动物疫病分子流行病学基础知识ppt课件.ppt

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1、动物疫病分子流行病学基础知识陈继明中国动物卫生与流行病学中心2012年3月青岛三个问题给“流行病学”下个定义哪些情况可能导致错误的流行病学调查结论开展分子流行病学调查，通常有哪些步骤培训内容和目的流行病学基础原理如何避免错误的流行病学调查结论如何开展分子流行病学调查活动如何进行病原的核酸序列分析安装和培训三个软件的使用相关说明务实实验暂时开展不起来（场地和人员）后续结果及时告知安全一、单位介绍农业部动物检疫所中国动物卫生与流行病学中心四个分中心北京（中国农科院北京畜牧兽医研究所）上海（中国农科院上海兽医研究所）哈尔滨（中国农科院哈尔滨兽医研究所）兰州（中国农科院兰州兽医

2、研究所）10个业务处室外来动物疫病研究中心动物流行病学调查处人畜共患病监测室畜病监测室禽病监测室兽医卫生评估室动物产品安全检测室国际兽医事务室诊断试剂研究室已经建立的禽病调查体系疫控系统（全国）科研系统（5所）大型疫苗或养殖企业（4家）临床兽医门诊单位（8家）发展目标（1）两年内成为中国北方实力很强的禽病诊断单位10多名高学历技术骨干1000万元仪器设备+P3实验室每年300万元的工作经费对全国和全球禽病信息的及时掌握发展目标（2）五年内成为国际禽新发病协作中心中国禽新发病较多核心技术1：高通量测序（火眼金睛）和高通量序列分析技术（照妖镜）核心技术2：反向遗传技术每年3

3、-5篇SCI论文二、流行病学基本原理流行病学首要目的：说明情况是不是发生某种疫情某种疫病流行情况（感染率、发病率、死亡率）某种病原的变异情况某种疾病的免疫情况（免疫接种率和免疫效果）某种疾病的分布情况（时间、地理、场所、宿主）流行病学第二个目的：说明原因为什么发病？风险因素：地理、天气、宿主、病原感染、免疫、消毒、隔离措施等基本原理：发病多的群体某些特征，是发病之因案例冬季，禽呼吸道病增多（天冷是禽呼吸道病的病因）低洼地区，血吸虫病发病率较高（地势低洼是病因）长期过劳的人们，心肌梗塞发病率较高（长期过劳是病因）抽烟的人，肺癌发病率较高（抽烟是肺癌的病因）充分原因和必要原

4、因大多数病因既不是充分的，也不是必要的不是所有抽烟的人都会得肺癌：不是充分原因不抽烟的人可能也会得肺癌：不是必要原因因果关系通常都是一个网络H5感染免疫失效发生疫情消毒不彻底天气变冷，病毒在外界存活时间长养殖场位置：设在公路旁，病毒进入养殖场活禽运输，从外地引入病毒到公路两旁病毒变异流行病学第三个目的：解决问题掌握了情况发现了原因（风险因素）提出针对性的解决办法基本原理：发病少的群体某些特征，是防病之道2400年前的雅典人类瘟疫喝烧开的水火焰消毒案例2：天花疫苗的发现流行病学基本原理发病多的群体某些特征：病因找出分布差异发病少的群体某些特征：控制办法历史悠久战国时期的秦

5、朝诸侯国的马车来到秦国火焰消毒车轮子，防止马病传到中国中国兽医历史5000年前兽医鼻祖“马师皇”给黄帝服务用草药和针灸给龙治病秦唐之间，设“国家首席畜牧兽医官太仆，九卿之一秦九卿为：奉常、郎中令、卫尉、宗正、太仆、廷尉、典客、治粟内史、少府太仆的考核指标：畜禽死亡率唐朝以后，兽医地位逐渐下降中国兽医历史1400年前（隋）：太仆寺（国家畜牧兽医局）（120个编制）1300年前（唐）：太仆寺编制600人，4位教授，出版教科书，开展兽医学教育（比法国里昂学院1762年早1000多年）1905年：西方兽医教育，保定马医学堂三、如何避免得出错误地流行病学调查结论1.不凭空捏造没有

6、计算病毒的变异速率，却下结论：病毒的变异速率加快没有比较牛舍温度较高的一组和牛舍温度较低的一组的发病率，却下结论：牛舍温度较高的牛群发病率较低2.不以偏概全检测1只鸡感染了沙门氏菌，判断整群鸡都感染了沙门氏菌（错）调查一个乡镇4个猪场死淘率平均为10%，判断这个省猪的死淘率平均为10%（错）3.不以感染判病因10个产蛋下降的鸡群都检测到大肠杆菌，因此大肠杆菌感染是产蛋下降的原因（错）10个产蛋下降的鸡群都检测到H9病毒感染，因此H9病毒感染是产蛋下降的原因（不一定对）4.被调查的两组背景要相似甲地仔猪腹泻发病率为35.3%（353/1000）乙地成年猪腹泻发病率为6.6

7、%（66/1000）甲地猪的腹泻发病率显著高于乙地（错）5.识别真伪收集的信息很多是错误的（疫情和政绩挂钩）数据的运算和推论，也可能存在错误任何检测都有假阳性和假阴性案例1某地羊群出现不明原因死亡，症状像小反刍兽疫开展紧急流行病学调查血清抗体检测，发现2只羊抗体阳性病原学检测，没有检测到阳性结果如何判断？案例2调查发现：被狗咬过的一组人群狂犬病的抗体阳性率为24%没有被狗咬过的一组人群狂犬病的抗体阳性率为6%结论：狂犬病存在隐性感染？6.排除干扰因素某鸡场接种H5禽流感疫苗后，21天后抗体合格率35%，判断疫苗不合格不一定对被接种的鸡在接