哈维氏弧菌ToxR部分基因序列克隆与分析【开题报告】

哈维氏弧菌ToxR部分基因序列克隆与分析【开题报告】

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1、毕业论文开题报告生物工程哈维氏弧菌ToxR部分基因序列克隆与分析⒈课题研究意义及国内外研究现状随着水产养殖业近年来的快速发展,海水养殖动物的细菌性病害造成了巨大的经济损失。由弧菌属细菌引起的弧菌病是在世界各地鱼、虾、贝类等海水养殖动物中普遍流行、危害最大的细菌性疾病之一。在已知的弧菌中,约20种是海水养殖动物的病原菌。哈维氏弧菌作为一种重要的海水养殖动物病原菌,其危害日益显现。ToxR基因是在环境中分布广泛的毒力基因的表达调控基因,能对多种环境毒力基因的表达进行调控,但在异种之间的toxR序列同源性较低,例如霍乱弧菌、副溶血弧菌和创伤弧菌间的toxR序列同源性为52

2、%-63%。这种特性使toxR基因成为弧菌科菌种鉴定的良好的靶标,toxR基因的PCR方法已经成功用于鉴定副溶血弧菌、霍乱弧菌和哈维氏弧菌等。国外对海水类弧菌病的研究始于20世纪初(Bergman,1909),自20世纪60年代后相继对多种弧菌属的致病菌有较丰富的研究和报道(Smith,1961;Horneetal,1977;Egidiusetal,1981;Liuetal,1997)。在PCR检测方面,Oakey等(2003)根据哈维氏弧菌以及其他弧菌的16SrDNA序列设计引物,用PCR方法检测哈维氏弧菌,阳性检出率为100%,但有时侯溶藻弧菌也呈交叉性阳性反应

3、,需要再借助其他的生化实验加以区分。与常规的血清学方法相比,单克隆抗体技术可以识别单一抗原决定簇,特异性强、亲和性一致,并且可以利用细胞系重复获得相同的抗原,是一种快速有效的检测方法,在病原的鉴定方面应用广泛。Chen等(1992)对哈维氏弧菌以及溶藻弧菌等10种弧菌的单克隆抗体检测技术进行研究,设计了3种单克隆抗体,可以进行哈维氏弧菌等弧菌的快速检测。⒉课题研究的主要内容、预期目标和研究方案主要内容:以检测toxR基因作为哈维氏弧菌水平上的特异性基因鉴定,根据toxR基因序列设计简并引物,扩增被检哈维氏弧菌所含的toxR部分基因,并对其进行序列分析。预期目标:分析

4、不同菌株间的toxR序列同源性,研究toxR基因在哈维氏弧菌中的作用和调控机制,以及有效应用于同源性较低的菌种间进行鉴定和区别。研究方案:试剂盒提取DNA设计引物并进行PCR产物进行测序与基因库中其他菌进行对比并建进化树作分析⒊课题进度计划2010年11月20日:指导老师分配任务2010年11月22日至2010年11月27日:收集实验相关资料2010年11月29日至2010年12月9日:实验准备,样品预处理2010年12月10日至2011年1月10日:完成实验及图片处理2011年3月14日至2011年4月22日:论文资料整理,论文撰写与修改⒋参考文献[1]MILLE

5、RVL,MEKALANOSJJ.Synthesisofcholeratox2inispositivelyregulatedatthetranscriptionallevelbytoxR[J].ProcNatlAcadSciUsa,1984,81(11):3471—3475.[2]KIMYB,OKUDAJ,MATSUMOTOC,etal.Identifi2cationofVibrioparahaemolyticusstrainsatthespecieslevelbyPCRtargetedtothetoxRgene[J].JClinMicrobiol,1999,37(4

6、):1173—1177.[3]RIVERAIN,CHUNJ,HUQA,etal.GenotypesassociatedwithvirulenceinenvironmentalisolatesofVibriocholerae[J].ApplEnvironMicrobiol,2001,67(6):2421—2429.[4]PANGL,ZHANGXH,ZHONGY,etal.IdentificationofVibrioharveyiusingPCRamplificationofthetoxRgene[J].ApplEnvironMicrobiol,2006,43(3):2

7、49—255.[5]庞玲玲.哈维氏弧菌毒力相关基因的筛选及快速检测技术研究[D].中国海洋大学硕士学位论文.2007.36-44[6]黄辉,毛芝娟,陈吉刚.哈维氏弧菌外膜蛋白OmpU的克隆、表达与免疫原性研究[N].华中农业大学学报.2010.6.(29)[7]潘晓艺,沈锦玉,曹铮等.哈维氏弧菌胞外蛋白基因的表型克隆与序列分析[N].生物技术通报.2010(10)

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