SSR分子标记技术在生物遗传学领域的应用

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1、万方数据安徽农业科学。JournalofAnhuiAgn．Sci．2012，40(2)：640—642责任编辑朱琼琼责任校对卢瑶SSR分子标记技术在生物遗传学领域的应用杨文柱1，焦燕孙(1．内蒙古农业大学农学院，内蒙古呼和浩特010019；2．内蒙古师范大学化学与环境科学学院，内蒙古呼和浩特010022)摘要$SR(sirepiesequencerepeats)分子标记技术作为一种新世纪遗传学研究工具，已被广泛应用于生物遗传多样性、遗传图谱构建、基因定位、分子标记辅助育种、种质真伪和纯度鉴定等研究中，成为生物资源利用、开发和保护常用

2、的方法和技术。关键词SSR；分子标记；生物遗传学；应用中图分类号Q756文献标识码A文章编号0517—6611(2012)02一00640—03ApplicationofSSRMolecularMarkerTechniqueintheFieldofBiogeneticsYANGWen-zhuetal(CollegeofAgronomy，InnerMongoliaAgriculturalUniversity，Hohhot，InnerMongolia010019)AbstractAsageneticresearchtoolinthene

3、wcentury，SSRmolecularmarkerstechniquehasbeenwidelyadoptedintheresearchondiversityofbiogeneties，constructionofthegeneticlinkagemap，locationofgenes，molecularmark—assistedselectionandpuritycontrollingofeultivars，ithasbeencommonlyusedfortheutilization，developmentandprotect

4、ionofbiologicalresources．KeywordsSSR；Molecularmarker；Biogenetics；Application简单重复序列(simplesequencerepeats，SSRs)又称短串联重复序列(shorttandemrepeats，STRs)或微卫星DNA(Mi—crosatelliteDNA)，主要由串联重复单元组成，每个单元长度一般在1～6bp之间。1989年，Litt和Luty扩增到了人类基因组SSR序列，并把这种序列正式定义为微卫星(microsat—dire)’1J。目前常用的

5、分子标记有SSR、RAPD、AFLP、RFLP等。后两者操作较复杂，而RAPD稳定性和重复性较差。SSR与它们相比，具有稳定可靠、操作简单等优点。1SSR标记概述1．1SsR标记胆oSSR标记是当今流行的分子标记技术之一。尽管SSR分布于基因组的不同位置，但其两端多是保守的单拷贝序列，因此可以根据两端的序列设计一对特异引物，通过PCR技术将其扩增出来，利用电泳分析技术获得长度多态性，即SSR标记。1．1．1SSR的分布。3o。SSR广泛存在于真核生物基因组中，少数原核生物基因组中也有。真核生物基因组中SSR的分布是随机的，大约每隔1

6、0～50kb就有1个SSR。它既可以存在于内含子中，又可存在于外显子中。在不同的生物体间，SSR的数量、重复次数和单位、拷贝数变异及染色体分布等有着很大的差别。在真核生物基因组中，二核苷酸微卫星序列最丰富，三核苷酸微卫星的含量比二核苷酸低约10倍，而四核苷酸微卫星序列则相对较少。在植物基因组中(AT)。最多。1．1．2SSR标记的主要特点。SSR分子遗传标记总体来讲分为单位点分子遗传标记和多位点分子遗传标记。当前提到的SSR遗传标记一般是指单位点分子遗传标记，其特点主基金项目国家自然科学基金(41165010)；国家重点基础研究发展

7、计划973项目(2007CBl06806)；国家重点实验室开放课题研究项目(LAPC．KF-2008-03)。作者简介杨文柱(1977一)，男，内蒙古呼和浩特人，硕士研究生，研究方向：甜菜生理与分子生物学，E．mail：yangwzh@imnu．edu．cn。t通讯作者，副教授，博士，从事温室气体与全球变化方面的研究，E．mail：jiaoyan@imnu．edu．cn。收稿日期201l-10-18要有Ho：(DSSR引物能直接从已发表的文献资料或查找近缘种SSR引物来获得，也能够使用经典的分子生物学方法克隆，可节约大量的时间和精力

8、；②在分子遗传学的研究中，相对来说，SSR分子标记容易扩增，且大多都有相应的软件支持系统，使得微卫星分析变得更加容易；③检测手段简单，规模小，可以进行非损伤取样且可在无放射性的实验室中进行；④试验的重复性高，便于进行数据比较；⑤不同等