课件微生物的分类备课讲稿.ppt

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1、课件微生物的分类微生物的分类微生物分类学(microbialtaxonomy)是一门按微生物的亲缘关系，把它们安排成条理清楚的各种分类单元或分类群(taxon)的科学。它的具体任务涉及3个方面：分类(classification)、命名(nomenclature)和鉴定(identification)。分类指的是根据相似性或亲缘关系，将一个有机体放在一个分类单元中。命名是按照国际命名法规给有机体一个科学名称。鉴定是确定一个新的分离物是否归属于已经命名的分类单元的过程。微生物分类学是对各个微生物进行鉴定，按分类学准

2、则排列成分类系统，并对已确定的分类单元进行科学命名的学科。一、微生物的分类单元微生物的主要分类单位，依次为界(kingdom)、门(phylum或division)、纲(class)、目(order)、科(fami1y)、属(genus)、种(species)，其中种是最基本的分类单位。具有完全或极多相同特点的有机体构成同种；性质相似、相互有关的各种组成属；相近似的属合并为科；近似的科合并为目；近似的目归纳为纲；综合各纲成为门；由此构成一个完整的分类系统。界：原核生物界(Procaryotae)门：薄壁菌门(Gr

3、acilicutes)纲：暗细菌纲(Scotobacteria)目：螺旋体目(Spirochaetales)科：钩端螺旋体科(Leptospiraceae)属：钩端螺旋体属(Leptospira)种：问号钩端螺旋体(L.interrogans)每个分类单位都有亚级，即在两个主要分类单位之间，可添加“亚门”、“亚纲”、“亚目”、“亚科”等次要分类单位。在种以下还可以分为亚种、变种、型、菌株等。属是科与种之间的分类单元，通常包含具有某些共同特征和关系密切的种。Goodfellow和O’Donnell(1993)提出D

4、NA的G+Cmol%差异≤10％～12％及16SrRNA的序列同源性≥95％的种可归为同一属。种(species)伯杰氏(Bergey)给种的定义是：“凡是与典型培养菌密切相同的其他培养菌统一起来，区分成为细菌的一个种”。因此，种是以某个“标准菌株”为代表的十分类似的菌株的总体。在微生物学中较常见的有生物学种(biologicalspecies，BS)，进化种(evolutionaryspecies，ES)和系统发育种(phylogeneticspecies，PS)等不同的物种概念。1987年，国际细菌分类委员会

5、颁布，DNA同源≥70％，而且其⊿Tm≤5℃的菌群为一个种，并且其表型特征应与这个定义相一致。1994年Embley和Stackebrandt认为当16SrDNA的序列同源性≥97％时可认为是一个种。亚种(subspecies)同1个种内，有些菌株的遗传特性关系密切，但在表型上存在较小的某些差异，可分为2个或2个以上小的分类单位，称为亚种。亚种是细菌分类中具有正式分类地位的最低等级。型(type)型为亚种以下的分类等级，通常表示用某些特殊的特征加以区别的菌株类群。在细菌分类中，主要有以下型：生物型(biovar)

6、表示特殊的生化或生理特征；血清型(serovar)表示结构的不同；致病型(pathovar)表示某些寄主的专一致病性；噬菌型(phagovar)表示对噬菌体的特异性反应；形态型(morphovar)表示特殊的形态特征。菌株(strain)表示任何由一个独立分离的单细胞（或单个病毒颗粒）繁殖而成的纯遗传型群体及其一切后代。从自然界中分离得到的任何一种微生物的纯培养物，都可以称为微生物的一个菌株；菌株是微生物分类和研究工作中最基础的操作实体。从自然界分离纯化得到的纯培养的后代，经过鉴定属于某个种，但由于来自不同的地区

7、、土壤和其他生活环境，它们总会出现一些细小的差异。从自然界采样分离纯化而得到的、尚未经鉴定的纯培养后代，则称为分离物。但习惯上也将其称为菌株，并由其获得者对其进行编码，且编码无任何规则。菌株与型的区别：菌株之间不存在鉴别性特征的差异，命名不同的菌株无需分类学依据；不同型的细菌之间存在鉴别性特征的差异，命名或鉴定不同的型必需有分类学依据。群这只是为了科学研究或鉴定工作方便，首先按其形态或结合少量的生理生化、生态学特征，将近似的种和介于种间的菌株归纳为若干个类群。如为了筛选抗生素工作的方便，中科院微生物研究所根据形态

8、和培养特征，把放线菌中的链霉菌属归纳为12个类群。微生物分类各级单元所用的后缀如下表。微生物分类各级单元拉丁学名后缀表TableTheofpostfixofLatinscientificnameofmicroorganism分类单位藻类细菌真菌原生动物门-phyta亚门-phytina-mycotina纲-phyceae-mycetes亚纲-phycidae-myceti