吡啶类抑制剂与蛋白激酶B的作用模式与构效关系研究【开题报告】

吡啶类抑制剂与蛋白激酶B的作用模式与构效关系研究【开题报告】

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1、毕业论文开题报告生物工程吡啶类抑制剂与蛋白激酶B的作用模式与构效关系研究一、选题的背景与意义蛋白激酶B(PKB)于1991年首次被鉴定,它为一个近60kD的蛋白,是AGC激酶家族的一员,与PKC、PKA均有很高的同源性(与PKC的同源性为73%,与PKA的同源性为68%),故被命名为PKB(proteinkinaseB)或RAC-PK(relatedtotheAandCkinase),此外,该激酶被证明为逆转录病毒Akt-8的癌基因v-akt编码的蛋白产物,且能使Ser/Thr磷酸化,故又称之为丝氨酸/苏氨酸激酶Akt(serine/threoninekinase,Ak

2、t)。到目前为止,发现了三种同功酶:Akt1、Akt2和Akt3。肝癌细胞的扩增实验表明,Aktl在人类恶性肿瘤的发病机制中起着重要作用。PKB可以直接或间接调节糖类的转运、糖原的合成及蛋白质的合成抑制细胞凋亡等生理活动,在细胞增生、分化、凋亡和代谢等一系列生理活动中起着重要作用。Li等人合成了一系列的3,5-二取代吡啶类蛋白激酶B抑制剂,并得到了该类抑制剂与蛋白激酶A复合物的X衍射晶体结构。该类抑制剂对蛋白激酶B与酪氨酸激酶(tyrosinekinase,TK)、钙调素蛋白激酶(Calcium/Calmodulinproteinkinase,CaMK)有好的抑制选择性

3、。最近,解析得到PKB的晶体结构。故选择活性最高的3,5-二取代吡啶类抑制剂,通过分子对接的方法构建其与PKB的复合物,得到较合理的药效构象,然后构建其余的3,5-二取代吡啶类抑制剂,建立3D-QSAR模型,指导PKB抑制剂的设计。二、研究的基本内容与拟解决的主要问题:基本内容:(1)获取PKB的晶体结构和3,5-二取代吡啶类抑制剂的结构和活性数据(2)分子对接构建活性最高的3,5-二取代吡啶类抑制剂与PKB的复合结构(3)以活性最高的3,5-二取代吡啶类抑制剂的对接构象为模板,构建其它抑制剂的三维结构(4)采用CoMFA软件计算结构参数,建立3D-QSAR模型拟解决的

4、主要问题:(1)通过分子对接构建3,5-二取代吡啶类抑制剂与PKB结合时的药效构象(2)建立3D-QSAR模型,给出这类抑制剂的结构修饰改造的思路三、研究的方法与技术路线:四、研究的总体安排与进度:2010.09-2010.12完成选题、查看文献,写文献综述、任务书、开题报告2010.12-2011.02构建抑制剂化合物的二维结构,翻译两篇外文文献2011.02-2011.03完成分子对接,构建抑制剂化合物的三维结构,学习CoMFA软件操作2011.03-2011.04建立3D-QSAR模型。对实验结果进行分析,论文撰写。五、主要参考文献:[1]唐波.PKB/Akt信号

5、通路与肿瘤[J].国外医学临床生物化学与检验学分册,2004,2:125-127.[2]JonesPF,JakubowiczT,PitossiFJ,etal..Molecularcloningandidentificationofaserine/threonineproteinkinaseofthesecond-messengersubfamily.Proc.Natl.Acad.Sci.USA,1991,88:4171~417.[3]NicholsonKM,AndersonNG.TheproteinkinaseB/Aktsignalingpathwayinhumanma

6、lignancy.CellSignal,2002,14:381~395.[4]BellacosaA,TestaJR,StaalSP,etal..Aretroviraloncogene,akt,encodingaserine-threoninekinasecontaininganSH2-likeregion.Science,1991,7:254~274.[5]周颖,王建,贺福初.蛋白激酶B(PKB/Akt)的结构、调控与功能[J].生命的化学,2006,7:226-228.[6]陈舌,黄传新.蛋白激酶B与信号传导[J].国外医学分子生物学分册,2000,7:42-45.[

7、7]王望,王宪.磷脂酰肌醇-3激酶/蛋白激酶B信号系统.国外医学分子生物学分册,2000,1:45-49.[8]刘伦华,楼丽广.丝/苏氨酸蛋白激酶Akt及其靶向药物研究进展[J].中国药理学通报,2006,1:1-4.[9]Christopher,LewisOC.Phosphoinosltide3-kinaseandtheregulationofcellgrowth.BichimBiophysActa,1996,1288:M11-M16.[10]赵学芹,黄宪章.Akt/PKB信号通路调控机制的研究进展[J].广东医学,2009,12:19

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