中国西安汉族人群脑胶质瘤及其亚型遗传易感性关联研究

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1、.-?-iJ分类号:Q39学校代码:10697密级:公开学号:201231542XJ9Q2jXNorthwestUntiversi.,y专业字位硕士i2文'SDSPECISSERTATIONIALIZEDMASTER中国西安汉族人群脑胶质痛及其亚型遗传易感性关联研究工学科名称:生物程专业学位类别:工程硕士作者:杜淑莉指导老师:陈超教授西北大学学位评定委员会二〇一五年西北大学学位论文知识产权声明书本人完全了解西北大学关于收集、保存、使用学位论文的规定。学校有权保留并向国家有关部门或机构

2、送交论文的复印件和电子版。本人允许论文被查阅和借阅。本人授权西北大学可以将本学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索,可以采用影印、缩印或扫描等复制手段保存和汇编本学位论文。同时授权中国科学技术信息研宄所等机构将本学位论文收录到《中国学位论文全文数据库》或其它相关数据库。保密论文待解密后适用本声明。政学位论文作者签名:指导教师签名:dOit年月5日年6月日知I-上西北大学学位论文独创性声明本人声明:所呈交的学位论文是本人在导师指导下进行的研究工作及取得的研究成果。据我所知,除了文中特别加以标注和致谢的地方外,本论

3、文不包含其他人已经发表或撰写过的研宄成果,也不包含为获得西北大学或其它教育机构的学位或证书而使用过的材料一。与我同工作的同志对本研究所做的任何贡献均已在论文中作了明确的说明并表示谢-tV-届、0学位论文作者签名:;'L邮?<5y年月J日中文摘要一背景:胶质瘤是最具侵略性的肿瘤之。目前的证据表明,大部分的遗传风险对胶质瘤易感性起主要作用,而且胶质瘤是由多个低风险的突变共同遗传的。这些突变已经被确定,通过相关的研究,诸如全基因组关联研究。这就逐步引导脑胶质瘤流行病学研究人员专注于找寻相关胶质瘤的潜在致病因素。-14方法:我

4、们采用病例对照的研究策略,选取2010年12月至20年4月期间来自唐都医院423例胶质瘤患者和302例健康对照,对54个基因上的78个单核苷酸多态性位点进行了脑胶质瘤与遗传因素的关联分析研究。我们使用SequenomMassARRAYRSIOOO基因分型技术进行SNP分析。我们利用exacttest方法对对照组进行Hard-tyWeinberg平衡检验;无条件Logisics回归方法计算风险等位基因的相对优势比oddsratios和95%的置信区间,衡量这些突变等位基因与胶质瘤的相关效应。利用一Haloview和SNPstats分析位于

5、同个基因上若干个位点的连锁程度及单体型效应p。53676五GF沿4371114结果:在等位基因模型下,r£i?Trs28,5730,^506105和^68727,GSTPhs\695,SHANK2rs7l2472S与脑胶质瘤患病风险强烈相关p<0.05;/Z4rs2243248,()TERTts2S53676,EGFRrs730437,rsll506105和rsl468727,CCDC26rs6470745,SHANKK2rsl\2A12%,?ZC52rs12439272与星形胶质瘤患病风险强烈相关(p<0.05);RPASv

6、sA140805位点与胶质母细胞瘤患病风险强烈相关。Lo-addt五沿4逻辑回归分析发现,在giive模型下,S73037、rsll506105、rs845552增加胶质瘤的患病风险。在隐性模型下,五GF7?rsl468727CC基因型增加胶质瘤的发病-处风险。在Logadditive遗传模式下,五GFs730437、rsll506105增加星型细胞瘤的患病风险。在隐性模型下,五C?Fi?rsl468727CC基因型增加星型细胞瘤的患病风险。隐性模型下,:rP53rsl042522CC基因型提高了脑胶质瘤的患病风险。显性模型下,G灯P7

7、rs-l695AGGG基因型个体与携带AA者比较,其患胶质瘤的风险降低了30%。在隐性模型下,CC:iX:2(Jrs6470745GG降低了星型细胞瘤的发生风险;在显性模型:下(:ax2(Jrs891835增加了。,胶质母细胞瘤患病风险/I¥i?rsl801275的突变等位基因降低了胶质瘤和胶质母细胞瘤的风险;TERTrs2853676增加了脑胶质瘤和星型细胞瘤的发生风险。在显性模型下,兄R4Jrs2160138和rs4140805增加胶质母细胞瘤的发病风险;在-Logadditive模型下,XRCC5ts92SS516位点的突变降低了

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