色体上的DNA杂交，并在染色体上直接进行检测的分子技术，其原理是两条核苷酸单链片断在适宜的条件下，通过氢键结合，形成DNA-DNA，DNA-RNA，RNA-RNA双键分子，用带有标记的DNA或者RNA片断作为核酸探针，与细胞内染色体杂交，用放射自显影等方法予以显示，在荧光显微镜下观察目的mRNA或者DNA的存在与定位。

5、InsituhybridizationForinsituhybridization,atissuesampleisincubatedwithalabelednucleicacidprobe,excessprobeiswashedawayandthelocationofhybridizedprobeisexamined.Thetechniqueenablesthespatiallocalizationofgeneexpressiontobedeterminedaswellasthelocationofindividualgenesonchromosomes.

6、bcdaFig.5GISHimagesofchromosomesoftetraploidanddiploidFestuloliumprogenies.TheDNAofL.perennewasusedasprobe,andshownasbluecolor.ThechromosomesofF.pratensiswereshownaspalebluecolor.Translocationbreakpointsareindicatedinaandcbyarrows.(a)Bx350-184,a28-chromosomegenomewithatleast14inte

7、rgenerictranslocations,someofwhichhavetwobreakpointsinanarm(arrows).Bar:10μm.(b)Bx351-160,a28-chromosomegenomewithintergenerictranslocations.Bar:20μm.(c)Bx350-177withfertilepollen,a28-chromosomegenomecomprisingapproximatelyequalamountofLoliumandFestucaDNAwith9intergenerictransloca

8、tions,someofwhichhavetwobreakpoin