基于DNA的木材树种识别研究进展-论文.pdf

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1、第38卷第1期南京林业大学学报(自然科学版)Vo1.38.No.12014年1月JournalofNanjingForestryUniversity(NaturalSciencesEdition)Jan.,2014doi:10.3969/j.issn.1000—2006.2014.O1.027基于DNA的木材树种识别研究进展张蓉,殷亚方,徐魁梧,叶克林,(1.南京林业大学材料科学与工程学院,江苏南京210037;2.中国林业科学研究院木材工业研究所,北京100091)摘要:从木材识别的角度,对木材

2、DNA提取方法(CTAB、SDS、PTB、DNeasyPlantMiniKit等)和DNA条形码及DNA指纹图谱等基于DNA的木材树种识别方法进行了综合评述。其中,针对DNA条形码方法,重点阐述了基因组DNA中可用的特征序列来源叶绿体基因(chloroplastDNA,cpDNA)rbcL、matK、trnH—psbA间隔区序列,核糖体基因(ribosomalDNA,rDNA)ITS序列,以及变异位点的识别和系统进化树的应用等问题;针对DNA指纹图谱方法,重点阐述了(RAPD、ISSR、SSR、S

3、NP)4种DNA分子标记方法在DNA指纹图谱中的研究和应用现状。笔者认为,以DNA特征序列为依据的木材树种识别理论上虽然是可行的,但要应用于实际还需开展更多的研究。关键词:木材树种识别;DNA提取;DNA条形码;DNA指纹图谱中图分类号:$781文献标志码:A文章编号:1000-2006(2014)01-0151-06ProgressofwoodidentificationbasedonDNAmethodsZHANGRong,YINYafang,XUKuiwu,YEKelin,(1.College

4、ofMaterialsScienceandEngineering,NanjingForestryUniversity,Nanjing210037,China;2.ResearchInstituteofWoodIndustry,ChineseAcademyofForestry,Beijing100091,China)Abstract:Fromwoodidentificationpointsofview,DNAextractionmethods(CTAB,SDS,PTB,DNeasyPlantMini

5、Kitetc.)andDNAbarcodeandfingerprintandwoodidentificationmethodsbasedonDNAweresummarized.FortheDNAbarcodeconcerned,theemphaseswereonthesignaturesequencesingenomeDNA(chloroplastDNA,cpDNAr—bcL,matK,trnH—psbAintergenicspacersequences,andribosomalDNA,rDNAI

6、TS)aswellasidentificationform(varia—blesitesandphylogenetictree)described.FortheDNAfingerprintmethod,theemphaseswereontheprogressandout-lookof4kindsofmolecularmakerssuchasrandomamplificatedpolymorphismDNA,RAPD,inter—simplesequencere-peat,ISSR、simplese

7、quencerepeats,SSR,singlenucleotidepolymorphism,SNP.Itwasconcludedthatwoodidentifica—tionbasedonDNAmethodsisfeasibleintheorybutneedsmorestudiedon.Keywords:woodidentification;DNAextraction;DNAbarcode;DNAfingerprint目前,木材树种识别主要依据形态学和解剖学分布、提取和扩增、测序、统计、识别应用

8、等方面,介(即木材的宏观和显微构造特征),由于同属树种绍这两种方法在木材树种识别方面的研究和应用木材构造非常相近很难识别,因此,需要一种更准情况。确的方法使木材识别的层面提高到“种”。物种表1DNA的提取现型的差异归根结底是基因型的差异,即DNA序列的差异。因此对基因组序列差异的比较研究无1.1DNA的分布疑为植物分类和识别提供了最本质的依据。木材,即树木次生木质部,包含各种从形成层20世纪70年代,Nobuchi等对木材组织中原始细胞分化而来的细胞J。木材细胞中残留的遗传物质进行

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