第13章 DNA生物合成(简明生物化学)ppt课件.ppt

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1、第13章DNA的生物合成中心法则基因:是为生物活性产物编码的DNA功能片段,这些产物主要是蛋白质或是各种RNA复制的要点1半保留复制2有起始点、终止点和方向3半不连续复制第一节半保留复制半保留复制:当细胞分裂,DNA进行复制时,双螺旋结构解开而成为单链,用于合成新的互补链。子代细胞出现新的DNA双链,其中一股单链是从亲代完整地接受过来的旧链。另一股单链完全重新合成的新链,且按碱基配对原则与旧链互补。1、Watson和Crick的半保留复制模型:DNA双螺旋的两条链碱基通过A-T、G-C之间的氢键联结,并且两条链互

2、补。因此,Watson和Crick提出DNA的半保留复制模型:双螺旋揭开,每条链作为模板,以四种脱氧核苷三磷酸(dNTP)为底物,在依赖于DNA的DNA聚合酶催化下,按照A-T、G-C配对方式,合成与两条模板链脱氧核苷酸对应的两条新链,然后以一新一旧脱氧多核苷酸组成的双链分别进入子细胞。2、模型的试验证明:1958年Meselson和Stahl用密度梯度离心法结合同位素标记法进行证明试验:(1)将大肠杆菌在含标记的15NH4Cl的培养基内,繁殖12代,保证DNA上的N都是15N;(2)将上述培养好的细菌转入到含1

3、4NH4Cl的培养基中继续培养,并在细菌刚转入14NH4Cl中(0代)以及在此培养基中分裂1、2、3、4代时分别取样分析;(3)DNA用密度梯度平衡离心法进行高速长时间离心,由于15N-DNA的比重大于14N-DNA,在氯化铯溶液中离心时分别处在不同密度的层次中(重在下,轻在上),结果:0代:两条单链全为重的(处于下层);1代:全部为一轻一重的杂合分子(处于上层和下层之间一个单层);2代:一种是15N-14N,与第1代的一样;另一种是全部轻的14N-14N。为1∶1;3代:仍有两种分子,但14N-14N增多,为1

4、∶3;4代:两者比为1∶7。DNA半保留复制的证据3、意义:DNA在代谢上的稳定保证了遗传信息的稳定性。第二节DNA复制的酶学1.底物:dNTP(dATP,dGTP,dCTP,dTTP)2.聚合酶:DNA聚合酶(DNA依赖的DNA聚合酶)DNA--pol3.模板:单链的DNA母链4.引物:寡核苷酸引物(RNA)5.其他酶和蛋白质因子:解链酶,解旋酶,单链结合蛋白,连接酶DNA聚合酶的活性5′至3′的聚合活性5′→3′方向核酸外切酶活性5′→3′外切酶活性3′→5′外切酶活性一、聚合酶催化的反应5′至3′的聚合活性

5、(5′→3′)核酸外切酶活性3′→5′外切酶活性5′→3′外切酶活性聚合反应在DNA聚合酶催化下,四种脱氧核糖核苷三磷酸(dATP、dGTP、dCTP、dTTP)被加到DNA链的3’末端,同时释放出无机焦磷酸。1、DNA链的游离3’-羟基对进入的dNTP磷原子发生亲核攻击,形成3’,5’-磷酸二酯键,并脱下焦磷酸2、形成磷酸二酯键的能量来自α-与β-磷酸基之间高能键的裂解3、聚合反应可逆,但随焦磷酸的水解可推动反应的完成4、DNA链由5’向3’方向延长5、需要有游离的3’-羟基,即需要引物链二、DAN聚合酶结构(

6、一)原核生物:polⅠ:与校读,修复有关A、DNA聚合酶活力:通过核苷酸聚合反应使DNA链沿5’→3’方向延长;B、3’→5’核酸外切酶活力:由3’端水解DNA链。在正常情况下该活力受抑制,一旦出现错配碱基时,聚合反应停止,该活力会切去错配碱基,起校对作用;C、5’→3’核酸外切酶活力:由5’端水解DNA链。切除嘧啶二聚体和RNA引物。小片段:5′→3′核酸外切酶活性大片段(Klenow片段):聚合活性、3′→5′外切活性(常用的工具酶)polⅡ:以带有缺口的双链DNA为模板和引物,从5’→3’方向合成DNA,同

7、时具有3’→5’外切酶活力。可能在DNA的修复中起作用。polⅢ:真正起复制作用的酶。由10种亚基组成的不对称二聚体,α、ε、θ组成核心酶活性:聚合活性、3′→5′外切活性α+ε+θpolⅢ(核心酶)polⅢ(核心酶)+τpolⅢ’polⅢ’+γ+δpolⅢ*(全酶)α具有聚合酶活力,ε具有校对功能,θ是组建核心酶因子,τ是二聚化因子,γ和δ是延长因子,β识别引物并引导聚合酶结合,复制起始时被释放。pol只作用于有缺口的双链DNA,pol’可作用于有引物的长单链DNA,pol*是天然的聚合酶(二)真核生物(DNA

8、-pol):DNA聚合酶α:与随从链的合成有关。需要以缺口双链或带引物的单链DNA为模板,引物是DNA或RNA短链,RNA引物由引物合成酶合成DNA聚合酶β:核酸外切酶活性,与修复有关DNA聚合酶γ:存在于线粒体。以RNA为模板,以DNA短链为引物DNA聚合酶δ:与领头链的合成有关。具有3’→5’外切酶活力DNA聚合酶ε:与校读、修复和填补缺口有关核酸外切酶活性和即时校读

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