【生物化学简明教程】第四版14章 RNA的生物合成.doc

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1、14RNA的生物合成1.原核生物的RNA聚合酶由哪些亚基组成?各个亚基的主要功能是什么?解答:原核生物的转录作用,不论其产物是mRNA,rRNA,还是tRNA,都是由同一种RNA聚合酶催化合成的。用SDS-PAGE分离大肠杆菌RNA聚合酶可得几个大小不等的亚基:β、β¢亚基的Mr分别为1.5×105和1.6×105,α和σ的Mr分别为4.0×104和7.0×104。用磷酸纤维素柱层析分离出由各个亚基组成的全酶(holoenzyme),其亚基组成为α2ββ¢σ,Mr约为4.65×105。其中的σ因子易于从全酶上解离,其他的亚基则比较牢固地结合成为核心酶(co

2、reenzyme),当σ因子与核心酶结合成全酶时,即能起始转录,当σ因子从转录起始复合物中释放后,核心酶沿DNA模板移动并延伸RNA链。可见σ因子为转录起始所必需,但对转录延伸并不需要。全酶以4种核苷三磷酸为原料,以DNA为模板,在37℃下,以40nt/s的速度从5¢→3¢合成RNA。一个大肠杆菌约含7000个RNA聚合酶分子,大约2000~5000个聚合酶同时催化RNA的合成。α亚基由rpoA基因编码,为核心酶的组装所必需,需责识别和结合启动子。α亚基在全酶与某些转录因子相互作用时也发挥重要作用。β和β¢亚基分别由基因rpoB和rpoC编码。β亚基是催化

3、部位的主体,研究表明,β亚基有两个结构域,分别负责转录的起始和延伸,β¢亚基上结合的两个Zn2+参与催化过程。β¢亚基可能是RNA聚合酶与模板DNA的结合部位。大肠杆菌的σ因子由基因rpoD编码,在对启动子识别中起关键作用。σ因子与核心酶结合后,全酶对启动子特异性结合能力是对其他DNA序列结合能力的107倍。2.真核细胞中有几种RNA聚合酶?它们各自的主要功能是什么?解答:真核生物的RNA聚合酶,按照对α-鹅膏蕈碱的敏感性不同进行分类:RNA聚合酶Ⅰ基本不受α-鹅膏蕈碱的抑制,在大于10-3mol/L时才有轻微的抑制。RNA聚合酶Ⅱ对α-鹅膏蕈碱最为敏感,

4、在10-8mol/L以下就会被抑制。RNA聚合酶Ⅲ对α-鹅膏蕈碱的敏感性介于聚合酶Ⅰ和聚合酶Ⅱ之间,在10-5mol/L到10-4mol/L才会有抑制现象。RNA聚合酶Ⅰ存在于核仁中,其功能是合成5.8SrRNA、18SrRNA和28SrRNA。RNA聚合酶Ⅱ存在于核质中,其功能是合成mRNA、snRNA。RNA聚合酶Ⅲ也存在于核质中,其功能是合成tRNA和5SrRNA及转录Alu序列。3.下面是单链DNA模板的碱基序列,将它与RNA聚合酶、GTP、CTP、UTP和[α-32P]ATP混合物一起保温,再用脾磷酸二酯酶水解RNA产物,试问可得到哪些3′-32

5、P标记的NMP?5′ATCTTCGTATGCATGTCT3′解答:根据DNA模板的碱基序列先写出RNA产物的碱基序列,每个A的5¢端为32p:5′32pApG32pApC32pApUpGpC32pApU32pApCpG32pA32pApG32pApU3′脾磷酸二酯酶从RNA的5¢–末端开始依次水解生成3¢–NMP,得到3¢–32p[GMP]∶3¢–32p[CMP]∶3¢–32p[UMP]∶3¢–32p[AMP]=3∶2∶1∶1。4.原核生物的启动子和真核生物的三类启动子各有何结构特点?解答:原核生物的启动子在-10区有一共有序列(consensussequ

6、ence)TATAAT,以发现者的名字命名为Pribnow框(Pribnowbox),或被称作-10序列。在-35区还有一个共有序列TTGACA,被称作识别区域,或-35序列。在不同基因的启动子中,这两个共有序列的位置和序列略有区别。对上述共有序列进行化学修饰和定位诱变证明,-35序列与聚合酶对启动子的特异性识别有关,-10区富含A-T对,有利于DNA局部解链,-10区与-35区之间的距离,明显影响转录的效率。真核生物三类启动子分别起始RNA聚合酶I、II、III的转录。类别I启动子包括核心启动子和上游控制元件两部分,需要UBF1和SL1因子参与作用。类别

7、II启动子包括四类控制元件:基本启动子、起始子、上游元件和应答元件。识别这些元件的反式作用因子有通用转录因子、上游转录因子和可诱导的因子。类别III启动子有两类:上游启动子和基因内启动子,分别由装配因子和起始因子促进转录起始复合物的形成和转录。5.简要说明原核生物和真核生物转录调控的主要特点解答:原核生物与真核生物基因转录调控的共同之处主要有两个方面。其一,调控的关键步骤均在转录的起始阶段。其二,DNA上均包括参与转录调控的顺式作用元件,细胞中均含有可以同顺式作用元件相互作用的反式作用因子。原核生物基因转录调控的特点可归纳为3个方面:① σ因子决定RNA聚

8、合酶的识别特异性。原核生物只有一种RNA聚合酶,核心酶催化转录的延

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