牡丹泛素延伸蛋白基因ubiquitin克隆及其作为内参基因的研究

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1、园艺学报,2015,42(10):1983–1992.ActaHorticulturaeSinicadoi:10.16420/j.issn.0513-353x.2015-0180;http://www.ahs.ac.cn1983牡丹泛素延伸蛋白基因ubiquitin的克隆及其作为内参基因的研究1,22,*2221,**2,**刘传娇,王顺利,薛璟祺,朱富勇,任秀霞,李名扬,张秀新12(西南大学园艺园林学院,重庆市花卉工程技术研究中心,重庆400715;中国农业科学院蔬菜花卉研究所,农业部园艺作物生物学与种质创制重点实验室

2、,北京100081)摘要:以牡丹品种‘洛阳红’(Paeoniasuffruticosa‘Luoyanghong’)为试验材料,采用RT-PCR方法获得一个牡丹泛素延伸蛋白基因Psubiquitin(PsUBI),其cDNA开放阅读框(ORF)长度为447bp,编码148个氨基酸,GenBank登录号为KP742952。序列比对发现,该基因与其他23种植物泛素延伸蛋白核苷酸序列的相似性均在81%以上,氨基酸序列的相似性达96%。进化分析表明,牡丹泛素延伸蛋白与棉花泛素延伸蛋白的亲缘关系最近。实时荧光定量PCR结果显示,在牡

3、丹不同组织器官中,相对于其他5个常用看家基因(GAPDH、GAPDH1、tubulin、tubulin2、18SrRNA),ubiquitin的PCR扩增曲线的CT值最为恒定,尤其是在不同花器官中的CT值完全一致。进一步分析发现该基因在牡丹的根、茎、叶片、花、雄蕊和心皮组织中均恒定表达,特别是花器官中的表达量几乎完全一致。以ubiquitin作为内参基因探讨控制花器官发育的基因PsAG的表达情况,结果显示PsAG的表达模式与其作用位点相吻合,ubiquitin更适宜作为牡丹花器官研究的内参基因。关键词:牡丹;ubiqui

4、tin;基因克隆;表达分析;内参基因中图分类号:S685.11文献标志码:A文章编号:0513-353X(2015)10-1983-10MolecularCloningofUbiquitinProteinGeneandStudyonThisGeneasReferenceGeneinTreePeony1,22,*2221,**LIUChuan-jiao,WANGShun-li,XUEJing-qi,ZHUFu-yong,RENXiu-xia,LIMing-yang,2,**andZHANGXiu-xin1(Collegeo

5、fHorticultureandLandscapeArchitecture,SouthwestUniversity,ChongqingEngineeringResearchCenterfor2Floriculture,Chongqing400715,China;KeyLaboratoryofBiologyandGeneticImprovementofHorticulturalCrops,MinistryofAgriculture,P.R.China,InstituteofVegetablesandFlowers,Chin

6、eseAcademyofAgriculturalSciences,Beijing100081,China)Abstract:Oneubiquitinproteingenewasobtainedfromtreepeony(Paeoniasuffruticosa‘Luoyanghong’)byRT-PCR.ItwasdesignatedasPsUBIandtheGenBankaccessionnumberwasKP742952.Theopenreadingframe(ORF)ofPsUBIwas447bp,andcoulde

7、ncode148aminoacids.收稿日期:2015–05–07;修回日期:2015–10–08基金项目:国家自然科学基金项目(31501800,31572156);国家公益性行业(农业)科研专项(201203071);国家‘863’计划项目(2011AA10020703);中国农业科学院科技创新工程项目(CAAS-ASTIP-IVFCAAS);中国农业科学院院所基金项目(1610092015002-01)*共同第一作者**通信作者Authorforcorrespondence(E-mail:limy@swu.edu

8、.cn;zhangxiuxin@caas.cn)LiuChuan-jiao,WangShun-li,XueJing-qi,ZhuFu-yong,RenXiu-xia,LiMing-yang,ZhangXiu-xin.Molecularcloningofubiquitinproteingeneandstudyonthi

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