4科热带作物系统发育分析

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1、热带作物学报2013，34(12)：2307—2312ChineseJournalofTropicalCrops4科热带作物系统发育分析段瑞军，符少萍，刘姣，李瑞梅，李亚梅，胡新文2，郭建春1中国热带农业科学院热带生物技术研究所．海南海口5711012海南大学农学院．’海南海口570228摘要以4科(大戟科、豆科、芭蕉科、番木瓜科)的29种热带作物为研究对象，采用叶绿体16～23S基因间隔序列．对这29种植物的系统发育进行了分析结果表明．这29种植物的1623S基因问隔区序列同源性很高，保守性较强；构建系统发育树表明，这29种植物进

2、化完全符合恩格勒(1897)分类系统，序列变异程度较低；进一步分析了l1个木薯品种间的差异。木薯种内差异很小，只有SC8与其他几个品种稍有差异，但不显著。结果表明．叶绿体16～23S基因间隔序列虽可区别这4科29种植物，但该序列较长．序列变异程度较低，并不能作为候选DNA条形码之一关键词叶绿体；l6～23S基因间隔序；系统发育：DNA条形码中图分类号Q941文献标识码AAnalysisofPhylogeny0fRepresentatiVeSpeciesinFourFamiliesDUANRuijun，FUShaoping，LIUJi

3、ao，LIRuimeiLIYamei．HUXinweh．GU0Jianchun1InstituteofTropicalBioscieneeandBiotechnologyofChineseAcademyofTropicalAgriculturalSciences，Haikou，Hainan571101，China2CollegeofAgronomy,HainanUniversity,Haikou，Hainan570228,ChinaAbstractPhylogeneticanalysesofthechloroplast16-23Si

4、ntergenicregionsequenceswereconductedfor29tropicalrepresentativecropsfromEuphorbiaceae，Leguminosae，MusaceaeandCaricaceae．Theresultsindicatedthat16-23Sintergenicregionsequenceshadhighhomologyandconservatism．Phylogeneticanalysisshowedthattheevolutionof29tropicalcropswasi

5、nfullcompliancewiththeEngler(1897)classification．Thelevelofsequencevariationwaslow．Furtherresearchesaboutsequencediferencesamong11varietiesofcassavademonstratedthedifferenceattheinterspecificlevelincassavawasverylow，onlySC8revealedminordifference．Althoughthechloroplast

6、16~23Sintergenicregiongenesequencescouldbeusedtoidentifythe29cropsofthe4families，thelevelofsequencevariationwaslow．Sothel6—23SintergenicregionisnotquantifiedascandidateDNAbarcodes．KeywordsChloroplast；16SrRNA-23SrRNAintergenicsequence；Phylogeny；DNAbarcodedoi10．3969／j．is

7、sn．1000—2561．2013．12．001叶绿体是植物、绿藻特有的细胞器，拥有自己响．说明IR区段起码不一定总是必需的．可能在的微小基因组．负责各种必需功能_l】叶绿体功能进化过程中得失过多次}3_IR区域主要分布着编码研究发现．叶绿体来源于古代蓝藻内共生但随着rRNA的基因(rps)．包括编码16SrRNA和23S细胞器的不断进化．其所携带的大量基因转移到了rRNA．中间被编码4．5S和5S2个tRNA的基因宿主细胞核嘲。叶绿体基因组的结构非常保守．为(tm)分开，还有些基因的功能未知(蔗因)双链环形DNA。由4个基本部分组

8、成．分别是大近年．许多学者都对植物中适合作为DNA条单拷贝区(1argesinglecopyregion，LSC)．小单拷形码的基因序列进行了积极的探索和研究．认为从贝区(smallsinglecopyregion，SSC)，反向重复