沈萍微生物学第十二章课件.ppt

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1、第十二章微生物的进化、系统发育和分类鉴定序：进化的概念：两种分类原则：第一节进化的测量指征一，进化指征的选择二，rRNA作为进化指征16SrRNA特点8/30/2021416SrRNA特点：1、16SrRNA存在于所有生物中并执行相同的功能—合成蛋白质。2、进化相对保守，分子序列变化缓慢；3、相对分子质量适中；4、16SrRNA普遍存在（真核生物为18SrRNA)；5、微生物的16SrRNA可从样品中直接提取，分析、比较其序列，进而确定其家族树中位置全生命系统树－－(Olsen&Woese1993)三，三界生物的主要特征微生物分类学微

2、生物分类学一门按微生物的亲缘关系把他们分门别类的排成各种分类单元或分类群的学科分类学任务分类、鉴定、命名微生物分类学的发展经典分类学微生物系统学一，分类单元及等级界Kingdom原核生物界门phylum细菌门纲class真细菌纲目order放线菌目科family分支杆菌科属genus分支杆菌属种species结核分支杆菌第二节细菌分类种的概念种：最基本的分类单位是一群表型特征高度相似、亲缘关系极其接近、与同属内其他种有着明显差异的菌株的总称菌株某条件、地区分离得到的具体菌株。它是由一独立分离的单细胞繁殖而成的纯遗传型群体及其一切后代，典

3、型菌株、模式株微生物的学名俗名结核杆菌：结核分歧杆菌学名菌种的科学名称，是按照“国际命名法则”进行命名并受国际学术界公认的通用正式名称，由拉丁词或拉丁化的词构成林奈的“双名法”三名法双名法学名属名：首字母大写，斜体字种名加词：小写，斜体字（首次定名人）：正体字，用括号现在定名人：正体字定名年份双名法的实例大肠埃希氏菌枯草芽孢杆菌Escherichiacoli(Migula)CastellanietChalmers1919Bacillussubtilis(Ehrrnbeg)Cohn1872三名法属名+种名加词+(subsp.或var.)+

4、亚种(变种)加词实例苏云金芽孢杆菌蜡螟亚种Bacillusthuringiensissubsp.galleria酿酒酵母椭圆变种Saccharomycescerevisiaevar.ellipsoideus有关学名的其他知识属名：表示该微生物主要特征的名词或用作名词的形容词，单数常代表微生物的主要特征，如形态（芽孢杆菌属、葡萄球菌属）、生理（乳杆菌属）更多学名连在一起，若属名相同，属名可缩写有关学名的其他知识种名加词：代表一个种的次要特征，补充说明微生物的颜色、形状、用途等次要特征。也可以从人名（巴斯德酵母）、地名（华根霉）衍生而来有关

5、学名的其他知识未完成鉴定的菌种：种名加词可用sp.或spp.表示学名的发音：拉丁字母规则发音，欧美学者按自己语种发音亚种以下的几个分类名词不受国际命名法规限制亚种：进一步细分种时所用的单元，一般指除某一明显而稳定的特征外，其余鉴定特征都与模式种相同的种。命名方法按照三名法处理变种：与亚种是同义词，现在很少使用菌型：曾用作菌株的同义词，现已废除，仅作若干变异型的后缀菌群：两种微生物介于他们之间的一些过渡类型的菌种，具有某些共同性状。如：大肠菌群包括大肠杆菌、产气肠细菌及他们之间的过渡类型菌株（品系）菌株名称＝属名+种的加词+菌株代号，菌株

6、代号可随意用字母、符号、编号或字母加编号等自行决定大肠杆菌K12菌株E.coliK12E.coliO157:H7：致病性，抗原特征模式菌株：菌落、菌株、菌苔、斜面、菌种、培养物、分类依据:一、形态特征（个体和群体）细胞形态：形状、大小、排列、染色反应等。培养：固体—菌落，半固体—穿刺，液体。二、生理生化反应营养要求：碳源、氮源、营养类型代谢产物：种类、产量、显色反应酶：产酶种类、反应特性第三节微生物分类鉴定的特征和技术三、其他血清学反应血清学试验与噬菌体分型近年又发展了红外光谱，gc含量，dna杂交等。生态学特征相互关系、宿主种

7、类、与氧关系等。四、氨基酸和蛋白质分析五、核酸的碱基组成和分子杂交某一特定种的DNA碱基组成是恒定的。GC含量以碱基全部克分子中G和C的摩尔百分数表示：G+CG+C+A+T×100%=（G+C）mol%所得数值范围从23~751.DNA的碱基组成(G+Cmol%)每个生物种都有特定的GC%范围，因此可以作为分类鉴定的指标。细菌的GC%范围为25--75%，变化范围最大，因此更适合于细菌的分类鉴定。GC%测定主要用于对表型特征难区分的细菌作出鉴定，G+C含量的比较主要用于分类鉴定中的否定但具有相似G+C含量的生物并不一定表明它们之间具有近

8、的亲缘关系。同一个种内的不同菌株G+C含量差别应在4～5%以下；同属不同种的差别应低于10～15%；若二个在形态及生理生化特性方面及其相似的菌株，如果其G+C含量的差别大于5%，则肯定不是同一个种，大于15