《分子生物学检验技术》实验指导

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1、实验一小鼠肝组织DNA的提取及鉴定【实验目的】1、掌握动物组织DNA提収的方法;2、掌握紫外分光光度法检测、鉴定DNA浓度和纯度的方法。【实验原理】获得相当纯度和完整性的基因组DNA,可用于DNA酶切图谱、多态性分析、基因诊断、构建基因组文库等。因此,DNA样品质量的好坏将直接关系到实验的成败。较理想的DNA样品应达到以下三点要求:①不应存在对酶有抑制作用的有机溶剂和过高浓度的金属离子;②最大程度地降低蛋口质、多糖和脂类分子的污染;③排除RNA分子的污染和T•扰。DNA以核蛋白形式存在于细胞屮,提取DNA的原则是即要将DNA与蛋白质、脂类和糖

2、类等成分分离,乂耍保持DNA分子的完整。本实验小,川阴离子去垢剂十二烷基磺酸钠(SDS)消化破裂细胞膜、核膜,并使组织蛋白变性沉淀,DNA从核蛋白中游离分开;为控制组织中脱氧核糖核酸酶(DNase)对DNA的降解,加入柠檬酸钠或乙二胺四乙酸二钠(EDTA—Mh)以除去激动该酚的金属离子,SDS也能使DNase变性失活;蛋白酶K可水解蛋口质,消化DNA酶;分离后的DNA用饱和酚/氯仿抽提除去蛋白质,接着丿IJ氯仿抽提以除去DNA溶液中微量酚的污染;最后用无水乙醇沉淀DNA,得到欲提取的基因组DNAo260nm处DNA有最大吸收峰,测DNA的A2

3、6o,可计算其浓度。而蛋口质在280nm处有最大吸收峰,可测定A260nm/A280nm比值,检测DNA的纯度,该比值介于1.8〜2.0之间。【实验器材和试剂】1、动物小白鼠2、设备移液器、台式离心机、水浴箱、陶瓷研钵等;751紫外分光光度计、石英比色皿、洗瓶、滤纸等。3、试剂(1)基因组DNA提取试剂盒(北京康为世纪生物科技公司):包括BufferCL.BufferPP^BufferGERNaseA>ProteinaseK(7)生理盐水,4°C贮存(8)无水乙醇、70%乙醇【操作步骤】1、制备肝匀浆迅速处死小白鼠,称取新鲜肝脏组织50mg,

4、用预冷生理盐水洗左血液,滤纸吸干后剪碎纟R织,将剪碎组织放于纟R织匀浆器或研钵屮研磨,同时加入300plBufferCLo将肝匀浆液放入EP管,加入1.5卩1蛋白酶K,漩涡震荡10s,55°C孵育直到组织溶解(约1小时)。2、提取DNA(1)加入1.5plRNaseA,颠倒混匀,37°C孵育15-60mino(2)冰上孵冇1分钟使样品迅速冷却。(3)加入1/3体积的BufferPP,涡旋震荡20s,12000rpm离心3min。(4)将上清转移到一个新的离心管中,加入等体积界丙醇,轻轻颠倒混匀,可见絮状沉淀(纤维状DNA)从溶液屮析出。120

5、00rpm离心lmim弃上清。(5)加入300

6、4170%乙醇,颠倒数次以洗涤DNA沉淀。12000rpm离心Imin,弃上清,室温干燥15min。(6)加入50

7、ilBufferGE溶解DNA(如果DNA的量比较大,可以65°C孵育以促进DNA的溶解),室温保存待测。3、DNA浓度和纯度的测定取0.1mlDNA样品,加蒸馅水至1ml,在751紫外分光光度计上测A260值和A280值。计算:DNA浓度(ug/ml)=A260x50x10(请问系数刃、』是如何得来的?)DNA纯度=A26()nm/A280nm【注意事项】(1)由于DNA主要存在

8、于细胞核内,为便于提取DNA,肝脏的破碎耍严格控制好。即要尽可能的将细胞膜破碎,又要尽可能多保留完整的细胞核,以保留60〜70%的完整细胞核为宜。为避免DNA过度断裂,不宜用电动研磨器制备匀浆。在提取过程中,染色体会发生机械断裂,产生大小不同的片段,因此分离基因组DNA时应尽量在温和的条件下操作,如尽量减少酚/氯仿抽提,混匀过程要轻缓,以保证得到较长的DNAo(2)用氯仿除去纽•织蛋白,要不断振荡使蛋白质变性。如要得到高纯度DNA,可加入蛋口酶K降解蛋口质。(3)酚和氯仿均有很强的腐蚀性,操作吋应避免接触皮肤。(4)室温卜汗燥时尽可能使残留的

9、乙醇挥发掉(DNA中残留的乙醇会影响内切陆的活性或电泳时DNA不下沉),但不要让DNA完全干燥,否则极难溶解,DNA溶解过程通常需要12-24hro(5)提取过程应尽量保持低温。(6)在波长260nm紫外线下,1OD的光密度值相当于双链DNA浓度为50Mg/ml;单链DNA或RNA为40Hg/ml;单链寡核1F酸为20gg/mlo据此來计算核酸样品的浓度。紫外分光光度法只用于测定浓度>0.25gg/ml的核酸溶液。(7)A26{)nin/A28()nin比值应介于1.8-2.0之间,若比值>2表示DNA样品屮含有较多的RNA,如比值<1.8表

10、明样品屮有蛋口质污染。应根据后续实验要求,采取不同的方法纯化。当然也会出现DNA溶液中既含蛋白质又含RNA,其比值介于1.8〜2.0的情况,所以有必要结合凝胶电泳等

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