楠木种属及其近缘属叶绿体 matK 基因序列的鉴定.pdf

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1、贵州农业科学2014，42(2)：27～31GuizhouAgriculturalSciences[文章编号]i001—3601(2014)02—0066—0027—05楠木种属及其近缘属叶绿体matK基因序列的鉴定陈云霞，南程慧，薛晓明(南京森林警察学院，江苏南京210023)[摘要]为给楠木及其近缘属植物的DNA分子鉴定提供依据，对30种楠木及其近缘属植物进行基因组DNA提取，叶绿体matK序列扩增与测定，并进行序列比对与人工校正，计算属间及种间的遗传距离，比较序列间的差异，构建系统发育树。结果表

2、明：matK各基因序列的组成中G+c含量平均为36．6。3O个楠木及近缘属植物共发现72个碱基变异位点，碱基变异率为9．38。其matK基因序列种间遗传距离为0～0．098，平均遗传距离为0．010。聚类分析，新樟属为1个分支，楠属和润楠属聚为1个分支，其余樟属、木姜子属、新木姜子属、山胡椒属、檫木属、月桂属与黄肉楠属聚为1个分支。故matK序列基本可以对楠木及其近缘属植物进行属间鉴定，但在种间水平上并不可行。[关键词]楠木；近缘属；鉴定；matK[中图分类号]$792．24[文献标识码]AIdent

3、ificationofChloroplastmatKSequenceofPhoebeandItsRelatedGeneraCHENYunxia，NANChenghui，XUEXiaoming(NanjingForestPoliceCollege，Nanjing，Jiangsu210023，China)Abstract：ToprovidereferencesforDNAidentificationofPhoebeanditsrelatedgenera，genomicDNAwasextractedfrom

4、30accessions，thechloroplastmatKsequenceswereanalyzed，theinter—specificgeneticdistanceswerecalculated。andthephylogenetictreesofalltheaccessionstestedwereconstructedbasedontheobtaineddistancedata．TheresultsindicatedthattheaverageG+CcontentinvariousmatKseq

5、uenceswas36．6．72basevariationpointswerefound，accountingfor9．38．Theinterspecificgeneticdistancerangedfrom0to0．098，withanaverageof0．01O．Theclusteranalysisshowedthatthegeneratestedwereclusteredintothreebranches，onewasNeocinnamomumdelavayi，onewasPhoebeandMa

6、chilus，andothersbelongedtoanotherone，includingCinnamomum，Litsea，Neolitsea，Lindera，Sassafras，LGURUSandActinodaphne．matKcouldbeusedtoidentifyPhoebeanditsrelatedgenera，butcouldn'tbeusedatthespeciesleve1．Keywords：Phoebe；relatedgenera；identification；matK楠木，素

7、有木中贵族之称，是我国珍贵用材树种鉴定的DNA条形码序列主要集中于叶绿体种，有些种已临近濒危状态。为了更有力地保护我DNA(chloroplastDNA，cpDNA)和核糖体DNA转国珍贵林木资源，对楠木物种的准确鉴定迫在眉录间隔区(nuclearribosomalDNAinternaltran—睫]。楠木属(Phoebe)为樟科经济价值较大的一个scribedspacer，ITS)_4]。2009年，生命条形码联盟属，多为高大乔木，人们习惯将楠木属植物统称为楠植物工作组推荐以叶绿体编码成熟酶K蛋白(

8、mat-木[2]。但广义上，楠木还包括润楠属(Machilus)与uraseKprotein)的matK基因和编码核酮糖一1，5一赛楠属(Nothaphoebe)的一些树种]。楠木中一些二磷酸羧化酶(ribulose一1，5．bisphosphatecarboxyl—近缘物种，其木材结构与枝叶的形态特征均非常相ase)大亚基的rbcL基因作为陆地植物DNA条形码似，通过传统的形态鉴定与木材结构识别一般只能的特征序列j。确定到属，而无法鉴定到种的水平。但不