石栗accB与accC基因全长cDNA克隆及表达分析

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1、硕士硕士学位论文张艳石栗accB石栗accB与accC基因全长cDNA克隆与accC及表达分析基因全长cDNA克隆及表达分析张艳2014二○一四年六月分类号S792.99学校代码10593*UDC633.8硕士学位论文石栗accB与accC基因全长cDNA克隆及表达分析张艳学科专业作物栽培学与耕作学指导教师禤维言副教授论文答辩日期2014年5月学位授予日期2014年6月答辩委员会主席李荣柏研究员广西大学学位论文原创性和使用授权声明本人声明所呈交的论文,是本人在导师的指导下独立进行研究所取得的研究成果。除已特别加以标注和致谢的地

2、方外,论文不包含任何其他个人或集体已经发表或撰写的研究成果,也不包含本人或他人为获得广西大学或其它单位的学位而使用过的材料。与我一同工作的同事对本论文的研究工作所做的贡献均已在论文中作了明确说明。本人在导师指导下所完成的学位论文及相关的职务作品,知识产权归属广西大学。本人授权广西大学拥有学位论文的部分使用权,即:学校有权保存并向国家有关部门或机构送交学位论文的复印件和电子版,允许论文被查阅和借阅,可以将学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索和传播,可以采用影印、缩印或其它复制手段保存、汇编学位论文。本学位论文属于:□保

3、密,在年解密后适用授权。□不保密。(请在以上相应方框内打“√”)论文作者签名:日期:指导教师签名:日期作者联系电话:15077021601电子邮箱:380006773@qq.com石栗accB与accC基因全长cDNA克隆及表达分析摘要石栗(Aleuritesmoluccana)是大戟科(Euphorbiaceae)的木本油料植物,其种子油脂含量很高,是一种很重要的生物质能源植物。本试验克隆获得石栗ACCase中BCCP(生物素羧化酶载体蛋白,biotincarboxylasecarrierprotein)亚基以及BC(bio

4、tincarboxylase,生物素羧化酶)亚基的编码基因accB与accC的全长cDNA序列,对其进行生物信息学分析,并通过半定量RT-PCR分析这两个基因在石栗种子不同生长时期中的表达变化,为今后筛选分子标记或研究油脂合成相关酶基因提供参考。1.通过同源克隆法和RACE技术相结合,克隆得到了accB、accC这两个基因的全长cDNA序列,并推导出编码区氨基酸序列。通过NCBI网站及相关软件进行分析比对。结果显示,accB基因全长cDNA序列大小为1170bp,编码区长度为798bp,编码265个氨基酸。accB基因核苷酸序

5、列与基因库中已注册的油桐、麻风树的核苷酸酸序列的同源性依次为:93%和82%,其氨基酸序列与陆地棉、油梨、大豆、苜蓿、麻风树、油桐的BCCP亚基的氨基酸序列同源性分别为:91%、83%、68%、64%、61%、52%;accC基因全长cDNA序列大小长度为1607bp,编码区长度为1119bp,编码372个氨基酸,accC基因核苷酸序列与油桐、麻风树和蓖麻的核苷酸酸序列的同源性分别为:97%、93%和91%,其氨基酸序列与麻风树、陆地棉、烟草、花生、大豆、拟南芥的BC亚基的氨基酸序列同源性分别为:96%、91%、89%、89%

6、、88%、83%。2.采用反转录试剂盒将种子总RNA反转录后,获取了高质量的cDNA。以cDNA为模板,石栗管家基因Actin作为内参,通过半定量RT-PCR分析了石栗accB、accC这两个基因在石栗种子内不同发育时期的表达水平变化。在种子发育过程中accB基因与accC基因表达量大致情况是:六月份>七月份>五月份,同时油脂含量从五月份至七月份三个月间是持续上升的。得出结论:石栗种子油脂含量的升高与石栗accB、accC基因的表达变化有一定相关性。I关键词:石栗;accB基因;accC基因;克隆;表达分析IIWhole-Se

7、quencecDNACloningandExprissionAnalysisofaccBandaccCGenefromAleuritesMoluccana(Linn.)WilldZhangYan(CollegeofAgriculture,GuangxiUniversity,Nanning530004,China)ABSTRACTAleuritesmoluccanaisakindofwoodyoilplantwhichbelongstoEuphorbiaceae.Itsseedscontainhighproportionofoi

8、l,whichmakesAleuritesmoluccanatobeanimportantbiomassenergyplant.Inthisexperiment,whole-sequencescDNAofaccBgeneandaccCgeneofacetylcoenzymeA

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