生物化学简明教程第14章 RNA的生物合成ppt课件.ppt

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1、第十四章RNA的生物合成RNA的生物合成转录:DNA→RNA(主要)存在于绝大多数生物体,以DNA为模板合成RNA的过程,也就是把DNA的碱基序列抄录成RNA的碱基序列。复制:RNA→RNA存在于某些病毒体内,以RNA为模板合成RNA的过程。14.1RNA生物合成概况RNA聚合酶本质上均催化同一种反应,即在一定的模板(DNA或RNA)指导下,以4种核苷三磷酸为原料,按碱基配对规律,从5´→3´合成RNA链几个基本概念结构基因、模板链[Watson,W链、负(-)链、反意义链]、编码链[Crick,C链、正(+)链、有意义链]、不对称转录、转录泡结构基因(s

2、tructuregene)DNA分子中能转录出RNA的区段。模板链(templatestrand)Watson,W链、负(-)链、反意义链以该链中的DNA碱基顺序指导RNA的合成即被转录的那条DNA链。编码链(codingstrand)Crick,C链、正(+)链、有意义链不被转录的那条DNA链,但其碱基顺序除T代替U外,其余与mRNA相同。5′3′3′3′5′5′DNARNA转录方向模板链、负(-)链、反意义链编码链、正(+)链、有意义链不对称转录(asymmetrictranscription)DNA双链上,仅一股链转录,另一股不转录。有意义链与反意义

3、链并非固定不变。转录方向都是5´→3´转录空泡(transcriptionbubble)由RNA聚合酶-DNA-RNA形成的转录复合物称14.2原核生物的转录模板:DNA(不对称转录)原料:NTP酶:RNA聚合酶产物:mRNA、tRNA、rRNA、小RNA配对:A-U、T-A、G-C方向:5´→3´引物:不需要(启动子)14.2.1原核生物的RNA聚合酶大肠杆菌的RNA聚合酶是由四个亚基组成的五聚体蛋白质αα、β、β´、σ核心酶:ααββ´(参与转录全过程)全酶:ααββ´σαα:决定哪些基因被转录β:结合底物,形成磷酸二酯键(催化)β´:结合模板(开链)

4、σ:识别起始点启动子(延长时脱落)σ—开始合成RNA链时必需有σ因子,一旦合成开始即释放出来β´—参与酶与底物的结合,以及与σ因子和核心酶的结合β—参与σ因子和核心酶的结合,并与RNA合成的引发、延伸α—与结合模板、酶的滑动及碱基识别有关14.2.2转录的起始启动子(promoter)位于结构基因上游,与RNA聚合酶识别、结合并起始转录的一段DNA序列。转录起始点为+1上游序列为负数下游序列为正数三个功能区: ①转录起始部位:+1bp②结合部位:-10bp,TATAAT,Pribnow盒③识别部位:-35bp,TTGACA,σ亚基识别的部位(1)全酶与模板

5、结合,σ亚基辨认-35区,与-10区牢固结合。(2)局部DNA解开:形成开放性复合物。(3)β亚基催化形成第一个磷酸二酸键,形成转录起始复合物(不需引物),新生RNA的5´端通常是pppA或pppG。(4)σ亚基脱落,与其他核心酶结合成全酶,反复利用。14.2.3RNA链的延伸模板链沿核心酶以40nt/s的速度移动,使新生RNA链不断延伸。拓扑异构酶负责消除转录泡前的正超螺旋,形成转录泡后的负超螺旋。使转录泡也随转录过程移动,且保持约17bp的长度。一旦转录泡离开启动子一定的距离,另一个RNA聚合酶即可与该启动子结合。σ亚基释放后,进入RNA链的延长阶段。

6、核心酶从DNA的3´端向5´端移动,RNA链的合成方向是5´→3´。14.2.4转录的终止转录终止于具有终止功能的特定DNA序列,这一特定的序列称作终止子,协助RNA聚合酶识别终止子的辅助因子(蛋白质)称终止因子分为两类不依赖于ρ因子的终止子,属于强终止子依赖于ρ因子的终止子,属于弱终止子(1)依赖ρ因子的终止ρ-因子的结构:六聚体,依赖RNA的NTP酶活性,RNA-DNA解旋酶活性,与单链RNA结合。(2)非依赖ρ因子的终止DNA模板上有终止信号:富含GC/AT的回文结构转录出来的RNA自身互补形成发夹状结构(hairpin)3´尾端富含GC,茎环末端紧

7、跟多个连续的U(≥4个U)Pol遇此结构停止工作DNA和RNA(dA:rU)稳定性下降,DNA恢复双链,释放转录产物14.3真核生物的转录真核生物转录的基本过程与原核生物相似,但是真核生物有三种RNA聚合酶,转录步骤和转录调控更加复杂。真核生物转录过程大致分为装配、起始、延伸和终止四个阶段,其延伸和终止与原核生物大致相似。14.3.1真核生物的RNA聚合酶有三种,高度分工,不同的RNA聚合酶负责合成不同的RNA都能依赖模板合成RNA,但都不能直接识别启动子和起始转录。14.3.2真核生物转录的起始顺式作用元件:真核生物的DNA包括许多参与转录调控的序列启动

8、子逐步与某些转录因子及RNA聚合酶结合(或装配),在模板DNA上形

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