双向电泳讲座ppt(new).pdf

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1、基于凝胶技术的定量蛋白质组研究曹原上海中科新生命生物科技有限公司ShanghaiAppliedProteinTechnologyCo.,Ltd蛋白质组研究分析中心ResearchCenterofProteomicsAnalysis上海中科新生命生物科技有限公司ShanghaiAppliedProteinTechnologyCo.,Ltd前身中国科学院上海生命科学院生物化学与细胞生物学研究所蛋白质组研究分析中心对外服务部实力曾嵘研究员和蛋白质组研究分析中心的技术支持全面先进的色谱，质谱，双向凝胶电泳和荧光扫描实验设备完善的技术人才队伍宗旨ourexperience，yoursucc

2、essproteomicsserveyourresearch仪器(3)2D-gelsystem(GE)(1)DIGEsystem(GE)(1)HPLC(Agilent)(1)AKTA(GE)(1)MDLC(GE)(1)MALDI-TOF-TOF(ABI4800)(1)LTQOrbitrapXL(ThermoFinnigan)(1)LTQvelos(ThermoFinnigan)(1)QTRAP(ABI4000)(2)N-terminalsequencing(ABI&shimadzu)(1)Luminex200(1)Computerclustersystem(1)PeptideAn

3、alysis(PSI)(1)E.coliExpressionSystem国内合作网络图修饰蛋白质2DDIGE质谱鉴定SHOTGUNSILACITRAQLabel-Free组分析细胞★★★★★★★★★★★★★★★★★★★★★★★★★★★★★★亚细胞★★★★★★★★★★◎★◎◎人组织★★★★★★★★★★★★★★★★★★★◎★★★★★★★★★体液★★★★★★★★★★★★◎★★★★★★细胞★★★★★★★★★★★★★★★★★★★★★★★★★★★★★★亚细胞★★★★★★★★★★◎◎◎◎动物组织★★★★★★★★★★★★★★★★★★★◎★★★★★★★★★体液★★★★★★★★★★★◎★★★细胞★★

4、★★★★★★★★★★★★◎★★★★★★植物亚细胞★★★★◎◎◎◎组织★★★★★★★★★★★★★★★★◎★★★★★★微生物菌体★★★★★★★★★★★★★★★★◎★★★★★建立公司网站www.appliedproteintech.comoutline蛋白质组与蛋白质组学（proteomeandproteomics）基于凝胶技术的定量蛋白质组研究蛋白质组学实验设计实例分析蛋白质组与蛋白质组学蛋白质组（PROTEOME：PROTEinsexpressedbyagenOME）：－基因组表达的全部蛋白质蛋白质组学（PROTEOMICS：Thestudyoftheproteome）：－研究全部

5、蛋白质的存在及存在形式的一门学科生命的复杂性最终体现在蛋白质水平从基因组预测的ORF6,70220,60314,39926,99622,475~22,000蛋白质是生命现象的功能执行者蛋白质是生命现象的功能执行者蛋白质组学研究的问题蛋白质组学研究基本生物学问题蛋白质表达变化（proteinexpression）翻译后修饰（post-translationalmodification）蛋白质-蛋白质相互作用（protein-proteininteraction）蛋白质组学的应用领域微生物微生物蛋白质组学植物植物蛋白质组学疾病疾病蛋白质组学药物药物蛋白质组学磷酸化（PTM）磷酸化蛋白

6、质组学......蛋白质组学应用疾病Vs正常诊断标志物及发病机制研究药物处理Vs对照药物作用靶点及药物作用机制研究抗病植株Vs非抗病植株植物抗病机制性研究高产作物Vs对照高产机制研究与作物改良高产仔Vs低产仔家畜高产仔机制研究与家畜改良病理状态下蛋白质磷酸化病理状态下细胞内信号传导蛋白质相互作用蛋白质的生物功能…………outline蛋白质组与蛋白质组学（proteomeandproteomics）基于凝胶技术的定量蛋白质组研究蛋白质组学实验设计实例分析蛋白质组学的研究方法研究目的蛋白质组学方法表达谱构建大规模蛋白质鉴定技术（shotgun）蛋白质翻译后修饰分析磷酸化，泛素化位点鉴

7、定技术蛋白质表达差异分析定量蛋白质组学技术两组或者多组之间的差异分析人和动物植物微生物不同品系不同植株不同菌株不同用药不同处理不同致病性不同病理生理状态不同培养不同生存能力不同时间点不同时间点不同时间点……………………………经典蛋白质组学研究路线关键，不同样品不同策略凝胶Vs.非凝胶分离技术蛋白质鉴定技术蛋白质组学定量与翻译后修饰分析和生物信息学分析基于凝胶技术的蛋白组学研究•传统双向凝胶电泳（2-DE）DigestumorousLysistissuetpairednontumo