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《2009-2013年无锡地区新甲型H1N1流感病毒基因变异分析》由会员上传分享,免费在线阅读,更多相关内容在工程资料-天天文库。
1、第一作者:马广源手机号码:15152221329单位名称:无锡市疾病预防控制中心通讯地址:无锡市金城路499号电子邮箱:mgy2004165@163.com8基金项目:江苏省卫生厅指令性计划项目(H200956),江苏省预防医学科研项目(Y201026),无锡市科技指令性计划项目(CSE009012,CSZ00955,CSZ01051)。作者单位:无锡市疾病预防控制中心(江苏无锡214023)作者简介:马广源(1979~),男,硕士,主要从事病毒病检测。邮箱:mgy2004165@163.com2009-2013年无锡地区新甲型H1N1流感病毒基因变异分析马广源*尤凤兴凌霞肖勇孙纳吴
2、家林季亚勇钱燕华(无锡市疾病预防控制中心无锡214023)[摘要]目的:了解2009-2013年无锡地区新甲型H1N1流感病毒HA和NA的基因变异情况。方法:选取哨点医院送检的新甲型H1N1流感病毒,进行血凝素(HA)和神经氨酸酶(NA)核苷酸序列测定,用Bioedit和MEGAversion4.0分析软件进行基因种系进化特性分析。结果:2009-2013年新甲型H1N1流感病毒HA基因序列的同源性为98.9-99.5%,第203位无锡地区的毒株与国内、国际代表株不同,氨基酸替换为S-T;在83位和321位无锡地区毒株与国内代表株相同,而与国际代表株不同,分别为S-P、V-I;NA基
3、因序列与国内、国际代表株高度同源,同源性为99.2-99.8%。仅有个别的氨基酸发生替换,在87位和349位无锡地区毒株与国内代表株相同,而与国际代表株不同,分别替换为R-Q、D-G。结论:通过对HA和NA基因序列的比对分析,新甲型H1N1流感病毒从2009年出现到2013初再次流行,基因序列与国内、国际代表株高度同源。这样表明,新甲型H1N1流感病毒在近期不会发生大的流行。[关键词]流感病毒;新甲型H1N1流感病毒;血凝素;神经氨酸酶;StudynovelInfluenzaA(H1N1)virusvariationinformationinWuxiareathePeriodof20
4、09~2013.MAguangyuan*,YOUfengxing,LINGxia,XIAOyong,Sunna,WUjialin,JIyayong,QIANyanhua(WuxiCenterforDiseaseControlandPrevention,Wuxi214023,China)[Abstract]Objective:TounderstandgenovariationofnovelInfluenzaAH1N1virusHAandNAinWuxiareathePeriodof2009~2013. Methods:ToselectesentinelhospitalsdetectIn
5、fluenzaA(H1N1)virus,Thehemagglutiningene(HA)andneuraminidase(NA)Nucleotidesequence,ToanalysisphylogeneticcharacterizationwithBioeditandMEGAversion4.0analysissoftware . Results:NovelinfluenzaA(H1N1)virusHAgenesequencehomologyof98.9-99.5%during2009~2013,In203sites,Wuxiareaviruswithdomestic、intern
6、ationalrepresentativestrainsdifferent,aminoacidssitefromS-T;In83sitesand321sites,WuxistrainanddomesticStrainsisthesame,butinternationalrepresentativestrainsdifferent,respectivelyS-P,V-I;NAgenesequenceanddomestic,internationalrepresentativeisolateswashighlyhomologousto99.2-99.8%,Aminoacidonlyind
7、ividualreplacement,In87itesand349siteswuxistrainand8domesticStrainsisthesame,butinternationalrepresentativestrainsdifferent,respectively,replacementforR-Q,D-G.Conclusion:ComparativeanalysisofHAandNAgenesequences,thenovelAH1N1influ