变应性鼻炎患者外周血基因芯片检测及差异表达基因研究-论文.pdf

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1、76ChinJOphthalmolandOtorhinolaryngol，March2014，Vol14，No．2·研究生专栏·变应性鼻炎患者外周血基因芯片检测及差异表达基因研究李艳青王德辉【摘要】目的利用基因芯片研究变应性鼻炎(AR)基因表达谱的改变，从基因水平深入探讨AR的发病机制。方法应用GeneChipHumanGene1．0STArray检测4例常年性AR与4例非AR患者外周血单个核细胞的基因表达谱，分析差异表达基因及其功能、信号通路，并选择有显著差异表达的部分基因进行实时荧光定量聚合酶链反应(qRT·PCR)验证。结果基因芯

2、片筛选出差异表达基因2347条，其功能主要与免疫应答、炎症反应、免疫调控、基因转录、细胞代谢、抗体生成、细胞增殖、信号转导、多种酶活性、膜受体结合活性、细胞结构蛋白活性等有关；对差异基因进行功能与信号通路分析，证实细胞因子一细胞因子受体、JAK—STAT通路、SOCS系统，在AR发生、发展过程中的相互作用和复杂变化。qRT．PCR测定差异表达基因IL-4R、SOCS、IL一33和TNFRSF的表达水平，与芯片试验结果一致。结论AR存在多基因表达调控的异常；对其功能及信号通路进行分析，有助于从基因网络揭示AR的病理生理机制；IL一33在A

3、R发生、发展过程中发挥重要作用，对其深入研究有可能为AR的临床治疗提供新的方向与靶点。(中国眼耳鼻喉科杂志，2014，14：76—82)【关键词】基因表达谱；变应性鼻炎；功能；信号转导通路；发病机制StudyofthegeneexpressionprofilesinperipheralbloodmononuclearcellofallergicrhinitisL／hn—qing，WANGDe—hui．DepartmentofOtorhinolaryngology，EreEarNoseandThroatHospitalofFudanUni

4、versity，Shanghai200031，ChinaCorrespondingauthor：WANGDe-hui．Email：waEIgdehuient@sina．con【Abstract】0bjectiveTodiscussgeneexpressionprofilesinallergicrhinitis(AR)andtoapproachthemechanismofARfromgeneleve1．MethodsGeneDNAmicroarray(Afymetrix)wasusedtoexaminethegeneexpressioni

5、n4perennialAR(PAR)peripheralbloodmononuclearcell(PBMC)and4normalPBMCsamples．Thediferentiallyexpressedgeneswereidentifiedandsubjectedtoquantitativereal—timepolymerasechainreaction．Inaddition，Geneontology(GO)analysisandpathwayanalysiswereconducted．ResultsComparedwithnormal

6、PBMCs，2347geneswerefoundtobedifferentiallyexpressedinARsamples．Thedifferentiallyexpressedgenesweremostlyinvolvedininflammatoryresponse，immuneresponse，immuneregulation，signaltransductionandcellmetabolism，etc．Goandpathwayanalysisdemonstratedtheprofoundinteractionsandchange

7、sofcytokine-cytokinereceptor／JAK．·STAT／SOCS．TheexpressionsofIL-4R，SOCS，IL一33andTNFRSFwereconsistentwithmicroarray．ConclusionsMicroarrayexpressionprofileshowedthattheregulatorymechanismsofARwereabnorma1．Identificationoftargetgenesandgenefunctioncouldmakeabetterunderstandi

8、ngofpathogenesisofAR．Moreresearchonpre—inflammatorycytokineIL一33willprovidesomenewcluesfortreatmentofAR