海洋沉积物中可培养微生物的多样性

海洋沉积物中可培养微生物的多样性

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1、海洋沉积物中可培养微生物的多样性汇报人:卢婧雯指导老师:吴敏报告内容一、国内外研究动态二、研究目的与意义三、主要研究内容四、研究材料、方法与主要技术路线五、研究条件、可行性与困难六、研究进度安排七、预期结果八、参考文献海洋沉积物概况地球上最复杂的微生物栖息地海洋沉积物是海洋历史的记录,包括软泥沙、灰尘、动植物的遗骸、宇宙尘埃等。为开发利用微生物资源提供重要的参考依据为人类了解生命的起源和进化提供重要的先说一、国内外研究进展在已报道的微生物物种中,海洋微生物不到总数的10%在整个海洋环境中只有0.01%-10%的微生物是可培的,而可培的深海微生物则更少。全球沉积物采样点FromNational

2、OceanicandAtmosphericAdministration,UnitedStates http://www.noaa.gov海洋沉积物中存在的微生物细菌:proteobacteria包括α、β、γ、δ、ε变型菌纲;Holophaga/Acidobacteria;Planctomycetales古菌:Euryarchaeota和Crenarchaeota二、研究目的与意义分离培养海洋沉积物中的微生物,为微生物种质资源开发提供材料,分析海洋沉积物中可培养微生物群落结构,评价其多样性。对海洋微生物的生物活性物质进行筛选,寻找具有潜在工业应用价值的生物材料。对疑似新种进行多相分类学研究。

3、三、主要研究内容海洋沉积物中微生物的分离可培养微生物多样性分析微生物活性物质筛选疑似新种的多相分类学研究四、研究材料、方法与主要技术路线研究材料:海洋沉积物样品(海洋二所提供)中国南海西南印度洋技术路线:海洋沉积物样品悬浮16SrDNA测序疑似新种多相分类学研究活性物质的筛选微生物的分离纯化培养基设计挑取单菌落多样性分析涂平板菌株保藏短时间充分富集富集涂平板菌株保藏菌株保藏五、可行性与困难可行性:1.实验室有较成熟的微生物培养和鉴定平台;2.可获得较丰富的沉积物样品;困难:1.微生物分离鉴定实验方法不熟悉;2.深海微生物的可培养率较低。经费预算生化试剂:2000元序列测定:3000元指标测定

4、(电镜、脂肪酸、GC含量):2000元标株购买:2000元其他耗材:1000元总计:10000元左右六、研究进度安排2009.11-2010.2微生物筛选、分离、纯化;2010.2-2010.316SrDNA序列测定和分析;2010.3-2011.1多相分类学研究及活性物质筛选2011.1以后完成论文七、预期结果构建海洋沉积物菌株库,完成相关生物信息的描述(多样性、活性物质等);参与分离鉴定微生物新物种1-2个;建立海洋微生物新种1-2个。八、参考文献[1]Byung-YongKim.InternationalJournalofSystematicandEvolutionaryMicrobi

5、ology(2006),56,2653–2656[2]S.Shivaji.InternationalJournalofSystematicandEvolutionaryMicrobiology(2005),55,1453–1456[3]Jung-HoonYoon.InternationalJournalofSystematicandEvolutionaryMicrobiology(2004),54,1799–1803[4]FengqinSun,BaojiangWang,XiupianLiu,QiliangLai,YapingDu,GuangyuLi,JieLuoandZongzeShao.I

6、JSEMPapersinPress(2009)[5]So-JeongKim,Soo-JePark,Dae-NoYoon,Byoung-JoonPark,Bo-RamChoi,Dong-HunLee,YulRohandSung-KeunRhee.Marinobacteriummaritimumsp.nov.,amarinebacteriumisolatedfromtheArcticSediment.IJSEMPapersinPress(2009)[6]ParkesRJ,CraggBA,BaleSJ,etal.Deepbacterialbio-sphereinPacificOceansedime

7、nts.Nature,1994,371:410-413.[7]NewberryCJ,WebsterG,CraggBA,etal.Diversityofpro-karyotesandMethanogenesisindeepsubsurfacesedimentsfromtheNankaiTrough,OceanDrillingProgramLeg190.EnvironmentalMicrobiology,2004

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