利用ISSR分析栗疫病菌群体遗传多样性

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1、农业生物技术学报JournalofAgriculturalBiotechnology2008,16(4):701~705·研究论文·利用ISSR分析栗疫病菌群体遗传多样性*许利强, 李涛, 王克荣** (南京农业大学植物保护学院,南京210095)摘要:采用ISSR分子标记技术,对中、日、意和美4个栗疫病菌()群体的遗传多样性和遗传分化进行了分析。自53个ISSR引物中筛选出11个引物,对4个群体的栗疫病菌11个子群体220个菌株进行扩增,共检测到177个位点,其中多态位点为174个,多态位点百分率(

2、)为98.31%。11个栗疫病菌子群体的平均值为20.43%;群体水平Shannon信息指数()和Nei指数()分别为0.1769和0.7386;各个子群体和平均值分别为0.0943和0.0614。比较表明:中、日、意和美栗疫病菌群体间具有较高的遗传多样性。栗疫病菌群体间的基因分化系数()为0.7386,基因流()为0.1769,11个子群体间的遗传距离平均为0.2289。利用算术平均数的非加权成组配对法(UPGMA)对栗疫病菌11个子群体进行聚类,结果可分为3大类群。关键词:栗疫病菌;简单重复序列间

3、多态性;群体遗传结构;遗传分化中图分类号:S188文献标识码:A 文章编号:10061304(2008)04070105GeneticDiversityof PopulationsbyISSRAnalysis XULiqiang,LITao,WANGKerong** Geneticdiversityandgeneticdifferentiationof4populationsfromChina,Japan,Italyandthe USAwereanalyzedbyintersimplesequence

4、repeat(ISSR).Using11primersfiltratedfromtotal53primers,twohundredandtwenty individualsfrom11. subpopulationsofthe4populationswereamplifiedbyISSR,and174polymorphiclociweredetectedfromtotal177loci.Thepercentageofpolymorphicloci()ofthetotalpopulationswas98

5、.31%,whiletheirsubpopulationlevel averaged20.43%.Shannon’sinformationindex()andNei’sgenediversity()ofthefungusatthetotalpopulationslevelwas0.1769and0.7386,respectively.Themeanofandatthesubpopulationlevelwas0.0943and0.0614,respectively,whichindicatedthat

6、thegeneticdiversityofbetweenthepopulationswasrelativelyhigh.Thegeneticdifferentiationcoefficient()amongpopulationswas0.7386.Thegeneflow()amongpopulationswaslowdownto0.1769.Themeanofpairwisegeneticdistancebetween11subpopulationswas0.2289.These11subpopula

7、tionscouldbeclusteredintothreegroupsusingunweightedpairgroupmethodwitharithmeticmean(UPGMA). ;intersimplesequencerepeat(ISSR);populationgeneticstructure;geneticdifferentiation近年来,随着我国经济的发展,板栗的市场行情家也陆续被发现,半个多世纪的时间,该病害在北美逐年看长,农民种植板栗的积极性有了极大提高。但及欧洲逐步蔓延,一些地

8、区栗树遭到了毁灭性的威是,板栗树上发生的病虫害严重制约着果实的产量胁,给当地经济造成了严重的损失,生态环境也受到和质量,尤其是栗疫病菌()的恶性影响(Anagnostakis,1987;Roane.,1986; 发生,更能使其减产甚至全株死亡。栗疫病菌是能够Gretne,1965)。我国的栗疫病分布广泛(Shearand 引起栗树(spp.)主枝杆树皮的腐烂并导致Stevens,1913),部分地区发生也比较严重,但是并未整个植株死亡的一种子囊菌,这一病

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