甘蓝型油菜遗传图谱的构建及农艺性状QTL定位

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1、西南大学硕士学位论文甘蓝型油菜遗传图谱的构建及农艺性状QTL定位姓名：金梦阳申请学位级别：硕士专业：植物学指导教师：吴文彬;刘列钊20060501中文摘要甘蓝型油菜(BrassicanapusL．)是世界重要油料作物，构建一张永久高密度的遗传连锁图谱对推动油菜育种工作的发展将具有重大意义。本研究构建了甘蓝型油菜分子遗传图谱并进行重要农艺性状的QTL定位。主要结果如下：1．以甘蓝型黑籽双低油菜P。。和甘蓝型黄籽油菜GH06杂交衍生来的F：6家系的188个株系为作图群体，构建了一张包含19个连锁群，300个标记位点的甘蓝型油菜遗传连锁图

2、谱，包括202个SRAP标记、65个ssR标记，23个AFLP标记和10个TRAP标记，图谱总长度1248．5eM，标记间平均距离为4．16cM。连锁群长度变动在39．5(LG9)～109．2cM(LGl)之间，群内平均图距在1．80--14．20cM之间，LGl2平均图距最大，LG6的平均图距最小。LGl包含的标记数最多，有56个；标记最少的连锁群(LGl7、LGl9)只有4个。在整个图谱上，存在图距大于20cM的空隙6个。2．图谱上300个标记位点的基因型分离统计结果表明，有97个位点不符合孟德尔理论分离比(P

3、2．33％；标记的分离分析发现，来源于两个亲本的标记座位在群体中分离比例接近，基本符合l：l的理论分离比，表明该图谱未出现严重的偏分离。本研究首次将SRAP及TRAP标记引入甘蓝型油菜遗传连锁图谱的构建，结果表明这两种标记在甘蓝型油菜遗传图谱的构建上是一种良好的标记系统。3．利用该图谱，通过软件WindowsQTLCartographerV2．5的复合区间作图法对所考察甘蓝型油菜的种子含油量、蛋白质含量、皮壳率、种皮色泽、种皮木质素含量、千粒重及单株产量七个性状进行QTL定位研究。取LOD临界值为2．0，共获得QTLs位点三十一个，

4、分别位于LGl、LG2、LG3、LG4、LG5、LG6、LG8、LG9、LGll、LGl5、LGl6十一个不同的连锁群上，单位点遗传贡献率3．51％～14．66％，其中贡献率大于10N的QTLs三个。三十一个QTLs的LOD值介于2．1～7．4之间。1)与蛋白质含量有关的QTLs七个，命名PrD卜一m7，位于LGl、LG4、LG8、LGll、LGl5五个不同的连锁群上，LOD值介于2．1～7．4之间，单位点解释表型变异3．51％～14．66％，其中Pr07的遗传贡献率摄大。Pr05和Pr06两个位点显示负的加性效应，其余五个位点均为

5、正加性效应。2)控制种子含油量的QTLs位点七个，命名Oill～Oil7，分布于LG2、LG5、LG6、LG8、LG9五个不同的连锁群上，LOD值介于2．2～5．6之问，单位点解释表型变异3．73％～10．46％，0i13对种子含油量的贡献率最大。七个位点中，0i14和0i15两个位点表现负加性效应，其余五个位点表现正加性效应。3)单株产量共检测到六个QTLs：Spyl～Spy6。Spyl位于LGl上，解释表型变异3．92％，LOD值21；Spy6位于LGl5上，解释表型变异4．74％，LOD值为2．5；Spy2和Spy3位于LG6

6、上，LOD值分别为2．9、3．8，单位点解释表型变异6．21％、7．56％：Spy4和Spy5位于西南大学硕士学位论文LG8上，单位点解释表型变异6．03％、6．22％，LOD值为3．2、2．3。六个QTL中，Spyl、Spy4和Spy5显示正的加性效应，Spy2、Spy3、Spy6显示负加性效应。4)与皮壳率相关的QTL位点四个，命名为Hulll，Hull2、Hull3、Hull4。Hulll和Hull2位于LG3上，解释表型变异4．89％、6．74％，LOD值2．4、2．6，表现为正的加性效应；Hull3和Hull4均位于LGl

7、5上，解释表型变异6．84％、6，56％，LOD值3．3、3．2，表现负加性效应。5)对种皮色泽进行分析共获得两个QTL位点，命名为Sccl、Scc2，分布在LGl、LGl5两个不同的连锁群上，单位点解释表型变异4．15％、8．31％，LOD值2．1、4．1。Sccl表现负加性效应。&以表现正加性效应。6)千粒重分析获得三个QTL位点，命名Weightl、We增西t2和肫据r^t3，Weightl位于LGI上，解释表型变异7．56％，加性效应为正，LOD值2．5：Weight2位于LG5上，解释表型变异4．56％，加性效应为负，LO

8、D值2．2；Weight3位于LG9上，解释表型变异13．03％，加性效应为负，LOD值4．9。7)本研究还对种皮木质素含量进行了QTL分析，检测到两个位点，命名Ligl、zi92，Ligl位于LGI上，LOD值2．5，解释表型变异7