中国人群乳腺癌遗传易感性研究

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1、分类号学号学校代码密级博士学位论文中国人群乳腺癌遗传易感性研究学位申请人:陈伟学科专业:流行病与卫生统计学指导教师:缪小平教授答辩日期年月ADissertationSubmittedtoHuazhongUniversityofScienceandTechnologyfortheDegreeofDoctorGeneticsusceptibilitystudyofBreastCancerinChinesepopulationApplicant:WeiChenSpeciality:EpidemiologyandHealthStatistics

2、Supervisor:Prof.XiaopingMiaoHuazhongUniversityofScience&TechnologyWuhan430074,P.R.ChinaMay,2015独创性声明木人郑重声明,本学位论文是本人在导师指导下进行的研究工作及取得的研究成果的总结。尽我所知,除文中己经标明引用的内容外,本论文不包含任何其他个人或集体己经发表或撰写过的研究成果。对本文的研究做出贡献的个人和集体,均己在文中以明确方式标明。本人完全意识到本人将承担本声明引起的一切法律后果。学位论文作者签名:日期:年厂月学位论文版权使用授权书本学

3、位论文作者完全了解学校有关保留、使用学位论文的规定,即:学校有权保留并向国家有关部门或机构送交论文的复印件和电子版,允许论文被查阅和借阅。本人授权华中科技大学可以将本学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索,可以采用影印、縮印或扫描等复制手段保存和汇编本学位论文。保密口,在年解密后适用本授权书。本论文属于不保逹请在以上方框内打“”目录论文缩写词汇中英文对照表中文摘要第一章:乳躲癌全基因组关联研究发现位点与中国人群的关联研究及交互作用分析前课職材料和方法统计分析線册创新点与不足誠参考文献:第二章:结合位点遗传变异与中国人群孰膝痛遗传

4、易感性关联研究前言课究思路第一部分:基因上的功能性突变位点与中国人群乳臁癌易性研研究背景材料和方法统计衡縣创新点与不足结论第二部分:结合区域通传变异与中国人群乳胜癌遗传易感性的关联研究研究背景生物信息学预测材料和方法统计■縣讨论创新点与不足誠今后的研究方向考文献:乳腺痛后全基因组关联研究策略及进展致谢攻读学位期间所取得的成果华中科技大学博士学位论文论文縮写词汇中英文对照表缩写词英文全称中文全称乳腺癌全基因组关联研究单核苷酸多态哈迪温伯格平衡国际癌症研究机构错误发现率连锁不平衡随机森林袋外数据多因子降维非条件回归雌激素受体孕激素受体检验准

5、确性交叉验证一致性最小等位基因频率比值比置信区间染色质免疫共沉淀测序华中科技大学博士学位论文第一章乳腺癌全基因组关联研究发现位点与中国人群的关联研究及交互作用分析博士研究生:陈伟导师:缪小平教授摘要研究背景:乳腺癌是女性中最常见的一种恶性肿瘤,不管是在发达国家还是在发展中国家,乳腺癌均位于女性恶性肿瘤发病率的首位。大量的流行病学研究表明,乳腺癌是一种由环境因素与遗传因素共同导致的高异质性疾病。相同环境因素暴露情况下,个体患乳腺癌的风险不尽相同,说明个体遗传因素在决定乳腺癌的易感性方面发挥重要作用。目前,乳腺癌的全基因组关联研究已经发现了

6、很多与乳腺癌的遗传易感性相关的单核昔酸多态位点。但是大多数的都是在欧美人群中进行,而在中国人群中的数据相对较少,同时这些发现的位点之间的交互作用如何,我们还知之甚少。研究目的:(分析发现位点与中国人群乳腺癌发病风险的关系。分析关联分析得到的风险易感位点与绝经状况之间的环境基因相乘交互作用。(分析这些发现位点之间的基因基因交互作用对乳腺癌发病风险的影响。研究方法:本研究我们采用以医院为基础的病例对照研究设计,利用多分析方法策略,采用包含随机森林,多因子降维(和非条件回归的方法综合评价发现的个位点与乳腺癌发病风险的关系,以及这些位点之间的高

7、阶交互作用。运用基因分型技术对发现位点进行基因型华中科技大学博士学位论文检测。分别采用检验和检验比较病例组和对照组人学资料中的分类变量如绝经状况和连续性变量如年龄等。采用拟合优度检验该位点的基因分型是否符合平衡。采用回归模型分析单个位点与乳腺癌发病风险的关系,应用软件分析位点之间的连锁不平衡程度。研究结果::本次研究共纳入例乳腺癌病例和例健康女性对照。年龄及绝经状况分布在病例组与对照组中比较无统计学差别。病例组中,有例病人被诊断为雌激素受体阳性,占所有病例的,例为阴性;另外有例患者被诊断为孕激素受体阳性,例阴性,此外还有例病人的和信息由

8、于资料缺失而无法获知。(在此次病例对照研究的个发现位点中,有包含和在内的个位点在进行单位点分析时被发现与中国人群乳腺癌的发病风险相关。并且在经过了错误发现率的校正之后,,和四个位点仍然与乳腺癌发病风险相关。

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