单细胞基因测序市场分析-20170125.ppt

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1、1QIAGENYourPartnerinTranslationalMedicine单细胞基因测序市场分析什么叫单细胞基因测序（SingleCellSequencing）？一句话说，就是单个细胞水平上对基因组进行测序。2013年，Nature杂志把年度技术授予了单细胞基因测序（SingleCellSequencing）,认为该技术将改变生物界和医学界的许多领域。单细胞基因组、转录组分析单细胞测序通过对单个细胞进行基因组扩增和测序解决了用组织样本无法获得不同单个细胞的异质性信息、样本量太少无法进行常规

2、测序的难题研究解析单个细胞的行为、机制、与机体的关系等提供了新方向为早期检测、诊断疾病及疾病的个体化治疗提供指导。基因组及转录组分析中常遇到的难题：全基因组和全转录组分析的难题：Title,Location,Date6单细胞测序应用领域单细胞全基因组测序：1、体外受精的胚胎测序：在把胚胎植回母体之前，先取一个细胞进行测序，确认基因正常后再植回，以保障胚胎是正常的。2、CTC细胞测序：通过对血液中的肿瘤细胞测序，找到突变位点，针对性能进行靶向药物治疗。3、肿瘤亚细胞群测序：肿瘤发生、发展中，细胞不断

3、发生新的突变，形成许多亚细胞群，单细胞测序可以对这些亚细胞群进行分别的测序，并找到对应的治疗方案。4、免疫测序：免疫细胞在对抗原发生识别后，免疫细胞的基因组发生重排，并产生对抗原特异的抗体。对免疫细胞的测序，可以找出特异的基因结构。Title,Location,Date7单细胞测序应用领域单细胞转录组测序：1、在全基因组范围内挖掘基因调节网络，尤其适用于存在高度异质性的肿瘤细胞、干细胞及胚胎发育早期的细胞群体。2、发现亚细胞成分的基因表达谱，例如对在神经元的轴突或树突部分特异表达的基因的转录组分析

4、。一、单细胞测序行业BCCResearch的一项分析报告指出，2014年全球单细胞分析（Single-cellAnalysis）的市场达5.4亿美金，预测将从2015年的6.3亿美金增长到2020年的16亿美金，复合增长率达21%。根据GENReports的报告，关于单细胞分析的文章发表在过去的几年也有着爆发性的增长。图2：单细胞分析的文章发表数量9二、单细胞基因测序的基本流程：单细胞分离--基因组扩增--测序和分析单细胞测序，主要经过如下的步骤：单细胞的分离DNA/RNA的提取和扩增（全基因组扩

5、增和全转录组扩增）测序以及后续的分析和应用2.1单细胞的捕捉和分离单细胞测序的第一步是单细胞的分离和提取，目前的方法主要有：流式细胞术激光捕获显微切割技术微流控技术DanielA.Haber,etalCANCERDISCOVERYJUNE2014Title,Location,Date11单细胞操作的仪器FluidigmC1单细胞操作毛细管显微操作单细胞10XGenomicsIllumina与Bio-Rad发布Singel-CellSequencingSolutionQIAscout武汉友芝友-CT

6、C捕获仪强生-CellReserchTitle,Location,Date12C1单细胞自动制备系统1个小时内即可分离96个单细胞BiomarkerHD系统30分钟内可进行9216个qPCR反应PBMC单细胞转录组测序结果示例10XGenomicsTitle,Location,Date13Illumina®Bio-Rad®Single-CellSequencingSolutionQIAscout武汉友芝友-CTC捕获仪CellSearch2.2全基因组扩增（WholeGenomeAmplifica

7、tion.WGA）/全转录组扩增（WholeTranscriptomeAmplification，WTA）单细胞测序的难点在于扩增。全基因组扩增主要的方法：简并寡核苷酸引物PCR扩增（DOP-PCR）多重置换扩增（MDA）——目前最好的方法和基于多次退火和成环的扩增循环（MALBAC）——亿康基因常见WGA方法比较转录组扩增主要的方法：Clontech公司的Smart方法,一种优秀的单细胞全长RNA-seq：起始RNA只有约10pgEpiCentre公司的TargerAmp方法TargetAmp法

8、测单细胞全RNASMART法测单细胞的全长全RNATitle,Location,Date18单细胞测序国内相关公司（科研）公司名称开展类型华大基因单细胞DNA测序、单细胞RNA测序诺禾致源单细胞DNA测序、单细胞RNA测序贝瑞和康单细胞DNA测序、单细胞RNA测序安诺优达单细胞DNA测序、单细胞RNA测序、单细胞G&T测序、单细胞甲基化测序、单细胞Hi-C测序美吉生物单细胞RNA测序广州锐博单细胞DNA测序、单细胞RNA测序百迈客单细胞RNA测序杭州壹基因单细胞DNA测序、单细胞R