大豆分子标记遗传图谱研究进展-论文.pdf

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1、科技信息0高校讲坛0SCIENCE&TECHNOLOGYINFORMATION2012年第17期大豆分子标记遗传图谱研究进展张乐,郭政阳2刘玉林3陈曦,杨靖,(1.天津现代职业技术学院中国天津300350;2.天津职业技术师范大学中国天津300222;3.北京林业大学中国北京1000831【摘要】具有高油、高蛋白特点的大豆(Clycinema~(L.)Merr)~界上主要农作物之一,广泛用作人类的食物、动物的饲料和生物能源。在测序技术尚未被广泛应用之前,研究人员基于分子标记技术,通过与某些遗传性状相连锁的分子标记来绘制大豆基因组

2、的遗传图谱,探索式的了解大豆基因纽的组成和某些数量性状的遗传位点(QTL)。2010年1月,大豆基因组测序完成并公布,使得大豆基因组研究有了突飞猛进的发展Soybase数据库将高密度的遗传图谱与大豆基因组序列相结合,促进了DNA序列与遗传图谱的联系,为控制大豆遗传性状基因的研究提供了重要基础。【关键词】大豆基因组;分子标记;多倍体化:重组;测序大豆『Gne(L.)Merr1起源于我国,其栽培历史已有5000多SSR标记、486个AFLP标记。18个RAPD标记,1个SCAR标记和4年之久Ⅲ.十八世纪后期陆续传人欧洲和美洲。大豆是

3、世界上最重要的个质量性状标记.总长度为2320.7cM。此后,我国科研工作者们也构油料作物和高蛋白作物.具有重要经济价值。大豆蛋白质的氨基酸成建了许多的图谱.但标记密度较少,均未超过吴晓雷等所构建的图谱。分与人类的必需氨基酸模式相类似,尤其是含有丰富的不饱和脂肪song等在Cregan等构建的图谱的基础上用5个RIL群体对大豆酸、维生素和微量元素,是人类理想的食品营养来源。大豆还有很高的整合遗传图谱进行加密,补充了420个新的SSR标记,使标记问的平药用价值.其含有的两种有效成分——大豆异黄酮和大豆皂苷.具有均距离缩短到2.5c

4、M.标记总数达到1849个.这是迄今为止标记数目广泛的药理作用和重要的药用价值。此外,大豆对新的生物能源的开最多、密度最高、应用最为广泛的一张大豆“公共图谱”。随着基因组测发和利用也具有重要作用。因此,大豆的遗传研究一直受到广泛的重序技术的发展.SNP标记作为第三代分子标记逐渐被应用到高密度遗视。传图谱的构建中来Hyten等同样利用三个RIL群体构建了一张包括在测序技术尚未被广泛应用的时期,研究人员利用与某些遗传性5500个标记.其中有3793个标记是SNP标记的遗传图谱.该图谱覆状相连锁的分子标记来表示其在遗传图谱上的相对距离

5、.以此来探索盖大豆基因组20个连锁群,共长2296.4cM。除这些较为经典的遗传式的研究大豆基因组分子标记(MolecularMarkers)是以个体间遗传图谱外.学者们也用不同的标记和群体构建了许多大豆遗传图谱,如物质内核苷酸序列变异为基础的.能反映生物个体或种群间基因组中表1—2所示某种差异的特异性DNA片段。目前已应用于遗传图谱构建的分子标表1—2大豆遗传图谱的发展历程记大致可以划分为两类:(1)以Southern杂交技术为基础的RFLP标Table1—2Progressofgeneticmapinsoybean记(2)以

6、PCR技术为核心的第二代分子标记:1)随机扩增多态性DNA(RAPD):2)扩增片段长度多态性(AFLP)~J;3)序列标志位点(STS):4)序列特异性扩增区域(SSCAR);5)简单序列重复区间扩增多态性(ISSR);6)简单序列重复(SimpleSequenceRepeats,SSRs)7)InDe1标记:8)SNP标记和DNA芯片技术早期的大豆基因组遗传图谱主要是基于第一代分子标记RFLP标记构建的.所使用的作图群体大多也是F2群体。Apuya等应用大豆两个栽培品种Minsov和Noir1杂交得到的F2群体.构建了世界上

7、第一张由11个RFLP标记构成的大豆遗传图谱.图谱覆盖4个连锁群.共197cMKeim等应用栽培大豆品系A81—356022和野生大豆PI468916杂交的F2代作为作图群体.构建了由130个RFLP标记组成的第二张大豆分子连锁图谱.该图谱覆盖26个连锁群.共1200cM。由于科技水平的限制.我国对大豆分子技术领域的研究起步较晚.在大豆遗传图谱构建方面也相对滞后.构建图谱密度较小。张德水表1—2大豆遗传图谱的发展历程(续)等利用栽培大豆长农4号和半野生大豆新民6号杂交得到84个F2Table1-2Progressofgeneti

8、cmapinsoybean(add)单株.同样以RFLP标记为主构建了我国第一张大豆分子遗传图谱.此图谱构共有71个标记分布于20个连锁群上.其中RFLP标记63个,RAPD标记8个.标记间的平均距离为20.4cM,覆盖长度为1446.82cM刘峰等利用栽培大豆

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