缢蛏6个群体遗传结构的issr分析

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1、应用与环境生物学报2009,15(3):332~3362009-06-25ChinJApplEnvironBiol=ISSN1006-687XDOI:10.3724/SP.J.1145.2009.00332*缢蛏6个群体遗传结构的ISSR分析牛东红李家乐**冯冰冰刘达博(上海海洋大学省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室上海200090)摘要采用ISSR分子标记对采自福建宁德(ND)、浙江台州(TZ)、上海崇明(CM)、山东海阳(HY)、天津汉沽(HG)和辽宁庄河(ZH)的缢蛏6个野生群体进行遗传多样性和遗传关系分析.筛选出10条ISSR引物对6个群体共216个样

2、品进行扩增,共得到138个�晰的扩增位点,其中多态性位点135个,多态位点百分率为97.83%,在物种水平上的遗传多样性较为丰富.群体遗传多样性分析结果表明,6个群体的多态位点百分率在61.59%~72.46%之间,基因多样性指数和Shannon’s信息指数分别在0.1043~0.1766和0.1789~0.2808之间,其中ND群体的多样性指数最低.群体间遗传分化、遗传距离和聚类结构显示,ND群体和TZ群体亲缘关系最近,首先聚为一支,之后依次与CM群体及HG群体和HY群体聚类,最后与ZH群体聚在一起,表明地理位置较远的群体,遗传距离也较远.图2表5参27关键词缢蛏;群体

3、遗传;遗传结构;ISSRCLCQ959.215.03ISSRAnalysisonGeneticStructureofSixSinonovaculaconstrictaPopulations*NIUDonghong,LIJiale**,FENGBingbing&LIUDabo(KeyLaboratoryofExplorationandUtilizationofAquaticGeneticResources,ShanghaiOceanUniversity,MinistryofEducation,Shanghai200090,China)AbstractThegeneticst

4、ructureo��sisi��geographicpopulationsogeographicpopulationso��therazorclamtherazorclamSinonovaculaconstrictaalongthecoasto��Chinawasinvestigatedbytheinter-simplesequencerepeat(ISSR).Thesi��populationswerenamedasNDinNingdeCityo��Fujian,TZinTaizhouCityo��Zhejiang,CMinChongmingIslando��Shang

5、hai,HYinHaiyangCityo��Shandong,HGinHanguDistricto��TianjinandZHinZhuangheCityo��Liaoning.O��the138ISSRlocitested,135(97.83%)werepolymorphicwith10ISSRprimers.Thenumbero��alleles(N),e����ectivenumbero��alleles(N),Shannon’sin��ormationinde��(I),meanNei’saegenediversity(H),percentageo��polymo

6、rphicbands(PPB),averagevalueso��H,H,andG��orpairwisesubpopulationsweretsstanalyzedwithPOPGENE.Theresultsshowedthatthevalueso��PPB,IandHwere61.59%~72.46%,0.1043~0.1766and0.1789~0.2808,respectively��orthesi��populationswiththelowestvaluesinNDpopulation.TheUPGMAtreebasedontheNei’geneticident

7、ityshowedthatNDwasclusteredwithTZintooneclad,thenwithCM,HYandHG,andfinallywithZH.Fig2,Tab5,Re��27KeywordsSinonovaculaconstricta;populationgenetics;geneticstructure;ISSRCLCQ959.215.03缢蛏(Sinonovaculaconstricta,Lamarck)俗称蛏子、泥作简单、稳定、可重复性好及多态性高等优点,被广泛应用蛏或蜻,属软体动物门(Mollusc

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