苹果茎痘病毒的ic_rt_pcr检测

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1、江苏农业科学2014年第42卷第5期—63—李丽丽,付耕云,杨洪一.苹果茎痘病毒的IC-RT-PCR检测[J].江苏农业科学,2014,42(5):63-65.苹果茎痘病毒的IC-RT-PCR检测122李丽丽,付耕云,杨洪一(1.黑龙江省林业科学研究所,黑龙江哈尔滨150081;2.东北林业大学生命科学学院,黑龙江哈尔滨150040)摘要:利用CTAB缓冲液提取苹果叶片粗提液,以苹果茎痘病毒(ASPV)的抗血清包被薄壁管,捕获感病叶片粗提液中的ASPV病毒粒子;最终进行RT-PCR反应扩增ASPV特异片段,建立了利用免疫捕获RT-PC

2、R(IC-RT-PCR)技术检测ASPV的技术体系。结果显示,IC-RT-PCR可有效检测ASPV,且对栽培苹果、海棠、杏、毛樱桃样品的检测皆有效。IC-RT-PCR无需提取RNA,只需叶片粗提液,步骤简单;IC-RT-PCR技术受叶片中杂质影响较小,可有效检测不同植物样品中的ASPV,具有重要应用价值。关键词:苹果茎痘病毒;IC-RT-PCR;粗提液中图分类号:S436.611文献标志码:A文章编号:1002-1302(2014)05-0063-02苹果茎痘病毒(applestempittingvirus,ASPV)是一种严核酸纯度

3、低影响扩增的问题。基于IC-RT-PCR的优势,本重危害果树生产的潜隐性病毒,主要侵染苹果和梨,从而导致研究探索利用IC-RT-PCR技术检测ASPV,从而希望获得[1]苹果和梨产量降低、品质变差。ASPV最早于1954年在美一种可有效检测ASPV的技术体系。[1]国森林苹果(Malussylvestris)上被发现,目前在世界各地广1材料与方法泛分布。ASPV在一些敏感的砧木和栽培品种上症状较明显,主要表现为叶片反卷、木质部茎痘斑、果实凹陷、叶偏上性1.1植物材料[2]生长等。为了进一步控制病毒危害,迫切需要灵敏、快速苹果植株购自浙

4、江,海棠和杏样品取自吉林九台。35株的病毒检测技术,因此本研究探索了用于检测ASPV的IC-毛樱桃样品取自黑龙江省哈尔滨市,其中20株取自东北林业RT-PCR技术。生物学方法是最传统的植物病毒检测方法,大学校园,其他为哈尔滨街边绿化苗木。主要是将病毒转移到木本或草本指示植物上,通过病毒在敏1.2引物感的指示植物上显示一些典型症状来确定病毒的存在。刘福引物ASPV1、ASPV2序列分别为:5'-GAGCTCATAGGT-昌等利用生物学方法对我国苹果、梨受ASPV感染情况进行GCGTTCAATCAT-3'、5'-CTCGAGTCACTTC

5、CTGATGGATA-了大规模的病毒筛查,结果显示该方法可有效鉴定ASPV,其AA-3',由TaKaRa公司合成。[3]缺点是周期长、易受季节和环境等因素影响。基于基因组1.3总RNA提取[4]学的发展,国内外研究人员已获得ASPV的基因组序列,以取新鲜的植物叶片约0.05g,在液氮中迅速研磨,转入至此为基础,并进一步开始探索利用PCR技术进行病毒检测。1.5mL离心管中,再向离心管中加入490μLCTAB缓冲液和早在1998年Nemchinov等即开始探索利用RT-PCR技术检10μLβ-巯基乙醇,至振荡器上混匀,65℃恒温水浴10

6、min,[5]测ASPV并取得了成功。我国从20世纪末开始了苹果病其间上下颠倒离心管使混合溶液混匀;加入与混合液等体积毒的RT-PCR检测研究,侯义龙等首先探索建立了ASPV的的三氯甲烷/异戊醇(体积比为24∶1),颠倒至均匀,RT-PCR检测体系,并对一些田间样本进行了小规模检12000r/min离心5min;弃沉淀,抽取上清液转移至新的[4,6]测。RT-PCR技术的缺点在于其稳定性较差,提取高质1.5mL离心管中,再次加入与上清液等体积的三氯甲烷/异量苹果、梨核酸较难,而核酸中的杂质影响DNA聚合酶的稳戊醇(24∶1),混匀,1

7、2000r/min离心5min;弃沉淀,抽取上[7]定性,因而有较多PCR检测结果不稳定的报道。为了提高清至已加入2倍体积的无水乙醇的1.5mL离心管中,混匀,PCR反应的稳定性,一些基于PCR技术的新技术被开发并不12000r/min离心5min;弃上清,加入300μLTE溶解沉淀,断完善。免疫捕获RT-PCR(immunocaptureRT-PCR,12000r/min离心5min;弃沉淀,吸上清液至新的1.5mL离IC-RT-PCR)是近年来新发展起来的一种联合血清学和分心管中,加入1/10体积的醋酸钠(NaAc,pH值=5.2

8、)、3倍体子生物学方法的检测技术。IC-RT-PCR首先利用抗血清积的无水乙醇,混匀,12000r/min离心5min;弃上清,加入捕获病毒粒子,再进行RT-PCR反应,解决了因病毒含量和50μL去离子水溶解,低温保存。

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