基于选择牵连效应的标记_性状关联分析方法简介

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1、维普资讯http://www.cqvip.com遵HEREDITAS(Beijing)2007年7月ISSN0253-9772WWW．chinagene．CI3技术与方法DOI：10．1360／yc-007-0881基于选择牵连效应的标记／性状关联分析方法简介游光霞，张学勇中国农业科学院作物科学研究所，农业部作物品种资源与生物技术重点实验室，北京100081摘要：许多重要农艺性状如产量、品质、抗逆性等多表现为数量性状，是由多个基因和环境共同作用的结果，对其遗传基础的研究比较困难。近年发展起来的以选择牵连效应分析为基础，通过标记，性状之间的关联分析方法为这些性状的作图和遗传

2、解析提供了新的手段，也为作物的分子设计育种提供了新的思路，其与QTL作图结果互相验证、互相利、充，必将促进数量遗传学、应用基因组学和育种学的发展。文章对关联分析的思路、方法、优缺点及应用时应注意的问题进行了比较系统的介绍关键词：数量性状；连锁不平衡作图；选择牵连效应；关联分析Identificationofimportantgenesbymarker-traitassociationanaly-sisbasedonhitchhikingmappingYoUGuang-Xia．ZHANGXue-YongKeyLaboratoryofCropGermplasm正BfDf已c^

3、，lDfDg)‘MOA，InstituteofCropSciences，ChineseAcademyofAgriculturalSciences，Beijing100081，ChinaAbstract：Mostagronomictraitssuchasyield，qualityandstress—toleranceofcropsarequantitativetraits，Itisnoteasytodissectgeneticbasisofthesetraitsbecausetheyarecontrolledbymulti—genesthatareafectedbyenvi

4、ronmentalfactors．HitchhikingmappingoffersanewmethodforidentifyingoflocicontrollingthosetraitsandassessingtheirallelicvariationsMarker-traitassociationanalysisbasedonthehitchhikingefectswillplayanimportantroleindissectionofcomplextraits．Combinationofquantitativetraitloci(QTL)mappingwithmar

5、ker-traitassociationanalysiswillfacilitatedissectionofcomplextraits，resultinginimportantinformationandmarkersformolecularbreedingbydesignincrops，Inthisreview，wepresentedabriefintroductionofhitchhikingefects，marker-traitassociationanalysisandpracticalconsiderations，Keywords：quantitativetra

6、its；linkagedisequilibrium(LD)；hitchhikingefect；associationanalysis不断提高作物产量、改善品质、增强品种的抗量性状和由多基因控制的数量性状。作物的许多重病性和适应性、提高水肥利用效率是现代育种的主要农艺性状，如产量、营养加工品质、抗逆性等多要目标。品种的改良有赖于所掌握资源的数量和对表现为数量性状。由于数量性状受环境的影响较大，其农艺性状遗传基础的了解与掌握的程度。作物的因此对其遗传基础的研究比较困难。随着基因组学性状可分为两类，即由单基因(或寡基因)控制的质的发展和生物统计软件的完善，特别是分子标记技收稿日

7、期：2006-11-23；修回日期：2007—02—04基金项目：国家重点基础研究(编号：2004CB117202)及国家高技术研究发展计划项目(国家863计划)(编号：20060110Z1136)资助项目[SuppoSedbytheChineseMinistryofScience(No．2004CB117202)andChineseNationalProgramsforHighTechnologyResearchandDevelop-ment(863Program)(No．20060110Z1136)】作者简介：游光霞(19