白菜叶形发育相关基因BrLOM2的克隆与表达分析

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1、园艺学报,2016,43(10):2029–2038.ActaHorticulturaeSinicadoi:10.16420/j.issn.0513-353x.2016-0252;http://www.ahs.ac.cn2029白菜叶形发育相关基因BrLOM2的克隆与表达分析*张淑娟,闫芳芳,鱼昭君,张明科,惠麦侠(西北农林科技大学园艺学院,农业部西北地区园艺作物生物学与种质资源创新重点实验室,陕西杨凌712100)摘要:为了揭示白菜(Brassicarapassp.chinensis)BrLOM2基因在叶发育中的调控机制,以

2、白菜圆叶、裂叶近等基因系为材料,同源克隆得到BrLOM2基因,分析其时空表达特性及对激素的响应。结果显示,BrLOM2的ORF全长为549bp,编码182个氨基酸,含有GRAS家族保守结构域,定位于细胞核,两种材料中的氨基酸序列在保守结构域存在两处突变。进化分析表明,BrLOM2属于十字花科LOM2分支,与大白菜(XP_009138823.1)亲缘关系最近。RT-PCR结果显示,BrLOM2在圆叶白菜中的表达量高于同期裂叶白菜,两种材料茎尖、第1片叶中表达量最高;裂叶中的表达量与叶缘裂刻数呈现同步增加的趋势,6-BA和GA3分

3、别抑制和促进叶片中的表达,说明BrLOM2低表达可能是裂叶表型产生的主要原因。关键词:白菜;LOM2;裂叶;基因克隆;表达特性中图分类号:S634.3文献标志码:A文章编号:0513-353X(2016)10-2029-10CloningandExpressionAnalysisofBrLOM2,aGeneInvolvedinLobedLeafDevelopmentinPakchoi*ZHANGShu-juan,YANFang-fang,YUZhao-jun,ZHANGMing-ke,andHUIMai-xia(KeyLabo

4、ratoryofHorticulturalPlantBiologyandGermplasmInnovationinNorthwestChinaofMinistryofAgriculture,CollegeofHorticulture,NorthwestA&FUniversity,Yangling,Shaanxi712100,China)Abstract:Toelucidatethemechanismunderlyingdevelopmentofleafmarginallobesinpakchoi,anLOM2homologou

5、sgene,BrLOM2,wasisolatedrespectivelyfromnear-isogeniclineswithandwithoutlobedleavesinpakchoiusingthehomology-basedcloningmethods.TheBrLOM2genecontainsanopenreadingframeof549bpinlengthencodingaproteinof182aminoacids.SequenceanalysisshowedthattheBrLOM2proteincontained

6、conservativestructuredomainsoftheGRASfamily.TheBrLOM2sequencefromgenomicDNAshowednointronandphylogeneticanalysissuggestedthatBrLOM2shareshighhomologywithknownLOMsfromotherplantspecies.Moreover,theputativeBrLOM2proteinwascloselyclusteredwithseveralBrassicaLOMs.qRT-PC

7、RanalysisrevealedthatBrLOM2genehashigherexpressioninleavesandshootapexes,andlowerexpressioninflowers.Furthermore,BrLOM2genehashigherexpressionlevelinpakchoilineswithsmoothleavesthaninthelineswithlobedleaves.Theexpression收稿日期:2016–06–23;修回日期:2016–08–05基金项目:国家自然科学基金项目

8、(31372062,31272164);陕西省农业科技创新与攻关项目(2015NY103)*通信作者Authorforcorrespondence(E-mail:Maixiahui@163.com)ZhangShu-juan,YuZhao-jun,YanFang-fang,Z

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